More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1756 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4803  FAD linked oxidase domain protein  42.3 
 
 
976 aa  726    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0686  FAD linked oxidase domain protein  43.56 
 
 
985 aa  700    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17651  normal  0.98502 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2179  FAD linked oxidase domain protein  42.86 
 
 
894 aa  636    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2165  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.13 
 
 
944 aa  729    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.33 
 
 
999 aa  636    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0862  FAD linked oxidase domain protein  41.37 
 
 
1050 aa  659    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.961575  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08570  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  42.99 
 
 
945 aa  736    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.695725  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0601  FAD linked oxidase domain protein  44.49 
 
 
997 aa  712    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431766  normal  0.0923771 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0858  FAD linked oxidase domain protein  40.95 
 
 
1052 aa  648    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5581  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  44.14 
 
 
1050 aa  711    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136848  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2844  putative oxidoreductase  43.18 
 
 
949 aa  716    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.788098  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  44.21 
 
 
989 aa  748    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0464  hypothetical protein  38.29 
 
 
984 aa  644    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0728  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  46.28 
 
 
995 aa  650    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4130  FAD linked oxidase domain protein  46.2 
 
 
975 aa  764    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419398  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2125  FAD linked oxidase domain protein  38.98 
 
 
1015 aa  666    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0957  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.63 
 
 
950 aa  745    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0810  hypothetical protein  41.92 
 
 
1050 aa  670    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0962  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  45.35 
 
 
1006 aa  765    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.108577  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4859  FAD linked oxidase domain protein  40.02 
 
 
1043 aa  679    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0821468  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1074  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.4 
 
 
1022 aa  681    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.899734  decreased coverage  0.000498092 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2770  putative FAD-dependent oxidoreductase  38.24 
 
 
999 aa  637    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3016  FAD linked oxidase domain protein  43.25 
 
 
1010 aa  731    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.17034  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2991  FAD linked oxidase-like  39.57 
 
 
1013 aa  669    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.207062 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1787  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  46.23 
 
 
948 aa  735    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2720  FAD linked oxidase-like protein  40.5 
 
 
1024 aa  668    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2011  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  46.29 
 
 
947 aa  763    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00715823  decreased coverage  0.00037047 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2117  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  44.75 
 
 
973 aa  757    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.715118  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1756  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 
1028 aa  2093    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.411598  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32250  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  46.26 
 
 
974 aa  766    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4075  FAD linked oxidase domain protein  59.09 
 
 
993 aa  1134    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1470  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.42 
 
 
997 aa  686    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.271002  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1181  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.82 
 
 
1037 aa  691    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.998854 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0764  FAD linked oxidase domain protein  43.17 
 
 
987 aa  751    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0150  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  54.48 
 
 
977 aa  1025    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4442  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding:FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  38.27 
 
 
966 aa  634  1e-180  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0725  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.38 
 
 
906 aa  634  1e-180  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0289  FAD linked oxidase domain protein  37.34 
 
 
976 aa  628  1e-178  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1983  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.53 
 
 
1031 aa  627  1e-178  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4174  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.44 
 
 
1000 aa  610  1e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.57181  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3858  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.84 
 
 
978 aa  483  1e-134  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.738511  hitchhiker  0.000383652 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0560  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.7 
 
 
976 aa  457  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.389138  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5063  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.15 
 
 
1009 aa  451  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424632  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4256  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.19 
 
 
1005 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4204  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.59 
 
 
990 aa  444  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0106272  normal  0.500842 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4721  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.47 
 
 
990 aa  445  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00766177 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2417  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.04 
 
 
977 aa  443  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3485  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.98 
 
 
983 aa  444  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4574  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.76 
 
 
990 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0207313 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4692  FAD linked oxidase domain protein  31.91 
 
 
996 aa  437  1e-121  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0507445  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3402  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.27 
 
 
989 aa  439  1e-121  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2905  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.57 
 
 
995 aa  439  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129344  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2130  FAD linked oxidase domain protein  31.78 
 
 
973 aa  434  1e-120  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3077  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.23 
 
 
991 aa  436  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5731  D-lactate dehydrogenase / anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  32.45 
 
 
984 aa  433  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4725  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.41 
 
 
976 aa  432  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.881602  hitchhiker  0.000909988 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6956  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.57 
 
 
1007 aa  432  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2896  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.2 
 
 
1035 aa  425  1e-117  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.228282  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0600  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.65 
 
 
1025 aa  424  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0457  FAD linked oxidase domain protein  31.45 
 
 
1014 aa  421  1e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.873167  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0509  FAD linked oxidase domain protein  31.87 
 
 
1024 aa  422  1e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11033  FAD linked oxidase-like protein  30.2 
 
 
967 aa  421  1e-116  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3429  oxidoreductase  29.4 
 
 
975 aa  421  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5632  D-lactate dehydrogenase  32.1 
 
 
1007 aa  419  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2375  FAD linked oxidase-like protein  33.51 
 
 
952 aa  419  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2768  FAD linked oxidase domain protein  32.21 
 
 
974 aa  416  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834372  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3054  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.78 
 
 
1032 aa  412  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.267975 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2904  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.48 
 
 
1025 aa  408  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.83736  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.84 
 
 
1046 aa  409  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.433377  normal  0.249121 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3025  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.38 
 
 
1038 aa  404  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.473379 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1163  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.72 
 
 
961 aa  405  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.25056  normal  0.360544 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3324  D-lactate dehydrogenase  30.49 
 
 
973 aa  403  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2438  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.05 
 
 
1015 aa  402  9.999999999999999e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.944739  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3155  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.14 
 
 
983 aa  402  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0210  FAD linked oxidase domain protein  31.48 
 
 
1032 aa  400  9.999999999999999e-111  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.23019 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3126  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.55 
 
 
962 aa  397  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2940  FAD linked oxidase domain protein  30.72 
 
 
1055 aa  399  1e-109  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4811  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.26 
 
 
971 aa  395  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2547  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.74 
 
 
1023 aa  396  1e-108  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.846231  normal  0.179542 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0843  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.07 
 
 
1011 aa  395  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.505983 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3764  FAD linked oxidase domain protein  30.38 
 
 
1070 aa  390  1e-107  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0200676  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4649  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.77 
 
 
1034 aa  389  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1924  FAD linked oxidase-like  30.54 
 
 
967 aa  380  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0626  hypothetical protein  29.33 
 
 
930 aa  375  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1400  FAD linked oxidase domain protein  30.45 
 
 
1023 aa  374  1e-102  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2129  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.62 
 
 
968 aa  363  7.0000000000000005e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702869  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0362  FAD linked oxidase domain protein  26.99 
 
 
1006 aa  353  8e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0369  FAD linked oxidase domain protein  27.09 
 
 
1002 aa  353  1e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2718  FAD linked oxidase-like  30.46 
 
 
1010 aa  346  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.400601 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3570  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.45 
 
 
1027 aa  343  1e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.824304  normal  0.375577 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5319  FAD linked oxidase domain protein  29.5 
 
 
1012 aa  337  9e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3782  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.24 
 
 
1005 aa  326  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000105727 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2533  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  28.76 
 
 
1015 aa  320  9e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6630  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.5 
 
 
1018 aa  320  1e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2060  FAD linked oxidase  31.1 
 
 
978 aa  319  2e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.717631  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5785  FAD linked oxidase-like  28.33 
 
 
1018 aa  318  3e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6150  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.33 
 
 
1018 aa  318  3e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3281  FAD linked oxidase-like  27.34 
 
 
1009 aa  317  7e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.539054  normal  0.121942 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6039  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.36 
 
 
1017 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.549592 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8323  FAD linked oxidase domain protein  29.05 
 
 
1022 aa  315  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.109641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>