More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1763 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_1439  FAD linked oxidase domain-containing protein  51.3 
 
 		 967 aa  900    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.96855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1339  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.71 
 
 		 934 aa  826    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4737  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  50.7 
 
 		 936 aa  925    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0148478 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2725  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  51.18 
 
 		 941 aa  935    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.191321 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5492  oxidoreductase FAD-binding region  50.97 
 
 		 941 aa  928    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.203928  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4686  oxidoreductase, FAD-binding/iron-sulfur cluster-binding protein  48.86 
 
 		 944 aa  937    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3063  FAD linked oxidase domain protein  51.83 
 
 		 967 aa  904    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1756  oxidoreductase, FAD-binding, iron-sulfur cluster-binding  35.8 
 
 		 923 aa  637    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1521  iron-sulfur cluster-binding protein  46.99 
 
 		 914 aa  839    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13795  predicted protein  43.3 
 
 		 983 aa  762    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0857019  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1271  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.56 
 
 		 934 aa  850    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0752852  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1763  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding:FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  100 
 
 		 923 aa  1898    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.575647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1353  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.71 
 
 		 934 aa  826    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43110  Fe-S/FAD domain protein  51.02 
 
 		 938 aa  918    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326877  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0749  FAD linked oxidase-like  50.49 
 
 		 940 aa  922    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1418  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.34 
 
 		 943 aa  868    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0253  oxidoreductase/iron-sulfur cluster-binding protein  48.38 
 
 		 959 aa  899    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2995  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.6 
 
 		 939 aa  827    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3008  FAD linked oxidase domain protein  45.6 
 
 		 934 aa  825    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000527922 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3604  oxidoreductase  52.64 
 
 		 943 aa  960    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00314932  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3136  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.08 
 
 		 934 aa  838    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.502756 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0694  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  50.59 
 
 		 936 aa  920    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000209119 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1410  4Fe-4S ferredoxin  53.91 
 
 		 960 aa  958    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.787039  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0460  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.29 
 
 		 992 aa  733    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.394566 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2973  FAD linked oxidase-like  50.97 
 
 		 955 aa  884    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.771032  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3228  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  46.62 
 
 		 978 aa  863    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.130904  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4603  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  50.81 
 
 		 936 aa  927    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52713  normal  0.0292343 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1725  FAD linked oxidase domain protein  42.11 
 
 		 937 aa  717    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.250362  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4837  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.3 
 
 		 973 aa  688    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.286258  hitchhiker  0.00000327471 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0908  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.1 
 
 		 942 aa  813    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000203424 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0405  FAD linked oxidase-like protein  52.87 
 
 		 961 aa  949    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0118244  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2723  FAD linked oxidase-like  43.33 
 
 		 955 aa  774    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1376  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.49 
 
 		 934 aa  824    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.915749 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2196  FAD linked oxidase domain protein  49.57 
 
 		 942 aa  916    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2281  FAD linked oxidase-like  44.37 
 
 		 949 aa  827    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0406  FAD linked oxidase-like  48.61 
 
 		 951 aa  867    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.955894  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2735  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.32 
 
 		 934 aa  837    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2808  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.32 
 
 		 934 aa  837    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2794  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.39 
 
 		 934 aa  839    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0072  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  48.83 
 
 		 959 aa  929    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63100  putative ferredoxin  50.65 
 
 		 938 aa  912    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.153244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3171  FAD linked oxidase domain protein  51.29 
 
 		 961 aa  883    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3343  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.04 
 
 		 934 aa  760    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.641395 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4738  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  50.59 
 
 		 936 aa  923    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2905  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.94 
 
 		 934 aa  832    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.520733  normal  0.168522 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2256  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  52.69 
 
 		 937 aa  946    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000277534  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1546  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  47.31 
 
 		 938 aa  867    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.825134  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2440  iron-sulfur cluster-binding protein  46.89 
 
 		 935 aa  825    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1936  oxidoreductase, FAD-binding, iron-sulfur cluster-binding  35.45 
 
 		 923 aa  630  1e-179  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4141  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.51 
 
 		 941 aa  616  1e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3728  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.73 
 
 		 966 aa  600  1e-170  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0224472  normal  0.621627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4610  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.32 
 
 		 928 aa  593  1e-168  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.119537 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0184  FAD linked oxidase domain protein  38.62 
 
 		 967 aa  582  1e-164  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2934  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.92 
 
 		 966 aa  574  1.0000000000000001e-162  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0048436  hitchhiker  0.00113857 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2007  FAD linked oxidase-like  36.54 
 
 		 955 aa  568  1e-160  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2130  FAD linked oxidase domain protein  27.54 
 
 		 973 aa  241  5.999999999999999e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2375  FAD linked oxidase-like protein  27.11 
 
 		 952 aa  217  9e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11033  FAD linked oxidase-like protein  23.73 
 
 		 967 aa  208  3e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4811  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.25 
 
 		 971 aa  208  4e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3155  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.4 
 
 		 983 aa  206  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5063  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.71 
 
 		 1009 aa  206  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2417  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.59 
 
 		 977 aa  204  6e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2129  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.65 
 
 		 968 aa  202  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702869  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6956  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.61 
 
 		 1007 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4692  FAD linked oxidase domain protein  25.51 
 
 		 996 aa  200  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0507445  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0843  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.97 
 
 		 1011 aa  199  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.505983 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1924  FAD linked oxidase-like  26.2 
 
 		 967 aa  199  2.0000000000000003e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0626  hypothetical protein  25.31 
 
 		 930 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5632  D-lactate dehydrogenase  27.4 
 
 		 1007 aa  199  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32250  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  27.54 
 
 		 974 aa  198  3e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4649  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.65 
 
 		 1034 aa  197  5.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2117  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.16 
 
 		 973 aa  197  7e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.715118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3429  oxidoreductase  25.34 
 
 		 975 aa  197  8.000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3016  FAD linked oxidase domain protein  26.8 
 
 		 1010 aa  196  1e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.17034  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5731  D-lactate dehydrogenase / anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  25.59 
 
 		 984 aa  194  6e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2940  FAD linked oxidase domain protein  25.87 
 
 		 1055 aa  194  9e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4174  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.35 
 
 		 1000 aa  192  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.57181  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1163  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.41 
 
 		 961 aa  192  2.9999999999999997e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.25056  normal  0.360544 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1181  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.28 
 
 		 1037 aa  191  4e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.998854 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2905  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.73 
 
 		 995 aa  191  5e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4803  FAD linked oxidase domain protein  26.86 
 
 		 976 aa  191  7e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2896  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.73 
 
 		 1035 aa  191  7e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.228282  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0210  FAD linked oxidase domain protein  25.27 
 
 		 1032 aa  191  8e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.23019 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1983  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.45 
 
 		 1031 aa  190  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2438  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.66 
 
 		 1015 aa  189  2e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.944739  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3025  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.99 
 
 		 1038 aa  189  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.473379 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3126  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.13 
 
 		 962 aa  188  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0464  hypothetical protein  24.29 
 
 		 984 aa  187  5e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0509  FAD linked oxidase domain protein  25.8 
 
 		 1024 aa  187  6e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3077  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.52 
 
 		 991 aa  187  7e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4725  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.92 
 
 		 976 aa  185  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.881602  hitchhiker  0.000909988 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3485  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.81 
 
 		 983 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4256  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.82 
 
 		 1005 aa  184  9.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0862  FAD linked oxidase domain protein  26.77 
 
 		 1050 aa  183  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.961575  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1400  FAD linked oxidase domain protein  25.99 
 
 		 1023 aa  183  1e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3054  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.79 
 
 		 1032 aa  182  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267975 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.24 
 
 		 999 aa  181  5.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4859  FAD linked oxidase domain protein  24.95 
 
 		 1043 aa  181  7e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0821468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3764  FAD linked oxidase domain protein  25.41 
 
 		 1070 aa  179  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0200676  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2904  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.79 
 
 		 1025 aa  179  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.83736  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>