More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2755 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3324  D-lactate dehydrogenase  50 
 
 		 973 aa  944    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6956  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  60.59 
 
 		 1007 aa  1209    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2905  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  49.28 
 
 		 995 aa  940    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2130  FAD linked oxidase domain protein  37.96 
 
 		 973 aa  650    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4574  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  51.25 
 
 		 990 aa  940    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0207313 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3858  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.73 
 
 		 978 aa  657    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.738511  hitchhiker  0.000383652 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3025  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  57.68 
 
 		 1038 aa  1181    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.473379 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1163  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  48.52 
 
 		 961 aa  899    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.25056  normal  0.360544 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3054  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  69.46 
 
 		 1032 aa  1428    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267975 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  100 
 
 		 1046 aa  2154    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.433377  normal  0.249121 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5731  D-lactate dehydrogenase / anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  51.75 
 
 		 984 aa  988    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2768  FAD linked oxidase domain protein  51.6 
 
 		 974 aa  937    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834372  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0560  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.81 
 
 		 976 aa  661    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.389138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3485  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.26 
 
 		 983 aa  973    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5632  D-lactate dehydrogenase  62.35 
 
 		 1007 aa  1253    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4256  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  60.18 
 
 		 1005 aa  1196    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0600  FAD linked oxidase domain-containing protein  64.55 
 
 		 1025 aa  1345    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2904  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  69.09 
 
 		 1025 aa  1446    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.83736  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3402  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  49.13 
 
 		 989 aa  959    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4721  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  51.86 
 
 		 990 aa  945    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00766177 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4204  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  51.06 
 
 		 990 aa  937    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0106272  normal  0.500842 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3126  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.96 
 
 		 962 aa  618  1e-175  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2375  FAD linked oxidase-like protein  37.81 
 
 		 952 aa  595  1e-168  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4649  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.3 
 
 		 1034 aa  567  1e-160  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2417  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.98 
 
 		 977 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3155  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.74 
 
 		 983 aa  555  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11033  FAD linked oxidase-like protein  33.17 
 
 		 967 aa  553  1e-156  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4692  FAD linked oxidase domain protein  33.79 
 
 		 996 aa  549  1e-155  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0507445  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4811  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.6 
 
 		 971 aa  550  1e-155  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5063  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.98 
 
 		 1009 aa  547  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0843  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.46 
 
 		 1011 aa  540  9.999999999999999e-153  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.505983 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2770  putative FAD-dependent oxidoreductase  34.62 
 
 		 999 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2125  FAD linked oxidase domain protein  36.16 
 
 		 1015 aa  542  9.999999999999999e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.93 
 
 		 999 aa  538  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3077  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.13 
 
 		 991 aa  537  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0457  FAD linked oxidase domain protein  34.01 
 
 		 1014 aa  538  1e-151  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.873167  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2438  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.18 
 
 		 1015 aa  538  1e-151  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.944739  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2129  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.98 
 
 		 968 aa  539  1e-151  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702869  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4725  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.98 
 
 		 976 aa  528  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.881602  hitchhiker  0.000909988 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2720  FAD linked oxidase-like protein  35.22 
 
 		 1024 aa  527  1e-148  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3429  oxidoreductase  32.75 
 
 		 975 aa  529  1e-148  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2547  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.56 
 
 		 1023 aa  516  1.0000000000000001e-145  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.846231  normal  0.179542 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1924  FAD linked oxidase-like  34.86 
 
 		 967 aa  512  1e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2991  FAD linked oxidase-like  34.49 
 
 		 1013 aa  512  1e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.207062 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0509  FAD linked oxidase domain protein  33.07 
 
 		 1024 aa  506  9.999999999999999e-143  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3764  FAD linked oxidase domain protein  32.28 
 
 		 1070 aa  504  1e-141  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0200676  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0810  hypothetical protein  35.43 
 
 		 1050 aa  504  1e-141  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0210  FAD linked oxidase domain protein  32.85 
 
 		 1032 aa  506  1e-141  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.23019 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2896  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.85 
 
 		 1035 aa  501  1e-140  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.228282  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0862  FAD linked oxidase domain protein  35.8 
 
 		 1050 aa  500  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.961575  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0764  FAD linked oxidase domain protein  34.41 
 
 		 987 aa  502  1e-140  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0464  hypothetical protein  33.46 
 
 		 984 aa  498  1e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1983  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.75 
 
 		 1031 aa  498  1e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0858  FAD linked oxidase domain protein  35.45 
 
 		 1052 aa  495  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2940  FAD linked oxidase domain protein  32.44 
 
 		 1055 aa  490  1e-137  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4442  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding:FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  32.03 
 
 		 966 aa  485  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1074  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.37 
 
 		 1022 aa  479  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.899734  decreased coverage  0.000498092 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1181  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.37 
 
 		 1037 aa  479  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.998854 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1400  FAD linked oxidase domain protein  32.77 
 
 		 1023 aa  477  1e-133  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0289  FAD linked oxidase domain protein  32.41 
 
 		 976 aa  479  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4859  FAD linked oxidase domain protein  32.61 
 
 		 1043 aa  469  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0821468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0626  hypothetical protein  31.94 
 
 		 930 aa  465  1e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1787  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.72 
 
 		 948 aa  456  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2179  FAD linked oxidase domain protein  33.85 
 
 		 894 aa  454  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4174  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.19 
 
 		 1000 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.57181  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08570  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  32.78 
 
 		 945 aa  449  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.695725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  32.73 
 
 		 989 aa  446  1.0000000000000001e-124  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0957  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.37 
 
 		 950 aa  444  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4130  FAD linked oxidase domain protein  32.16 
 
 		 975 aa  444  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419398  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4803  FAD linked oxidase domain protein  33.11 
 
 		 976 aa  433  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2844  putative oxidoreductase  33.69 
 
 		 949 aa  428  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.788098  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2117  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.67 
 
 		 973 aa  420  1e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.715118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0725  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.07 
 
 		 906 aa  419  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2165  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.22 
 
 		 944 aa  416  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1756  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.84 
 
 		 1028 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.411598  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0962  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.59 
 
 		 1006 aa  405  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.108577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32250  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  31.87 
 
 		 974 aa  404  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1470  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.94 
 
 		 997 aa  405  1e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.271002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0369  FAD linked oxidase domain protein  29.65 
 
 		 1002 aa  406  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0686  FAD linked oxidase domain protein  30.64 
 
 		 985 aa  403  9.999999999999999e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17651  normal  0.98502 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0362  FAD linked oxidase domain protein  29.48 
 
 		 1006 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0728  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.95 
 
 		 995 aa  399  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5581  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.57 
 
 		 1050 aa  394  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136848  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0601  FAD linked oxidase domain protein  31.3 
 
 		 997 aa  395  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431766  normal  0.0923771 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3016  FAD linked oxidase domain protein  30.9 
 
 		 1010 aa  386  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.17034  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4075  FAD linked oxidase domain protein  32.15 
 
 		 993 aa  384  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2011  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.36 
 
 		 947 aa  380  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00715823  decreased coverage  0.00037047 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3570  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.61 
 
 		 1027 aa  378  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.824304  normal  0.375577 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0287  ferredoxin, 4Fe-4S  49.15 
 
 		 420 aa  376  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0150  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.65 
 
 		 977 aa  371  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5319  FAD linked oxidase domain protein  28.8 
 
 		 1012 aa  363  6e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2718  FAD linked oxidase-like  30.36 
 
 		 1010 aa  358  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.400601 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1944  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.67 
 
 		 1018 aa  357  6.999999999999999e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150005 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1955  FAD linked oxidase domain protein  28.57 
 
 		 1018 aa  355  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.181771  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1888  oxidoreductase, FAD-binding  28.57 
 
 		 1018 aa  354  5.9999999999999994e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01656  predicted FAD-linked oxidoreductase  28.48 
 
 		 1018 aa  353  7e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01645  hypothetical protein  28.48 
 
 		 1018 aa  353  7e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1768  oxidoreductase, FAD-binding  28.48 
 
 		 1018 aa  353  7e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1903  oxidoreductase, FAD-binding  28.48 
 
 		 1018 aa  353  1e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.610317  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2402  oxidoreductase, FAD-binding  28.38 
 
 		 1018 aa  352  2e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0186702 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>