More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0843 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1924  FAD linked oxidase-like  42.49 
 
 
967 aa  750    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3858  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.02 
 
 
978 aa  712    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.738511  hitchhiker  0.000383652 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2129  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  46.39 
 
 
968 aa  938    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702869  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4725  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  54.48 
 
 
976 aa  1130    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.881602  hitchhiker  0.000909988 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0626  hypothetical protein  36.78 
 
 
930 aa  644    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0560  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.93 
 
 
976 aa  688    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.389138  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5063  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  53.59 
 
 
1009 aa  1065    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424632  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3429  oxidoreductase  50.99 
 
 
975 aa  1052    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4811  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  47.13 
 
 
971 aa  973    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11033  FAD linked oxidase-like protein  47.6 
 
 
967 aa  961    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2130  FAD linked oxidase domain protein  40.61 
 
 
973 aa  666    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4649  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  52.65 
 
 
1034 aa  1065    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2417  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  54.09 
 
 
977 aa  1104    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0843  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 
1011 aa  2057    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.505983 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3155  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  51.82 
 
 
983 aa  1040    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3077  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  51.61 
 
 
991 aa  1076    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3126  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.04 
 
 
962 aa  604  1.0000000000000001e-171  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5731  D-lactate dehydrogenase / anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  40.08 
 
 
984 aa  599  1e-170  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6956  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.85 
 
 
1007 aa  597  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1163  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.59 
 
 
961 aa  597  1e-169  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.25056  normal  0.360544 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3025  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.81 
 
 
1038 aa  592  1e-167  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.473379 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2375  FAD linked oxidase-like protein  39.44 
 
 
952 aa  592  1e-167  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3324  D-lactate dehydrogenase  37.04 
 
 
973 aa  570  1e-161  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3402  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.95 
 
 
989 aa  568  1e-160  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0457  FAD linked oxidase domain protein  37.41 
 
 
1014 aa  563  1.0000000000000001e-159  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.873167  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0600  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.53 
 
 
1025 aa  566  1.0000000000000001e-159  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2904  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.1 
 
 
1025 aa  561  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.83736  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5632  D-lactate dehydrogenase  36.22 
 
 
1007 aa  556  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4692  FAD linked oxidase domain protein  35.69 
 
 
996 aa  552  1e-156  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0507445  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4256  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.57 
 
 
1005 aa  554  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4721  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.61 
 
 
990 aa  546  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00766177 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4204  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.2 
 
 
990 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0106272  normal  0.500842 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4574  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.27 
 
 
990 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0207313 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.46 
 
 
1046 aa  540  9.999999999999999e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.433377  normal  0.249121 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0509  FAD linked oxidase domain protein  34.58 
 
 
1024 aa  538  1e-151  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3054  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.05 
 
 
1032 aa  534  1e-150  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.267975 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2905  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.71 
 
 
995 aa  532  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129344  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2438  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.72 
 
 
1015 aa  532  1e-149  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.944739  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2896  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.33 
 
 
1035 aa  528  1e-148  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.228282  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2768  FAD linked oxidase domain protein  37.33 
 
 
974 aa  525  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834372  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3485  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.7 
 
 
983 aa  522  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2547  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.73 
 
 
1023 aa  517  1.0000000000000001e-145  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.846231  normal  0.179542 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.37 
 
 
999 aa  516  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2720  FAD linked oxidase-like protein  34.95 
 
 
1024 aa  511  1e-143  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0464  hypothetical protein  32.94 
 
 
984 aa  508  9.999999999999999e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2940  FAD linked oxidase domain protein  34.19 
 
 
1055 aa  503  1e-141  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0210  FAD linked oxidase domain protein  34.28 
 
 
1032 aa  502  1e-140  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.23019 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2991  FAD linked oxidase-like  34.32 
 
 
1013 aa  501  1e-140  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.207062 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3764  FAD linked oxidase domain protein  33.55 
 
 
1070 aa  498  1e-139  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0200676  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2770  putative FAD-dependent oxidoreductase  33.73 
 
 
999 aa  498  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2125  FAD linked oxidase domain protein  33.92 
 
 
1015 aa  491  1e-137  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1983  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.09 
 
 
1031 aa  487  1e-136  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0810  hypothetical protein  35.35 
 
 
1050 aa  481  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0858  FAD linked oxidase domain protein  35.67 
 
 
1052 aa  474  1e-132  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08570  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  34.31 
 
 
945 aa  473  1e-132  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.695725  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0862  FAD linked oxidase domain protein  35.64 
 
 
1050 aa  475  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.961575  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0289  FAD linked oxidase domain protein  32.76 
 
 
976 aa  462  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0764  FAD linked oxidase domain protein  34.56 
 
 
987 aa  456  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1400  FAD linked oxidase domain protein  32.13 
 
 
1023 aa  456  1.0000000000000001e-126  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1181  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.78 
 
 
1037 aa  451  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.998854 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4442  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding:FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  32.12 
 
 
966 aa  450  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4859  FAD linked oxidase domain protein  33.63 
 
 
1043 aa  452  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0821468  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1074  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.74 
 
 
1022 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.899734  decreased coverage  0.000498092 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2117  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.75 
 
 
973 aa  448  1.0000000000000001e-124  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.715118  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0362  FAD linked oxidase domain protein  29.74 
 
 
1006 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0369  FAD linked oxidase domain protein  29.89 
 
 
1002 aa  442  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4803  FAD linked oxidase domain protein  33.73 
 
 
976 aa  442  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4174  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.79 
 
 
1000 aa  436  1e-121  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.57181  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1787  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.58 
 
 
948 aa  430  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0957  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.3 
 
 
950 aa  429  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  33.67 
 
 
989 aa  428  1e-118  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3570  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.43 
 
 
1027 aa  422  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.824304  normal  0.375577 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01656  predicted FAD-linked oxidoreductase  30.27 
 
 
1018 aa  413  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1903  oxidoreductase, FAD-binding  30.37 
 
 
1018 aa  414  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.610317  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1477  FAD linked oxidase domain protein  30.7 
 
 
1018 aa  415  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000065688 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1944  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.27 
 
 
1018 aa  413  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000150005 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32250  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  31.16 
 
 
974 aa  413  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1768  oxidoreductase, FAD-binding  30.27 
 
 
1018 aa  413  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01645  hypothetical protein  30.27 
 
 
1018 aa  413  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1955  FAD linked oxidase domain protein  30.14 
 
 
1018 aa  410  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.181771  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1747  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.98 
 
 
1018 aa  412  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186842 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003726  Fe-S oxidoreductase  29.72 
 
 
1011 aa  412  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000740961  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1461  FAD linked oxidase domain protein  30.61 
 
 
1018 aa  412  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.236754 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1496  FAD linked oxidase  30.61 
 
 
1018 aa  412  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.237885  hitchhiker  0.00132557 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2402  oxidoreductase, FAD-binding  30.14 
 
 
1018 aa  410  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0186702 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1978  FAD linked oxidase  30.61 
 
 
1018 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000994047 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1807  FAD linked oxidase  30.42 
 
 
1018 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.354547  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0686  FAD linked oxidase domain protein  32.84 
 
 
985 aa  409  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17651  normal  0.98502 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1888  oxidoreductase, FAD-binding  30.14 
 
 
1018 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1509  oxidoreductase, FAD-binding  30.09 
 
 
1018 aa  409  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.784999  hitchhiker  0.0000155929 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4130  FAD linked oxidase domain protein  32.83 
 
 
975 aa  405  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419398  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2176  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.3 
 
 
1018 aa  405  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0114816 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1659  FAD linked oxidase domain protein  31.06 
 
 
1021 aa  400  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.370272  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1691  FAD linked oxidase domain protein  31.34 
 
 
1019 aa  403  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.572774  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1746  FAD linked oxidase-like  29.1 
 
 
1013 aa  399  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2296  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.95 
 
 
1023 aa  397  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0728  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.23 
 
 
995 aa  398  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1470  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.77 
 
 
997 aa  399  1e-109  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.271002  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3782  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.01 
 
 
1005 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000105727 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2453  FAD linked oxidase domain protein  30.24 
 
 
1017 aa  393  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.999389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>