More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1521 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4737  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  44.82 
 
 		 936 aa  799    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0148478 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4686  oxidoreductase, FAD-binding/iron-sulfur cluster-binding protein  42.76 
 
 		 944 aa  773    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1756  oxidoreductase, FAD-binding, iron-sulfur cluster-binding  38.57 
 
 		 923 aa  657    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1521  iron-sulfur cluster-binding protein  100 
 
 		 914 aa  1904    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43110  Fe-S/FAD domain protein  44.6 
 
 		 938 aa  803    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326877  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13795  predicted protein  39.54 
 
 		 983 aa  688    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0857019  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0908  FAD linked oxidase domain-containing protein  83.77 
 
 		 942 aa  1627    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000203424 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2995  FAD linked oxidase domain-containing protein  81.15 
 
 		 939 aa  1590    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1763  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding:FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  46.99 
 
 		 923 aa  845    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.575647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1546  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  44.1 
 
 		 938 aa  792    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.825134  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2725  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  46.56 
 
 		 941 aa  850    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.191321 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0749  FAD linked oxidase-like  44.27 
 
 		 940 aa  790    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0253  oxidoreductase/iron-sulfur cluster-binding protein  42.56 
 
 		 959 aa  795    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1439  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.5 
 
 		 967 aa  754    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.96855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3604  oxidoreductase  45.69 
 
 		 943 aa  849    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00314932  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4738  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  44.93 
 
 		 936 aa  800    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1410  4Fe-4S ferredoxin  46.38 
 
 		 960 aa  823    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.787039  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3008  FAD linked oxidase domain protein  84.68 
 
 		 934 aa  1631    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000527922 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2973  FAD linked oxidase-like  43.84 
 
 		 955 aa  762    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.771032  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4603  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  44.93 
 
 		 936 aa  801    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52713  normal  0.0292343 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0072  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  44.75 
 
 		 959 aa  827    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1725  FAD linked oxidase domain protein  40.77 
 
 		 937 aa  684    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.250362  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0405  FAD linked oxidase-like protein  45.22 
 
 		 961 aa  817    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0118244  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1339  FAD linked oxidase domain-containing protein  85.01 
 
 		 934 aa  1635    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1271  FAD linked oxidase domain-containing protein  95.51 
 
 		 934 aa  1824    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0752852  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2723  FAD linked oxidase-like  39.25 
 
 		 955 aa  697    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1353  FAD linked oxidase domain-containing protein  84.9 
 
 		 934 aa  1634    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2196  FAD linked oxidase domain protein  45.31 
 
 		 942 aa  839    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2281  FAD linked oxidase-like  42.32 
 
 		 949 aa  775    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0406  FAD linked oxidase-like  41.61 
 
 		 951 aa  746    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.955894  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3063  FAD linked oxidase domain protein  43.4 
 
 		 967 aa  773    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4837  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.8 
 
 		 973 aa  637    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.286258  hitchhiker  0.00000327471 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2735  FAD linked oxidase domain-containing protein  87.2 
 
 		 934 aa  1691    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3228  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.72 
 
 		 978 aa  786    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.130904  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2808  FAD linked oxidase domain-containing protein  86.98 
 
 		 934 aa  1684    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2794  FAD linked oxidase domain-containing protein  80.53 
 
 		 934 aa  1575    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1376  FAD linked oxidase domain-containing protein  85.01 
 
 		 934 aa  1636    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.915749 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63100  putative ferredoxin  45.47 
 
 		 938 aa  812    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.153244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5492  oxidoreductase FAD-binding region  45.22 
 
 		 941 aa  815    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.203928  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1936  oxidoreductase, FAD-binding, iron-sulfur cluster-binding  38.07 
 
 		 923 aa  654    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0694  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  45.07 
 
 		 936 aa  796    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000209119 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3171  FAD linked oxidase domain protein  43.51 
 
 		 961 aa  759    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2905  FAD linked oxidase domain-containing protein  87.09 
 
 		 934 aa  1687    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.520733  normal  0.168522 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0460  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.32 
 
 		 992 aa  636    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.394566 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3136  FAD linked oxidase domain-containing protein  82.6 
 
 		 934 aa  1607    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.502756 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2440  iron-sulfur cluster-binding protein  75.82 
 
 		 935 aa  1490    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2256  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  45.36 
 
 		 937 aa  811    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000277534  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1418  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.05 
 
 		 943 aa  812    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3343  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.24 
 
 		 934 aa  623  1e-177  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.641395 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4141  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.92 
 
 		 941 aa  614  9.999999999999999e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3728  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.66 
 
 		 966 aa  580  1e-164  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0224472  normal  0.621627 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2007  FAD linked oxidase-like  34.02 
 
 		 955 aa  572  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2934  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.52 
 
 		 966 aa  560  1e-158  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0048436  hitchhiker  0.00113857 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0184  FAD linked oxidase domain protein  34.13 
 
 		 967 aa  558  1e-157  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4610  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.2 
 
 		 928 aa  549  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.119537 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2130  FAD linked oxidase domain protein  24.71 
 
 		 973 aa  213  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1470  FAD linked oxidase domain-containing protein  26 
 
 		 997 aa  213  2e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.271002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08570  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  24.41 
 
 		 945 aa  211  4e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.695725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  25.77 
 
 		 989 aa  207  9e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2117  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.06 
 
 		 973 aa  206  1e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.715118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3858  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.23 
 
 		 978 aa  206  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.738511  hitchhiker  0.000383652 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4174  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.36 
 
 		 1000 aa  201  5e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.57181  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11033  FAD linked oxidase-like protein  24.64 
 
 		 967 aa  199  1.0000000000000001e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0560  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.32 
 
 		 976 aa  199  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.389138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0464  hypothetical protein  24.01 
 
 		 984 aa  196  2e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0626  hypothetical protein  26.38 
 
 		 930 aa  195  3e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4725  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.04 
 
 		 976 aa  194  8e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.881602  hitchhiker  0.000909988 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2129  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.93 
 
 		 968 aa  193  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702869  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3016  FAD linked oxidase domain protein  24.66 
 
 		 1010 aa  192  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.17034  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1181  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.51 
 
 		 1037 aa  191  5e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.998854 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3429  oxidoreductase  24.58 
 
 		 975 aa  189  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32250  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  25.21 
 
 		 974 aa  189  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3485  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.37 
 
 		 983 aa  188  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2125  FAD linked oxidase domain protein  23.43 
 
 		 1015 aa  188  5e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1983  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.92 
 
 		 1031 aa  188  5e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5063  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.85 
 
 		 1009 aa  187  6e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1074  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.8 
 
 		 1022 aa  184  5.0000000000000004e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.899734  decreased coverage  0.000498092 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4130  FAD linked oxidase domain protein  24.97 
 
 		 975 aa  184  6e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419398  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1787  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.88 
 
 		 948 aa  184  6e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0843  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.32 
 
 		 1011 aa  184  7e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.505983 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4442  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding:FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  23.9 
 
 		 966 aa  184  7e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4803  FAD linked oxidase domain protein  26.33 
 
 		 976 aa  182  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0957  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.85 
 
 		 950 aa  182  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1163  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.86 
 
 		 961 aa  181  4e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.25056  normal  0.360544 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4204  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.94 
 
 		 990 aa  179  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0106272  normal  0.500842 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3077  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.55 
 
 		 991 aa  178  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2165  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.69 
 
 		 944 aa  178  5e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2375  FAD linked oxidase-like protein  24.45 
 
 		 952 aa  177  7e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4811  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.73 
 
 		 971 aa  176  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4574  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.59 
 
 		 990 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0207313 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2768  FAD linked oxidase domain protein  23.74 
 
 		 974 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834372  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2438  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.4 
 
 		 1015 aa  175  3.9999999999999995e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.944739  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0601  FAD linked oxidase domain protein  26.32 
 
 		 997 aa  174  5.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431766  normal  0.0923771 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4721  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.48 
 
 		 990 aa  174  6.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00766177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3155  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.01 
 
 		 983 aa  172  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6956  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.64 
 
 		 1007 aa  172  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0962  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.2 
 
 		 1006 aa  171  4e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.108577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2905  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.62 
 
 		 995 aa  171  5e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3402  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.37 
 
 		 989 aa  171  6e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2720  FAD linked oxidase-like protein  23.37 
 
 		 1024 aa  170  9e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>