More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5632 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0600  FAD linked oxidase domain-containing protein  59.55 
 
 		 1025 aa  1207    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3858  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.62 
 
 		 978 aa  693    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.738511  hitchhiker  0.000383652 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6956  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  72.57 
 
 		 1007 aa  1476    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4256  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  71.41 
 
 		 1005 aa  1446    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3054  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  64.53 
 
 		 1032 aa  1264    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267975 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0560  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.87 
 
 		 976 aa  701    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.389138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4204  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  55.51 
 
 		 990 aa  1003    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0106272  normal  0.500842 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5731  D-lactate dehydrogenase / anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  56.52 
 
 		 984 aa  1050    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3025  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  67.63 
 
 		 1038 aa  1404    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.473379 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2130  FAD linked oxidase domain protein  41.31 
 
 		 973 aa  678    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3324  D-lactate dehydrogenase  54.67 
 
 		 973 aa  1024    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1163  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  53.33 
 
 		 961 aa  996    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.25056  normal  0.360544 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  62.35 
 
 		 1046 aa  1253    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.433377  normal  0.249121 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5632  D-lactate dehydrogenase  100 
 
 		 1007 aa  2061    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3126  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.84 
 
 		 962 aa  639    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2768  FAD linked oxidase domain protein  55.81 
 
 		 974 aa  989    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834372  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4574  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  55.92 
 
 		 990 aa  1012    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0207313 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3485  FAD linked oxidase domain-containing protein  57.03 
 
 		 983 aa  1032    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2904  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  64.89 
 
 		 1025 aa  1267    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.83736  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2905  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  55.02 
 
 		 995 aa  1014    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4721  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  56.22 
 
 		 990 aa  1020    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00766177 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3402  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  55.13 
 
 		 989 aa  1045    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2375  FAD linked oxidase-like protein  41.22 
 
 		 952 aa  631  1e-179  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4649  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.47 
 
 		 1034 aa  598  1e-169  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2417  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.83 
 
 		 977 aa  598  1e-169  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3077  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.61 
 
 		 991 aa  585  1.0000000000000001e-165  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4725  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.46 
 
 		 976 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.881602  hitchhiker  0.000909988 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2720  FAD linked oxidase-like protein  37.87 
 
 		 1024 aa  578  1.0000000000000001e-163  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5063  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.55 
 
 		 1009 aa  573  1.0000000000000001e-162  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0457  FAD linked oxidase domain protein  37.06 
 
 		 1014 aa  560  1e-158  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.873167  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3155  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.57 
 
 		 983 aa  559  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4811  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.86 
 
 		 971 aa  558  1e-157  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0843  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.22 
 
 		 1011 aa  556  1e-156  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.505983 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2129  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.27 
 
 		 968 aa  551  1e-155  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702869  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2770  putative FAD-dependent oxidoreductase  35.56 
 
 		 999 aa  551  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2547  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.3 
 
 		 1023 aa  549  1e-155  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.846231  normal  0.179542 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1924  FAD linked oxidase-like  36.73 
 
 		 967 aa  547  1e-154  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3764  FAD linked oxidase domain protein  35.5 
 
 		 1070 aa  546  1e-154  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0200676  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11033  FAD linked oxidase-like protein  32.63 
 
 		 967 aa  547  1e-154  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.5 
 
 		 999 aa  549  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2438  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.7 
 
 		 1015 aa  545  1e-153  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.944739  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3429  oxidoreductase  33.23 
 
 		 975 aa  543  1e-153  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2125  FAD linked oxidase domain protein  37.13 
 
 		 1015 aa  545  1e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0464  hypothetical protein  35.11 
 
 		 984 aa  538  1e-151  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2940  FAD linked oxidase domain protein  35.39 
 
 		 1055 aa  536  1e-151  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0509  FAD linked oxidase domain protein  35.74 
 
 		 1024 aa  534  1e-150  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0210  FAD linked oxidase domain protein  35.15 
 
 		 1032 aa  535  1e-150  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.23019 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2991  FAD linked oxidase-like  35.32 
 
 		 1013 aa  531  1e-149  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.207062 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1400  FAD linked oxidase domain protein  35.1 
 
 		 1023 aa  530  1e-149  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0764  FAD linked oxidase domain protein  36.36 
 
 		 987 aa  529  1e-148  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2896  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.96 
 
 		 1035 aa  526  1e-148  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.228282  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4692  FAD linked oxidase domain protein  35.05 
 
 		 996 aa  524  1e-147  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0507445  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1181  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.49 
 
 		 1037 aa  522  1e-146  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.998854 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1074  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.75 
 
 		 1022 aa  519  1.0000000000000001e-145  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.899734  decreased coverage  0.000498092 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1983  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.06 
 
 		 1031 aa  506  9.999999999999999e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0626  hypothetical protein  33.27 
 
 		 930 aa  503  1e-141  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4442  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding:FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  35.13 
 
 		 966 aa  502  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0289  FAD linked oxidase domain protein  34.95 
 
 		 976 aa  499  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0810  hypothetical protein  36.67 
 
 		 1050 aa  498  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0862  FAD linked oxidase domain protein  36.57 
 
 		 1050 aa  491  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.961575  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1787  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.69 
 
 		 948 aa  491  1e-137  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0858  FAD linked oxidase domain protein  36.2 
 
 		 1052 aa  489  1e-137  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4859  FAD linked oxidase domain protein  34.92 
 
 		 1043 aa  486  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0821468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0957  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.26 
 
 		 950 aa  479  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  34.51 
 
 		 989 aa  472  1.0000000000000001e-131  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4174  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.93 
 
 		 1000 aa  473  1.0000000000000001e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.57181  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08570  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  34.11 
 
 		 945 aa  462  9.999999999999999e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.695725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2179  FAD linked oxidase domain protein  35.97 
 
 		 894 aa  457  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4130  FAD linked oxidase domain protein  34.74 
 
 		 975 aa  457  1e-127  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419398  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2117  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.53 
 
 		 973 aa  458  1e-127  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.715118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4803  FAD linked oxidase domain protein  33.84 
 
 		 976 aa  442  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0962  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.19 
 
 		 1006 aa  431  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.108577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2844  putative oxidoreductase  32.97 
 
 		 949 aa  427  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.788098  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32250  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  33.1 
 
 		 974 aa  427  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2165  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.35 
 
 		 944 aa  428  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3016  FAD linked oxidase domain protein  32.99 
 
 		 1010 aa  421  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.17034  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0287  ferredoxin, 4Fe-4S  53.79 
 
 		 420 aa  421  1e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1756  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.1 
 
 		 1028 aa  418  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.411598  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0725  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.84 
 
 		 906 aa  419  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1470  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.88 
 
 		 997 aa  416  1e-114  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.271002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0362  FAD linked oxidase domain protein  29.58 
 
 		 1006 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0369  FAD linked oxidase domain protein  29.38 
 
 		 1002 aa  409  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0601  FAD linked oxidase domain protein  31.93 
 
 		 997 aa  409  1.0000000000000001e-112  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431766  normal  0.0923771 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0686  FAD linked oxidase domain protein  32.97 
 
 		 985 aa  408  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17651  normal  0.98502 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0728  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.82 
 
 		 995 aa  397  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5581  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.31 
 
 		 1050 aa  396  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2011  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.52 
 
 		 947 aa  383  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00715823  decreased coverage  0.00037047 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5319  FAD linked oxidase domain protein  29.58 
 
 		 1012 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0150  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.45 
 
 		 977 aa  365  2e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4075  FAD linked oxidase domain protein  31.96 
 
 		 993 aa  363  1e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0072  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.7 
 
 		 446 aa  355  2.9999999999999997e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.49786 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2161  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.01 
 
 		 1024 aa  352  2e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.126356 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2371  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.27 
 
 		 1024 aa  351  4e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.475276  normal  0.254542 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1746  FAD linked oxidase-like  28.7 
 
 		 1013 aa  351  5e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3570  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.69 
 
 		 1027 aa  350  6e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.824304  normal  0.375577 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3281  FAD linked oxidase-like  29.18 
 
 		 1009 aa  347  4e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.539054  normal  0.121942 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1044  hypothetical protein  26.39 
 
 		 1031 aa  348  4e-94  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2316  FAD linked oxidase-like protein  30.39 
 
 		 1091 aa  347  8e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0331253  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2720  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.05 
 
 		 491 aa  345  2e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.107031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2060  FAD linked oxidase  31.35 
 
 		 978 aa  345  2e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.717631  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>