More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2718 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003726  Fe-S oxidoreductase  46.58 
 
 		 1011 aa  928    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000740961  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0369  FAD linked oxidase domain protein  44.53 
 
 		 1002 aa  885    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01656  predicted FAD-linked oxidoreductase  50.65 
 
 		 1018 aa  991    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1955  FAD linked oxidase domain protein  50.65 
 
 		 1018 aa  990    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.181771  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2480  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.37 
 
 		 1013 aa  884    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4493  FAD linked oxidase domain protein  56.07 
 
 		 1006 aa  1111    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5622  FAD linked oxidase domain-containing protein  65.3 
 
 		 1020 aa  1242    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.45368  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2998  FAD binding protein  44.49 
 
 		 1069 aa  918    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.786672  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01645  hypothetical protein  50.65 
 
 		 1018 aa  991    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2487  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.71 
 
 		 1013 aa  888    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2643  oxidoreductase, FAD-binding, putative  46.33 
 
 		 1013 aa  896    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2805  oxidoreductase, FAD-binding, putative  57.61 
 
 		 1015 aa  1127    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3570  FAD linked oxidase domain-containing protein  61.74 
 
 		 1027 aa  1201    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.824304  normal  0.375577 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1872  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  45.78 
 
 		 1019 aa  914    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000561674 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001538  Fe-S oxidoreductase  47.28 
 
 		 1015 aa  920    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1739  oxidase, FAD binding  49.35 
 
 		 1018 aa  968    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2596  hypothetical protein  49.25 
 
 		 1018 aa  966    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2242  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.82 
 
 		 1013 aa  892    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1604  hypothetical protein  41.9 
 
 		 966 aa  788    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2533  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  57.36 
 
 		 1015 aa  1116    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2402  oxidoreductase, FAD-binding  50.55 
 
 		 1018 aa  989    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0186702 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1807  FAD linked oxidase  50.65 
 
 		 1018 aa  984    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.354547  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1888  oxidoreductase, FAD-binding  50.55 
 
 		 1018 aa  987    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1944  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.65 
 
 		 1018 aa  992    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150005 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1768  oxidoreductase, FAD-binding  50.65 
 
 		 1018 aa  991    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0818  hypothetical protein  47.2 
 
 		 1021 aa  942    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.103467  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0362  FAD linked oxidase domain protein  44.1 
 
 		 1006 aa  883    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3281  FAD linked oxidase-like  53.56 
 
 		 1009 aa  1073    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.539054  normal  0.121942 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1550  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.63 
 
 		 1026 aa  919    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.273909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1978  FAD linked oxidase  50.65 
 
 		 1018 aa  985    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000994047 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7704  FAD linked oxidase  56.12 
 
 		 1017 aa  1073    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.986449 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1845  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.35 
 
 		 1018 aa  966    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2161  FAD linked oxidase domain-containing protein  53.68 
 
 		 1024 aa  1152    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.126356 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4140  FAD linked oxidase domain-containing protein  65.18 
 
 		 1017 aa  1270    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1461  FAD linked oxidase domain protein  50.65 
 
 		 1018 aa  986    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.236754 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1477  FAD linked oxidase domain protein  50.55 
 
 		 1018 aa  989    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000065688 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1747  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.35 
 
 		 1018 aa  991    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186842 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2060  FAD linked oxidase  40.26 
 
 		 978 aa  637    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.717631  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6630  FAD linked oxidase domain-containing protein  57.29 
 
 		 1018 aa  1107    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5809  FAD linked oxidase domain-containing protein  56.18 
 
 		 1017 aa  1084    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5319  FAD linked oxidase domain protein  54.79 
 
 		 1012 aa  1070    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1864  FAD linked oxidase domain protein  46.86 
 
 		 1013 aa  894    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.23854  hitchhiker  0.000000575821 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2176  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.41 
 
 		 1018 aa  979    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0114816 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1691  FAD linked oxidase domain protein  51.15 
 
 		 1019 aa  983    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.572774  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02063  hypothetical protein  46.95 
 
 		 1011 aa  919    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2371  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  53.88 
 
 		 1024 aa  1132    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.475276  normal  0.254542 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2718  FAD linked oxidase-like  100 
 
 		 1010 aa  2064    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.400601 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1903  oxidoreductase, FAD-binding  50.65 
 
 		 1018 aa  993    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.610317  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8323  FAD linked oxidase domain protein  64.94 
 
 		 1022 aa  1290    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.109641  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2008  FAD linked oxidase-like protein  45.36 
 
 		 1016 aa  905    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.180059  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2453  FAD linked oxidase domain protein  49.85 
 
 		 1017 aa  985    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.999389  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2600  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.71 
 
 		 1013 aa  885    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.575227  normal  0.0164973 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2316  FAD linked oxidase-like protein  64.16 
 
 		 1091 aa  652    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0331253  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8623  FAD linked oxidase domain protein  61.68 
 
 		 1067 aa  1250    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3999  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.38 
 
 		 1006 aa  1099    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316797 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4607  FAD linked oxidase domain-containing protein  56.78 
 
 		 1017 aa  1103    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.173184  normal  0.281232 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5785  FAD linked oxidase-like  56.24 
 
 		 1018 aa  1093    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1746  FAD linked oxidase-like  49.01 
 
 		 1013 aa  976    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2714  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.97 
 
 		 1023 aa  910    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.488036  normal  0.0122015 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1044  hypothetical protein  44.35 
 
 		 1031 aa  916    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1593  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.48 
 
 		 1013 aa  894    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.125155  normal  0.43288 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1668  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.27 
 
 		 1013 aa  891    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.157229  hitchhiker  0.00241785 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2296  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.52 
 
 		 1023 aa  937    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2548  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.45 
 
 		 1016 aa  901    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6039  FAD linked oxidase domain-containing protein  56.5 
 
 		 1017 aa  1089    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.549592 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1659  FAD linked oxidase domain protein  50.1 
 
 		 1021 aa  979    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.370272  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2755  FAD linked oxidase domain protein  50 
 
 		 1017 aa  987    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.190253  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6081  FAD linked oxidase domain-containing protein  56.18 
 
 		 1023 aa  1077    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6150  FAD linked oxidase domain-containing protein  56.24 
 
 		 1018 aa  1093    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1509  oxidoreductase, FAD-binding  50.55 
 
 		 1018 aa  988    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.784999  hitchhiker  0.0000155929 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1737  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.37 
 
 		 1013 aa  891    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.187765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3782  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.83 
 
 		 1005 aa  1109    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000105727 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1496  FAD linked oxidase  50.65 
 
 		 1018 aa  985    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.237885  hitchhiker  0.00132557 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2062  FAD linked oxidase  46.31 
 
 		 1010 aa  936    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2071  oxidoreductase, FAD-binding, putative  47.15 
 
 		 1007 aa  910    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.999206 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1450  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.75 
 
 		 1014 aa  945    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1419  FAD linked oxidase domain-containing protein  56.07 
 
 		 1006 aa  1110    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.184545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3858  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.94 
 
 		 978 aa  486  1e-136  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.738511  hitchhiker  0.000383652 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0560  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.88 
 
 		 976 aa  482  1e-134  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.389138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3077  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.6 
 
 		 991 aa  460  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4725  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.95 
 
 		 976 aa  456  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.881602  hitchhiker  0.000909988 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4649  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.02 
 
 		 1034 aa  441  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3429  oxidoreductase  30.74 
 
 		 975 aa  440  9.999999999999999e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2417  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.9 
 
 		 977 aa  428  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5063  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.36 
 
 		 1009 aa  424  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3155  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.12 
 
 		 983 aa  417  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0457  FAD linked oxidase domain protein  32.81 
 
 		 1014 aa  410  1e-113  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.873167  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2130  FAD linked oxidase domain protein  31.47 
 
 		 973 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11033  FAD linked oxidase-like protein  29.84 
 
 		 967 aa  405  1e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4692  FAD linked oxidase domain protein  29.5 
 
 		 996 aa  403  9.999999999999999e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0507445  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0843  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.5 
 
 		 1011 aa  395  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.505983 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4811  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.29 
 
 		 971 aa  390  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2129  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.49 
 
 		 968 aa  385  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702869  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3402  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.51 
 
 		 989 aa  382  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2438  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.24 
 
 		 1015 aa  380  1e-104  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.944739  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1924  FAD linked oxidase-like  31.07 
 
 		 967 aa  377  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3485  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.46 
 
 		 983 aa  378  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2720  FAD linked oxidase-like protein  30.69 
 
 		 1024 aa  379  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3324  D-lactate dehydrogenase  31.34 
 
 		 973 aa  375  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0509  FAD linked oxidase domain protein  29.61 
 
 		 1024 aa  373  1e-102  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>