More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5731 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_4721  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  55.13 
 
 
990 aa  999    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00766177 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2905  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  54.73 
 
 
995 aa  994    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129344  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0600  FAD linked oxidase domain-containing protein  51.71 
 
 
1025 aa  998    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3402  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  65.2 
 
 
989 aa  1308    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3858  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.1 
 
 
978 aa  693    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.738511  hitchhiker  0.000383652 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4256  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  54.16 
 
 
1005 aa  1025    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3025  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  53.44 
 
 
1038 aa  1022    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.473379 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2768  FAD linked oxidase domain protein  54.85 
 
 
974 aa  966    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834372  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2130  FAD linked oxidase domain protein  41 
 
 
973 aa  684    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3324  D-lactate dehydrogenase  62.78 
 
 
973 aa  1222    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1163  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  62.37 
 
 
961 aa  1217    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.25056  normal  0.360544 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  51.75 
 
 
1046 aa  988    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.433377  normal  0.249121 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3485  FAD linked oxidase domain-containing protein  56.28 
 
 
983 aa  994    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6956  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  56.18 
 
 
1007 aa  1061    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5632  D-lactate dehydrogenase  56.52 
 
 
1007 aa  1050    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2375  FAD linked oxidase-like protein  42.61 
 
 
952 aa  640    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3054  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  52.77 
 
 
1032 aa  978    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.267975 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2904  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  53.42 
 
 
1025 aa  984    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.83736  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4204  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  55.24 
 
 
990 aa  996    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0106272  normal  0.500842 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0560  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.19 
 
 
976 aa  697    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.389138  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5731  D-lactate dehydrogenase / anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  100 
 
 
984 aa  2009    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4574  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  54.93 
 
 
990 aa  997    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0207313 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3126  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.95 
 
 
962 aa  625  1e-177  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4811  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.9 
 
 
971 aa  602  1e-170  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0843  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.08 
 
 
1011 aa  599  1e-170  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.505983 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2417  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.16 
 
 
977 aa  596  1e-169  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11033  FAD linked oxidase-like protein  35.4 
 
 
967 aa  590  1e-167  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3077  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.18 
 
 
991 aa  570  1e-161  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5063  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.08 
 
 
1009 aa  570  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424632  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4725  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.06 
 
 
976 aa  566  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.881602  hitchhiker  0.000909988 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2129  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.22 
 
 
968 aa  565  1.0000000000000001e-159  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702869  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0457  FAD linked oxidase domain protein  37.24 
 
 
1014 aa  562  1e-158  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.873167  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4649  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.07 
 
 
1034 aa  560  1e-158  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3429  oxidoreductase  35.05 
 
 
975 aa  562  1e-158  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2720  FAD linked oxidase-like protein  35.49 
 
 
1024 aa  556  1e-157  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.92 
 
 
999 aa  558  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3155  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.36 
 
 
983 aa  558  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2438  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.6 
 
 
1015 aa  553  1e-156  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.944739  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2770  putative FAD-dependent oxidoreductase  35.95 
 
 
999 aa  552  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1924  FAD linked oxidase-like  37.68 
 
 
967 aa  549  1e-154  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0210  FAD linked oxidase domain protein  36.03 
 
 
1032 aa  540  9.999999999999999e-153  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.23019 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3764  FAD linked oxidase domain protein  35.28 
 
 
1070 aa  539  1e-151  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0200676  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4692  FAD linked oxidase domain protein  35.83 
 
 
996 aa  536  1e-151  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0507445  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2991  FAD linked oxidase-like  35.51 
 
 
1013 aa  533  1e-150  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.207062 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0289  FAD linked oxidase domain protein  34.8 
 
 
976 aa  531  1e-149  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2940  FAD linked oxidase domain protein  34.62 
 
 
1055 aa  525  1e-147  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2896  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.65 
 
 
1035 aa  523  1e-147  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.228282  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2125  FAD linked oxidase domain protein  35.26 
 
 
1015 aa  520  1e-146  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0509  FAD linked oxidase domain protein  34.43 
 
 
1024 aa  521  1e-146  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0464  hypothetical protein  35.56 
 
 
984 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1400  FAD linked oxidase domain protein  34.94 
 
 
1023 aa  518  1.0000000000000001e-145  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2547  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.66 
 
 
1023 aa  516  1.0000000000000001e-145  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.846231  normal  0.179542 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0626  hypothetical protein  34.48 
 
 
930 aa  515  1e-144  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1074  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.93 
 
 
1022 aa  515  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.899734  decreased coverage  0.000498092 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0764  FAD linked oxidase domain protein  35.05 
 
 
987 aa  503  1e-141  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4859  FAD linked oxidase domain protein  35.4 
 
 
1043 aa  505  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0821468  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1181  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.95 
 
 
1037 aa  504  1e-141  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.998854 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1983  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.86 
 
 
1031 aa  500  1e-140  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4442  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding:FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  33.91 
 
 
966 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  36.69 
 
 
989 aa  493  9.999999999999999e-139  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0810  hypothetical protein  35.97 
 
 
1050 aa  491  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1787  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.89 
 
 
948 aa  491  1e-137  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0862  FAD linked oxidase domain protein  35.69 
 
 
1050 aa  489  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.961575  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0858  FAD linked oxidase domain protein  35.42 
 
 
1052 aa  484  1e-135  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4174  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.61 
 
 
1000 aa  484  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.57181  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0957  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.42 
 
 
950 aa  484  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4803  FAD linked oxidase domain protein  36.01 
 
 
976 aa  481  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32250  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  35.46 
 
 
974 aa  482  1e-134  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2117  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.77 
 
 
973 aa  476  1e-132  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.715118  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2179  FAD linked oxidase domain protein  36.6 
 
 
894 aa  473  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3016  FAD linked oxidase domain protein  35.03 
 
 
1010 aa  463  1e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.17034  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4130  FAD linked oxidase domain protein  34.34 
 
 
975 aa  459  9.999999999999999e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419398  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2165  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.55 
 
 
944 aa  459  1e-127  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08570  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  33.8 
 
 
945 aa  450  1e-125  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.695725  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0601  FAD linked oxidase domain protein  34.92 
 
 
997 aa  443  9.999999999999999e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431766  normal  0.0923771 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0725  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.7 
 
 
906 aa  442  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2844  putative oxidoreductase  34.12 
 
 
949 aa  429  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.788098  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0728  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.42 
 
 
995 aa  431  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1756  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.45 
 
 
1028 aa  431  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.411598  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0686  FAD linked oxidase domain protein  33.6 
 
 
985 aa  429  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17651  normal  0.98502 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0369  FAD linked oxidase domain protein  29.53 
 
 
1002 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0362  FAD linked oxidase domain protein  29.63 
 
 
1006 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5581  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.53 
 
 
1050 aa  420  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136848  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1470  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.15 
 
 
997 aa  414  1e-114  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.271002  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2011  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.24 
 
 
947 aa  400  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00715823  decreased coverage  0.00037047 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0150  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.88 
 
 
977 aa  397  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0287  ferredoxin, 4Fe-4S  51.77 
 
 
420 aa  393  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1944  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.59 
 
 
1018 aa  374  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000150005 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01656  predicted FAD-linked oxidoreductase  29.33 
 
 
1018 aa  371  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1768  oxidoreductase, FAD-binding  29.33 
 
 
1018 aa  371  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4075  FAD linked oxidase domain protein  31.97 
 
 
993 aa  372  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01645  hypothetical protein  29.33 
 
 
1018 aa  371  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1955  FAD linked oxidase domain protein  29.24 
 
 
1018 aa  367  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.181771  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1903  oxidoreductase, FAD-binding  29.14 
 
 
1018 aa  369  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.610317  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2718  FAD linked oxidase-like  30.21 
 
 
1010 aa  370  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.400601 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1509  oxidoreductase, FAD-binding  29.14 
 
 
1018 aa  366  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.784999  hitchhiker  0.0000155929 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6081  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.71 
 
 
1023 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2402  oxidoreductase, FAD-binding  29.14 
 
 
1018 aa  366  1e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0186702 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1888  oxidoreductase, FAD-binding  29.24 
 
 
1018 aa  365  2e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2371  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.23 
 
 
1024 aa  364  4e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.475276  normal  0.254542 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>