More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0406 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0694  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  48.49 
 
 		 936 aa  877    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000209119 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4737  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  48.92 
 
 		 936 aa  886    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0148478 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13795  predicted protein  42.39 
 
 		 983 aa  763    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0857019  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4686  oxidoreductase, FAD-binding/iron-sulfur cluster-binding protein  46.19 
 
 		 944 aa  867    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1725  FAD linked oxidase domain protein  42.57 
 
 		 937 aa  720    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.250362  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1521  iron-sulfur cluster-binding protein  41.61 
 
 		 914 aa  742    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0253  oxidoreductase/iron-sulfur cluster-binding protein  44.98 
 
 		 959 aa  827    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1763  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding:FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  48.61 
 
 		 923 aa  867    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.575647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3063  FAD linked oxidase domain protein  49.79 
 
 		 967 aa  833    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0460  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.98 
 
 		 992 aa  689    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.394566 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0749  FAD linked oxidase-like  49.02 
 
 		 940 aa  885    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3136  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.04 
 
 		 934 aa  741    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.502756 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3604  oxidoreductase  46.82 
 
 		 943 aa  860    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00314932  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4837  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39 
 
 		 973 aa  671    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.286258  hitchhiker  0.00000327471 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1410  4Fe-4S ferredoxin  48.88 
 
 		 960 aa  833    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.787039  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3171  FAD linked oxidase domain protein  49.79 
 
 		 961 aa  824    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4738  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  49.03 
 
 		 936 aa  884    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3008  FAD linked oxidase domain protein  40.61 
 
 		 934 aa  743    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000527922 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2973  FAD linked oxidase-like  49.57 
 
 		 955 aa  822    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.771032  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3228  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  44.81 
 
 		 978 aa  837    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.130904  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1439  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.95 
 
 		 967 aa  825    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.96855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3343  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.81 
 
 		 934 aa  697    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.641395 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43110  Fe-S/FAD domain protein  49.04 
 
 		 938 aa  874    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326877  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0908  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.96 
 
 		 942 aa  739    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000203424 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0405  FAD linked oxidase-like protein  50.32 
 
 		 961 aa  903    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0118244  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2196  FAD linked oxidase domain protein  47.42 
 
 		 942 aa  866    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2723  FAD linked oxidase-like  43.31 
 
 		 955 aa  752    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1271  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.29 
 
 		 934 aa  743    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0752852  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1546  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  45.65 
 
 		 938 aa  822    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.825134  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2281  FAD linked oxidase-like  44.09 
 
 		 949 aa  783    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0406  FAD linked oxidase-like  100 
 
 		 951 aa  1941    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.955894  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2735  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.07 
 
 		 934 aa  741    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1376  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.72 
 
 		 934 aa  746    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.915749 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2808  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.96 
 
 		 934 aa  737    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2794  FAD linked oxidase domain-containing protein  40 
 
 		 934 aa  731    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2995  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.37 
 
 		 939 aa  721    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63100  putative ferredoxin  49.35 
 
 		 938 aa  867    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.153244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1339  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.61 
 
 		 934 aa  745    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0072  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  46.7 
 
 		 959 aa  864    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2905  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.18 
 
 		 934 aa  741    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.520733  normal  0.168522 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5492  oxidoreductase FAD-binding region  49.09 
 
 		 941 aa  879    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.203928  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2440  iron-sulfur cluster-binding protein  40.83 
 
 		 935 aa  715    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1418  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.83 
 
 		 943 aa  829    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4603  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  49.03 
 
 		 936 aa  888    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52713  normal  0.0292343 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2725  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  47.69 
 
 		 941 aa  875    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.191321 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2256  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  48.39 
 
 		 937 aa  858    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000277534  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1353  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.61 
 
 		 934 aa  744    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1756  oxidoreductase, FAD-binding, iron-sulfur cluster-binding  35.11 
 
 		 923 aa  614  9.999999999999999e-175  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3728  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.25 
 
 		 966 aa  613  9.999999999999999e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0224472  normal  0.621627 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1936  oxidoreductase, FAD-binding, iron-sulfur cluster-binding  34.9 
 
 		 923 aa  610  1e-173  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2934  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.92 
 
 		 966 aa  605  1.0000000000000001e-171  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0048436  hitchhiker  0.00113857 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4610  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.31 
 
 		 928 aa  594  1e-168  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.119537 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4141  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.94 
 
 		 941 aa  588  1e-166  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2007  FAD linked oxidase-like  38.04 
 
 		 955 aa  561  1e-158  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0184  FAD linked oxidase domain protein  37.62 
 
 		 967 aa  534  1e-150  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2130  FAD linked oxidase domain protein  26.1 
 
 		 973 aa  224  6e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2547  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.1 
 
 		 1023 aa  203  9.999999999999999e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.846231  normal  0.179542 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2940  FAD linked oxidase domain protein  25.17 
 
 		 1055 aa  200  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6956  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.67 
 
 		 1007 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4692  FAD linked oxidase domain protein  24.39 
 
 		 996 aa  198  5.000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0507445  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3054  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.62 
 
 		 1032 aa  197  6e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267975 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4811  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.17 
 
 		 971 aa  197  9e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3764  FAD linked oxidase domain protein  25.99 
 
 		 1070 aa  194  6e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0200676  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  26.26 
 
 		 989 aa  193  2e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3077  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.87 
 
 		 991 aa  192  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0600  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.44 
 
 		 1025 aa  189  2e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2438  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.55 
 
 		 1015 aa  188  3e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.944739  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0843  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.85 
 
 		 1011 aa  187  8e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.505983 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0210  FAD linked oxidase domain protein  24.46 
 
 		 1032 aa  186  2.0000000000000003e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.23019 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0957  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.46 
 
 		 950 aa  184  6e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4256  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.85 
 
 		 1005 aa  184  9.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3126  FAD linked oxidase domain-containing protein  25 
 
 		 962 aa  182  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3858  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.94 
 
 		 978 aa  182  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.738511  hitchhiker  0.000383652 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3025  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.79 
 
 		 1038 aa  181  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.473379 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5063  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.73 
 
 		 1009 aa  181  7e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3402  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.9 
 
 		 989 aa  181  8e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4442  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding:FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  24.55 
 
 		 966 aa  179  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0626  hypothetical protein  27.39 
 
 		 930 aa  179  2e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2117  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.3 
 
 		 973 aa  178  4e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.715118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2129  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  22.77 
 
 		 968 aa  178  5e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702869  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5731  D-lactate dehydrogenase / anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  25.96 
 
 		 984 aa  177  9e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0560  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.52 
 
 		 976 aa  176  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.389138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0457  FAD linked oxidase domain protein  24.08 
 
 		 1014 aa  176  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.873167  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4721  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.67 
 
 		 990 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00766177 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2904  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.92 
 
 		 1025 aa  175  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.83736  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2441  FAD/FMN-containing dehydrogenase  28.46 
 
 		 532 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2720  FAD linked oxidase-like protein  24.06 
 
 		 1024 aa  175  2.9999999999999996e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2896  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.23 
 
 		 1035 aa  175  2.9999999999999996e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.228282  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2768  FAD linked oxidase domain protein  25.18 
 
 		 974 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834372  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1400  FAD linked oxidase domain protein  26.34 
 
 		 1023 aa  175  3.9999999999999995e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0464  hypothetical protein  23.47 
 
 		 984 aa  175  3.9999999999999995e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3155  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.97 
 
 		 983 aa  174  5.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3485  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.28 
 
 		 983 aa  174  6.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5632  D-lactate dehydrogenase  25.72 
 
 		 1007 aa  174  6.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2125  FAD linked oxidase domain protein  24.24 
 
 		 1015 aa  173  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4574  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.31 
 
 		 990 aa  173  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0207313 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2991  FAD linked oxidase-like  23.71 
 
 		 1013 aa  171  7e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.207062 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4204  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.92 
 
 		 990 aa  171  7e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0106272  normal  0.500842 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2375  FAD linked oxidase-like protein  27.03 
 
 		 952 aa  170  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4174  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.38 
 
 		 1000 aa  169  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.57181  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>