More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1983 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2179  FAD linked oxidase domain protein  48.69 
 
 		 894 aa  727    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0957  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.56 
 
 		 950 aa  763    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2011  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  45.69 
 
 		 947 aa  711    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00715823  decreased coverage  0.00037047 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  43.66 
 
 		 989 aa  677    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5581  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  45.56 
 
 		 1050 aa  696    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2117  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.6 
 
 		 973 aa  747    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.715118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2125  FAD linked oxidase domain protein  55.46 
 
 		 1015 aa  1063    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0862  FAD linked oxidase domain protein  56.84 
 
 		 1050 aa  1018    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.961575  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2844  putative oxidoreductase  44.64 
 
 		 949 aa  712    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.788098  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4442  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding:FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  50.36 
 
 		 966 aa  919    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08570  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  52.04 
 
 		 945 aa  910    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.695725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0464  hypothetical protein  53.33 
 
 		 984 aa  1028    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0728  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  48.76 
 
 		 995 aa  651    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  46.98 
 
 		 999 aa  855    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3016  FAD linked oxidase domain protein  42.53 
 
 		 1010 aa  693    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.17034  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0810  hypothetical protein  56.43 
 
 		 1050 aa  1018    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32250  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  45.56 
 
 		 974 aa  763    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0962  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  46.71 
 
 		 1006 aa  753    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.108577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1983  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  100 
 
 		 1031 aa  2080    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2770  putative FAD-dependent oxidoreductase  46.67 
 
 		 999 aa  850    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4130  FAD linked oxidase domain protein  46.07 
 
 		 975 aa  761    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419398  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0686  FAD linked oxidase domain protein  45.34 
 
 		 985 aa  719    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17651  normal  0.98502 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1074  FAD linked oxidase domain-containing protein  65.55 
 
 		 1022 aa  1293    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.899734  decreased coverage  0.000498092 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0289  FAD linked oxidase domain protein  50.73 
 
 		 976 aa  966    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2991  FAD linked oxidase-like  50.25 
 
 		 1013 aa  940    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.207062 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0601  FAD linked oxidase domain protein  43.74 
 
 		 997 aa  688    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431766  normal  0.0923771 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2720  FAD linked oxidase-like protein  54.28 
 
 		 1024 aa  1017    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0764  FAD linked oxidase domain protein  52.17 
 
 		 987 aa  907    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4859  FAD linked oxidase domain protein  62.32 
 
 		 1043 aa  1205    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0821468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4075  FAD linked oxidase domain protein  40.72 
 
 		 993 aa  644    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1787  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  46.6 
 
 		 948 aa  747    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2165  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.15 
 
 		 944 aa  714    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1181  FAD linked oxidase domain-containing protein  65.52 
 
 		 1037 aa  1330    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.998854 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0858  FAD linked oxidase domain protein  56.62 
 
 		 1052 aa  1017    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1470  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.15 
 
 		 997 aa  684    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.271002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4174  FAD linked oxidase domain-containing protein  62.53 
 
 		 1000 aa  1149    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.57181  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4803  FAD linked oxidase domain protein  46.24 
 
 		 976 aa  756    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1756  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.76 
 
 		 1028 aa  627  1e-178  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.411598  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3858  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.76 
 
 		 978 aa  623  1e-177  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.738511  hitchhiker  0.000383652 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0560  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.06 
 
 		 976 aa  620  1e-176  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.389138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0725  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.66 
 
 		 906 aa  592  1e-167  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4204  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.28 
 
 		 990 aa  557  1e-157  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0106272  normal  0.500842 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0150  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.14 
 
 		 977 aa  558  1e-157  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4574  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.28 
 
 		 990 aa  554  1e-156  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0207313 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4721  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.97 
 
 		 990 aa  548  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00766177 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2130  FAD linked oxidase domain protein  36.19 
 
 		 973 aa  546  1e-153  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2905  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.51 
 
 		 995 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3402  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.5 
 
 		 989 aa  542  9.999999999999999e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4692  FAD linked oxidase domain protein  35.08 
 
 		 996 aa  533  1e-150  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0507445  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2375  FAD linked oxidase-like protein  38.36 
 
 		 952 aa  532  1e-149  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2940  FAD linked oxidase domain protein  35.94 
 
 		 1055 aa  527  1e-148  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3485  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.53 
 
 		 983 aa  523  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3324  D-lactate dehydrogenase  35.26 
 
 		 973 aa  520  1e-146  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3126  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.15 
 
 		 962 aa  514  1e-144  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2768  FAD linked oxidase domain protein  37.75 
 
 		 974 aa  513  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834372  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2438  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.96 
 
 		 1015 aa  516  1e-144  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.944739  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3155  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.81 
 
 		 983 aa  511  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3077  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.13 
 
 		 991 aa  509  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6956  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.73 
 
 		 1007 aa  511  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5632  D-lactate dehydrogenase  36.32 
 
 		 1007 aa  509  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3764  FAD linked oxidase domain protein  34.73 
 
 		 1070 aa  511  1e-143  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0200676  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4256  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.62 
 
 		 1005 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2547  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.03 
 
 		 1023 aa  505  1e-141  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.846231  normal  0.179542 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5731  D-lactate dehydrogenase / anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  35.09 
 
 		 984 aa  505  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0509  FAD linked oxidase domain protein  34.58 
 
 		 1024 aa  500  1e-140  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5063  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.89 
 
 		 1009 aa  502  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.71 
 
 		 1046 aa  497  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.433377  normal  0.249121 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0843  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.62 
 
 		 1011 aa  499  1e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.505983 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3025  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.83 
 
 		 1038 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.473379 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2904  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.57 
 
 		 1025 aa  493  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.83736  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3054  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.12 
 
 		 1032 aa  494  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267975 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0457  FAD linked oxidase domain protein  34.91 
 
 		 1014 aa  491  1e-137  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.873167  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2896  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.72 
 
 		 1035 aa  487  1e-136  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.228282  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3429  oxidoreductase  30.64 
 
 		 975 aa  487  1e-136  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1924  FAD linked oxidase-like  35.48 
 
 		 967 aa  484  1e-135  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4725  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.36 
 
 		 976 aa  486  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.881602  hitchhiker  0.000909988 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0210  FAD linked oxidase domain protein  33.3 
 
 		 1032 aa  480  1e-134  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.23019 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2417  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.2 
 
 		 977 aa  481  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0600  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.81 
 
 		 1025 aa  476  1e-133  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4811  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.61 
 
 		 971 aa  474  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1163  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.27 
 
 		 961 aa  472  1.0000000000000001e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.25056  normal  0.360544 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1400  FAD linked oxidase domain protein  32.88 
 
 		 1023 aa  466  9.999999999999999e-131  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4649  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.75 
 
 		 1034 aa  465  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2129  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.9 
 
 		 968 aa  464  1e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702869  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11033  FAD linked oxidase-like protein  29.85 
 
 		 967 aa  461  9.999999999999999e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0626  hypothetical protein  31.97 
 
 		 930 aa  438  1e-121  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0369  FAD linked oxidase domain protein  27.33 
 
 		 1002 aa  370  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0362  FAD linked oxidase domain protein  27.23 
 
 		 1006 aa  365  3e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3570  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.48 
 
 		 1027 aa  345  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.824304  normal  0.375577 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2161  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.18 
 
 		 1024 aa  338  2.9999999999999997e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.126356 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5319  FAD linked oxidase domain protein  28.33 
 
 		 1012 aa  337  9e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2371  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.57 
 
 		 1024 aa  333  1e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.475276  normal  0.254542 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1044  hypothetical protein  23.89 
 
 		 1031 aa  326  1e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1604  hypothetical protein  26.89 
 
 		 966 aa  325  2e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1419  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.47 
 
 		 1006 aa  323  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.184545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6039  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.24 
 
 		 1017 aa  323  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.549592 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2718  FAD linked oxidase-like  29.09 
 
 		 1010 aa  322  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.400601 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3999  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.37 
 
 		 1006 aa  322  3e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316797 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6081  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.56 
 
 		 1023 aa  321  5e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3782  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.38 
 
 		 1005 aa  321  5e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000105727 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>