More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1470 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_0858  FAD linked oxidase domain protein  44.14 
 
 
1052 aa  669    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08570  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  46.3 
 
 
945 aa  738    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.695725  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0728  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  55.32 
 
 
995 aa  797    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5581  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  53.72 
 
 
1050 aa  893    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136848  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2844  putative oxidoreductase  45.14 
 
 
949 aa  736    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.788098  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0464  hypothetical protein  39.39 
 
 
984 aa  674    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0862  FAD linked oxidase domain protein  43.83 
 
 
1050 aa  662    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.961575  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1074  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.01 
 
 
1022 aa  726    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.899734  decreased coverage  0.000498092 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1787  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  52.91 
 
 
948 aa  883    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  51.75 
 
 
989 aa  868    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4075  FAD linked oxidase domain protein  43.81 
 
 
993 aa  691    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4803  FAD linked oxidase domain protein  47.85 
 
 
976 aa  779    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4130  FAD linked oxidase domain protein  50.26 
 
 
975 aa  871    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419398  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0810  hypothetical protein  43.83 
 
 
1050 aa  674    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0601  FAD linked oxidase domain protein  55.38 
 
 
997 aa  963    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431766  normal  0.0923771 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0962  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  55 
 
 
1006 aa  957    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.108577  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1983  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.96 
 
 
1031 aa  681    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0764  FAD linked oxidase domain protein  47.02 
 
 
987 aa  761    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2991  FAD linked oxidase-like  38.81 
 
 
1013 aa  637    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.207062 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2720  FAD linked oxidase-like protein  42.48 
 
 
1024 aa  690    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32250  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  54.91 
 
 
974 aa  973    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1181  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.16 
 
 
1037 aa  739    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.998854 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3016  FAD linked oxidase domain protein  51.37 
 
 
1010 aa  922    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.17034  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2011  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  52.2 
 
 
947 aa  839    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00715823  decreased coverage  0.00037047 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2117  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  55.03 
 
 
973 aa  994    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.715118  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2125  FAD linked oxidase domain protein  41.05 
 
 
1015 aa  694    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0686  FAD linked oxidase domain protein  55.58 
 
 
985 aa  928    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17651  normal  0.98502 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2165  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.07 
 
 
944 aa  868    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2179  FAD linked oxidase domain protein  46.6 
 
 
894 aa  664    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1756  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.42 
 
 
1028 aa  690    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.411598  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4859  FAD linked oxidase domain protein  42.06 
 
 
1043 aa  671    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0821468  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0289  FAD linked oxidase domain protein  39.42 
 
 
976 aa  667    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1470  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 
997 aa  1963    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.271002  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0957  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.46 
 
 
950 aa  882    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0725  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.47 
 
 
906 aa  807    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4174  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.93 
 
 
1000 aa  676    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.57181  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0150  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.7 
 
 
977 aa  632  1e-179  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4442  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding:FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  38.51 
 
 
966 aa  612  9.999999999999999e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2770  putative FAD-dependent oxidoreductase  37.88 
 
 
999 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.99 
 
 
999 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3858  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.08 
 
 
978 aa  519  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.738511  hitchhiker  0.000383652 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0560  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.49 
 
 
976 aa  503  1e-141  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.389138  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2375  FAD linked oxidase-like protein  37.04 
 
 
952 aa  473  1e-132  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2130  FAD linked oxidase domain protein  35.01 
 
 
973 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3126  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.76 
 
 
962 aa  464  1e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0509  FAD linked oxidase domain protein  33.5 
 
 
1024 aa  449  1e-125  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2940  FAD linked oxidase domain protein  32.81 
 
 
1055 aa  447  1.0000000000000001e-124  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1163  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.61 
 
 
961 aa  445  1e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.25056  normal  0.360544 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3077  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.43 
 
 
991 aa  442  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6956  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.34 
 
 
1007 aa  437  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3764  FAD linked oxidase domain protein  33.14 
 
 
1070 aa  439  1e-121  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0200676  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3025  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.3 
 
 
1038 aa  436  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.473379 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4256  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.78 
 
 
1005 aa  432  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2896  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.9 
 
 
1035 aa  427  1e-118  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.228282  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2904  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.53 
 
 
1025 aa  428  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.83736  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4692  FAD linked oxidase domain protein  32.16 
 
 
996 aa  423  1e-117  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0507445  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0600  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.42 
 
 
1025 aa  424  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0457  FAD linked oxidase domain protein  33.7 
 
 
1014 aa  426  1e-117  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.873167  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5632  D-lactate dehydrogenase  32.91 
 
 
1007 aa  425  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3429  oxidoreductase  29.25 
 
 
975 aa  423  1e-117  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5731  D-lactate dehydrogenase / anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  34.11 
 
 
984 aa  421  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4811  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.93 
 
 
971 aa  422  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11033  FAD linked oxidase-like protein  29.79 
 
 
967 aa  420  1e-116  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3402  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.3 
 
 
989 aa  421  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2905  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.88 
 
 
995 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129344  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3054  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.67 
 
 
1032 aa  417  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.267975 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2438  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.56 
 
 
1015 aa  414  1e-114  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.944739  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32 
 
 
1046 aa  415  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.433377  normal  0.249121 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4725  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.12 
 
 
976 aa  411  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.881602  hitchhiker  0.000909988 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2417  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.03 
 
 
977 aa  412  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4721  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.25 
 
 
990 aa  412  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00766177 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4204  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.77 
 
 
990 aa  413  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0106272  normal  0.500842 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4574  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.77 
 
 
990 aa  410  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0207313 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3485  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.24 
 
 
983 aa  409  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5063  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.9 
 
 
1009 aa  408  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424632  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3324  D-lactate dehydrogenase  32.72 
 
 
973 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2547  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.73 
 
 
1023 aa  405  1e-111  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.846231  normal  0.179542 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2129  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.09 
 
 
968 aa  404  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702869  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0843  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.77 
 
 
1011 aa  404  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.505983 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3155  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.36 
 
 
983 aa  400  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1924  FAD linked oxidase-like  33.37 
 
 
967 aa  398  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2768  FAD linked oxidase domain protein  34.18 
 
 
974 aa  389  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834372  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0210  FAD linked oxidase domain protein  30.95 
 
 
1032 aa  385  1e-105  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.23019 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0626  hypothetical protein  29.9 
 
 
930 aa  385  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1400  FAD linked oxidase domain protein  31.6 
 
 
1023 aa  372  1e-101  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4649  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.04 
 
 
1034 aa  356  1e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2533  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  29.22 
 
 
1015 aa  319  2e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2805  oxidoreductase, FAD-binding, putative  28.22 
 
 
1015 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0369  FAD linked oxidase domain protein  25.9 
 
 
1002 aa  315  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0362  FAD linked oxidase domain protein  25.35 
 
 
1006 aa  316  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3570  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.5 
 
 
1027 aa  313  6.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.824304  normal  0.375577 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3782  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.54 
 
 
1005 aa  313  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000105727 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1604  hypothetical protein  25.18 
 
 
966 aa  306  1.0000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1044  hypothetical protein  24.93 
 
 
1031 aa  306  1.0000000000000001e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5785  FAD linked oxidase-like  28.2 
 
 
1018 aa  306  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6150  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.2 
 
 
1018 aa  306  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1419  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.21 
 
 
1006 aa  303  8.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.184545  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3999  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.93 
 
 
1006 aa  303  1e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00316797 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4493  FAD linked oxidase domain protein  28.32 
 
 
1006 aa  302  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6630  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.11 
 
 
1018 aa  300  6e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>