More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2129 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2129  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  100 
 
 		 968 aa  2006    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702869  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4811  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  78.27 
 
 		 971 aa  1610    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1924  FAD linked oxidase-like  40.58 
 
 		 967 aa  729    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4725  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  52.37 
 
 		 976 aa  1012    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.881602  hitchhiker  0.000909988 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2417  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  50.82 
 
 		 977 aa  967    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4649  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  47.75 
 
 		 1034 aa  926    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3155  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  47.96 
 
 		 983 aa  897    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3429  oxidoreductase  51.8 
 
 		 975 aa  1013    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3077  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  50.91 
 
 		 991 aa  989    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11033  FAD linked oxidase-like protein  56.61 
 
 		 967 aa  1121    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3858  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.74 
 
 		 978 aa  642    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.738511  hitchhiker  0.000383652 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5063  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  49.2 
 
 		 1009 aa  940    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2130  FAD linked oxidase domain protein  38.53 
 
 		 973 aa  669    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0843  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.39 
 
 		 1011 aa  938    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.505983 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0560  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.28 
 
 		 976 aa  633  1e-180  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.389138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0626  hypothetical protein  38.62 
 
 		 930 aa  634  1e-180  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3126  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.9 
 
 		 962 aa  588  1e-166  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6956  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.11 
 
 		 1007 aa  586  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4721  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.2 
 
 		 990 aa  586  1e-166  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00766177 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4574  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.37 
 
 		 990 aa  585  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0207313 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2375  FAD linked oxidase-like protein  35.65 
 
 		 952 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4204  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.07 
 
 		 990 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0106272  normal  0.500842 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2905  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.09 
 
 		 995 aa  572  1e-161  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3324  D-lactate dehydrogenase  35.62 
 
 		 973 aa  567  1e-160  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2904  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.59 
 
 		 1025 aa  564  1.0000000000000001e-159  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.83736  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5731  D-lactate dehydrogenase / anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  36.22 
 
 		 984 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4256  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.42 
 
 		 1005 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0457  FAD linked oxidase domain protein  35.07 
 
 		 1014 aa  561  1e-158  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.873167  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1163  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.8 
 
 		 961 aa  559  1e-158  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.25056  normal  0.360544 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0600  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.94 
 
 		 1025 aa  556  1e-157  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0509  FAD linked oxidase domain protein  34.54 
 
 		 1024 aa  554  1e-156  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3025  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.62 
 
 		 1038 aa  552  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.473379 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2438  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.62 
 
 		 1015 aa  553  1e-156  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.944739  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3402  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.34 
 
 		 989 aa  550  1e-155  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5632  D-lactate dehydrogenase  34.27 
 
 		 1007 aa  551  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2896  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.83 
 
 		 1035 aa  543  1e-153  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.228282  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3054  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.53 
 
 		 1032 aa  545  1e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267975 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2768  FAD linked oxidase domain protein  35.31 
 
 		 974 aa  543  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834372  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4692  FAD linked oxidase domain protein  34.25 
 
 		 996 aa  541  9.999999999999999e-153  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0507445  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.98 
 
 		 1046 aa  539  9.999999999999999e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.433377  normal  0.249121 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3485  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.49 
 
 		 983 aa  539  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3764  FAD linked oxidase domain protein  32.78 
 
 		 1070 aa  521  1e-146  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0200676  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2940  FAD linked oxidase domain protein  31.72 
 
 		 1055 aa  521  1e-146  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2547  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.31 
 
 		 1023 aa  517  1.0000000000000001e-145  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.846231  normal  0.179542 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0210  FAD linked oxidase domain protein  31.91 
 
 		 1032 aa  497  1e-139  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.23019 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2720  FAD linked oxidase-like protein  31.52 
 
 		 1024 aa  488  1e-136  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1400  FAD linked oxidase domain protein  31.81 
 
 		 1023 aa  482  1e-134  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.09 
 
 		 999 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2770  putative FAD-dependent oxidoreductase  31.16 
 
 		 999 aa  466  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0369  FAD linked oxidase domain protein  31.33 
 
 		 1002 aa  466  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2125  FAD linked oxidase domain protein  30.6 
 
 		 1015 aa  466  1e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0362  FAD linked oxidase domain protein  31.23 
 
 		 1006 aa  463  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2991  FAD linked oxidase-like  31.19 
 
 		 1013 aa  457  1e-127  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.207062 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0464  hypothetical protein  29.69 
 
 		 984 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1983  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.69 
 
 		 1031 aa  455  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0957  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.07 
 
 		 950 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  30.13 
 
 		 989 aa  447  1.0000000000000001e-124  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0289  FAD linked oxidase domain protein  31.32 
 
 		 976 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4859  FAD linked oxidase domain protein  29.99 
 
 		 1043 aa  445  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0821468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08570  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  29.13 
 
 		 945 aa  443  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.695725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0810  hypothetical protein  29.89 
 
 		 1050 aa  442  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0764  FAD linked oxidase domain protein  30.5 
 
 		 987 aa  442  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2117  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.41 
 
 		 973 aa  441  9.999999999999999e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.715118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0858  FAD linked oxidase domain protein  30.73 
 
 		 1052 aa  438  1e-121  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1181  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.61 
 
 		 1037 aa  433  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.998854 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0862  FAD linked oxidase domain protein  30.48 
 
 		 1050 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.961575  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1044  hypothetical protein  28.82 
 
 		 1031 aa  429  1e-118  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1074  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.66 
 
 		 1022 aa  424  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.899734  decreased coverage  0.000498092 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1787  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.06 
 
 		 948 aa  420  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2371  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  30.08 
 
 		 1024 aa  421  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.475276  normal  0.254542 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32250  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  29.91 
 
 		 974 aa  421  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3016  FAD linked oxidase domain protein  30.44 
 
 		 1010 aa  417  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.17034  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4442  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding:FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  28.86 
 
 		 966 aa  416  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3281  FAD linked oxidase-like  28.53 
 
 		 1009 aa  415  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.539054  normal  0.121942 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01656  predicted FAD-linked oxidoreductase  29.69 
 
 		 1018 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1955  FAD linked oxidase domain protein  29.69 
 
 		 1018 aa  410  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.181771  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2533  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  28.42 
 
 		 1015 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1903  oxidoreductase, FAD-binding  29.69 
 
 		 1018 aa  410  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.610317  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1944  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.46 
 
 		 1018 aa  411  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150005 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3570  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.08 
 
 		 1027 aa  410  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.824304  normal  0.375577 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1768  oxidoreductase, FAD-binding  29.69 
 
 		 1018 aa  410  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1747  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.66 
 
 		 1018 aa  412  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186842 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4174  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.73 
 
 		 1000 aa  410  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.57181  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01645  hypothetical protein  29.69 
 
 		 1018 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4130  FAD linked oxidase domain protein  28.9 
 
 		 975 aa  407  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419398  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2402  oxidoreductase, FAD-binding  29.59 
 
 		 1018 aa  409  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0186702 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2296  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.53 
 
 		 1023 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1888  oxidoreductase, FAD-binding  29.69 
 
 		 1018 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1509  oxidoreductase, FAD-binding  29.37 
 
 		 1018 aa  409  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.784999  hitchhiker  0.0000155929 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1604  hypothetical protein  30.61 
 
 		 966 aa  404  1e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0686  FAD linked oxidase domain protein  30.64 
 
 		 985 aa  405  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17651  normal  0.98502 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0962  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.12 
 
 		 1006 aa  403  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.108577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6039  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.85 
 
 		 1017 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.549592 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1450  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.88 
 
 		 1014 aa  404  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3999  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.69 
 
 		 1006 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316797 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1746  FAD linked oxidase-like  28.42 
 
 		 1013 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3782  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.62 
 
 		 1005 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000105727 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2161  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.4 
 
 		 1024 aa  397  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.126356 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2176  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.99 
 
 		 1018 aa  397  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0114816 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5785  FAD linked oxidase-like  28.52 
 
 		 1018 aa  398  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>