More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0184 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4610  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  55.64 
 
 		 928 aa  921    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.119537 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4837  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.52 
 
 		 973 aa  710    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.286258  hitchhiker  0.00000327471 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1439  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.56 
 
 		 967 aa  636    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.96855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3728  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  51.35 
 
 		 966 aa  929    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0224472  normal  0.621627 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3343  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.78 
 
 		 934 aa  659    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.641395 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2007  FAD linked oxidase-like  49.84 
 
 		 955 aa  820    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2934  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  53.21 
 
 		 966 aa  921    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0048436  hitchhiker  0.00113857 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2723  FAD linked oxidase-like  40.04 
 
 		 955 aa  720    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0184  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 		 967 aa  1902    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0460  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.41 
 
 		 992 aa  666    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.394566 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4141  FAD linked oxidase domain-containing protein  53.69 
 
 		 941 aa  941    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2973  FAD linked oxidase-like  42.67 
 
 		 955 aa  616  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.771032  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3063  FAD linked oxidase domain protein  42 
 
 		 967 aa  606  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4603  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.16 
 
 		 936 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52713  normal  0.0292343 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4737  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.05 
 
 		 936 aa  602  1e-170  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0148478 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0405  FAD linked oxidase-like protein  39 
 
 		 961 aa  600  1e-170  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0118244  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5492  oxidoreductase FAD-binding region  39.79 
 
 		 941 aa  598  1e-169  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.203928  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4738  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.16 
 
 		 936 aa  595  1e-168  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2196  FAD linked oxidase domain protein  37.65 
 
 		 942 aa  593  1e-168  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2725  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.04 
 
 		 941 aa  594  1e-168  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.191321 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63100  putative ferredoxin  39.15 
 
 		 938 aa  590  1e-167  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.153244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0694  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.84 
 
 		 936 aa  590  1e-167  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000209119 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3171  FAD linked oxidase domain protein  41.21 
 
 		 961 aa  587  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2256  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.53 
 
 		 937 aa  588  1e-166  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000277534  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43110  Fe-S/FAD domain protein  38.7 
 
 		 938 aa  588  1e-166  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326877  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1763  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding:FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  38.62 
 
 		 923 aa  585  1.0000000000000001e-165  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.575647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0253  oxidoreductase/iron-sulfur cluster-binding protein  35.98 
 
 		 959 aa  581  1e-164  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0908  FAD linked oxidase domain-containing protein  35 
 
 		 942 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000203424 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0749  FAD linked oxidase-like  36.68 
 
 		 940 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1418  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.63 
 
 		 943 aa  576  1.0000000000000001e-163  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3228  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.42 
 
 		 978 aa  572  1e-161  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.130904  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3604  oxidoreductase  35.9 
 
 		 943 aa  568  1e-160  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00314932  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1271  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.08 
 
 		 934 aa  566  1e-160  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0752852  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2794  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.18 
 
 		 934 aa  565  1.0000000000000001e-159  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1521  iron-sulfur cluster-binding protein  34.13 
 
 		 914 aa  560  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1410  4Fe-4S ferredoxin  38.58 
 
 		 960 aa  557  1e-157  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.787039  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2440  iron-sulfur cluster-binding protein  34.76 
 
 		 935 aa  558  1e-157  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0072  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.42 
 
 		 959 aa  555  1e-156  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4686  oxidoreductase, FAD-binding/iron-sulfur cluster-binding protein  34 
 
 		 944 aa  550  1e-155  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1546  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.01 
 
 		 938 aa  548  1e-154  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.825134  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1353  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.4 
 
 		 934 aa  544  1e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1339  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.4 
 
 		 934 aa  544  1e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2995  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.37 
 
 		 939 aa  544  1e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1376  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.3 
 
 		 934 aa  542  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.915749 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0406  FAD linked oxidase-like  37.62 
 
 		 951 aa  540  9.999999999999999e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.955894  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2735  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.16 
 
 		 934 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2808  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.16 
 
 		 934 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3008  FAD linked oxidase domain protein  33.3 
 
 		 934 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000527922 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3136  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.16 
 
 		 934 aa  537  1e-151  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.502756 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2905  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.06 
 
 		 934 aa  537  1e-151  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.520733  normal  0.168522 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2281  FAD linked oxidase-like  32.88 
 
 		 949 aa  524  1e-147  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1725  FAD linked oxidase domain protein  36.69 
 
 		 937 aa  513  1e-144  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.250362  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13795  predicted protein  31.98 
 
 		 983 aa  476  1e-132  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0857019  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1756  oxidoreductase, FAD-binding, iron-sulfur cluster-binding  28.41 
 
 		 923 aa  457  1e-127  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1936  oxidoreductase, FAD-binding, iron-sulfur cluster-binding  28.09 
 
 		 923 aa  452  1e-125  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1470  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.32 
 
 		 997 aa  230  9e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.271002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0464  hypothetical protein  26.08 
 
 		 984 aa  223  9.999999999999999e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0764  FAD linked oxidase domain protein  28.42 
 
 		 987 aa  218  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0289  FAD linked oxidase domain protein  26.36 
 
 		 976 aa  213  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0560  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.63 
 
 		 976 aa  208  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.389138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32250  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  28.02 
 
 		 974 aa  207  8e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2896  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.05 
 
 		 1035 aa  206  1e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.228282  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2991  FAD linked oxidase-like  26.97 
 
 		 1013 aa  206  3e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.207062 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1787  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.18 
 
 		 948 aa  204  5e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0862  FAD linked oxidase domain protein  28.96 
 
 		 1050 aa  204  8e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.961575  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4803  FAD linked oxidase domain protein  29.26 
 
 		 976 aa  202  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2125  FAD linked oxidase domain protein  26.68 
 
 		 1015 aa  202  3e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3858  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.66 
 
 		 978 aa  201  5e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.738511  hitchhiker  0.000383652 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1163  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.67 
 
 		 961 aa  201  7e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.25056  normal  0.360544 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0509  FAD linked oxidase domain protein  26.66 
 
 		 1024 aa  201  7e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4130  FAD linked oxidase domain protein  28.5 
 
 		 975 aa  201  7.999999999999999e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419398  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2117  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.5 
 
 		 973 aa  198  3e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.715118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2130  FAD linked oxidase domain protein  27.61 
 
 		 973 aa  197  7e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0858  FAD linked oxidase domain protein  28.9 
 
 		 1052 aa  197  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0843  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.08 
 
 		 1011 aa  196  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.505983 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4174  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.29 
 
 		 1000 aa  196  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.57181  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0686  FAD linked oxidase domain protein  29.15 
 
 		 985 aa  196  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17651  normal  0.98502 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  28.8 
 
 		 989 aa  195  3e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1074  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.93 
 
 		 1022 aa  193  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.899734  decreased coverage  0.000498092 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08570  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  27.92 
 
 		 945 aa  193  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.695725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3429  oxidoreductase  23.98 
 
 		 975 aa  192  4e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3077  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.48 
 
 		 991 aa  191  7e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2011  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.25 
 
 		 947 aa  190  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00715823  decreased coverage  0.00037047 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0810  hypothetical protein  28.41 
 
 		 1050 aa  188  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2179  FAD linked oxidase domain protein  28.98 
 
 		 894 aa  188  4e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0957  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.51 
 
 		 950 aa  188  5e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1181  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.26 
 
 		 1037 aa  187  6e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.998854 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3402  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.79 
 
 		 989 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6956  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.59 
 
 		 1007 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0369  FAD linked oxidase domain protein  23.72 
 
 		 1002 aa  185  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0362  FAD linked oxidase domain protein  23.82 
 
 		 1006 aa  185  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2375  FAD linked oxidase-like protein  27.81 
 
 		 952 aa  185  4.0000000000000006e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0457  FAD linked oxidase domain protein  27.27 
 
 		 1014 aa  184  5.0000000000000004e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.873167  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0725  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.03 
 
 		 906 aa  185  5.0000000000000004e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2940  FAD linked oxidase domain protein  26.12 
 
 		 1055 aa  184  8.000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4442  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding:FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  27.53 
 
 		 966 aa  183  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3025  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.19 
 
 		 1038 aa  183  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.473379 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3485  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.42 
 
 		 983 aa  183  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2438  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.86 
 
 		 1015 aa  182  2e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.944739  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2720  FAD linked oxidase-like protein  25.77 
 
 		 1024 aa  182  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>