More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1756 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3228  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.12 
 
 
978 aa  660    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.130904  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3008  FAD linked oxidase domain protein  38.19 
 
 
934 aa  658    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000527922 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1936  oxidoreductase, FAD-binding, iron-sulfur cluster-binding  97.29 
 
 
923 aa  1816    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1756  oxidoreductase, FAD-binding, iron-sulfur cluster-binding  100 
 
 
923 aa  1863    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1521  iron-sulfur cluster-binding protein  38.57 
 
 
914 aa  645    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1763  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding:FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  35.8 
 
 
923 aa  637    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.575647  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3604  oxidoreductase  38.36 
 
 
943 aa  657    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00314932  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1339  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.36 
 
 
934 aa  657    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43110  Fe-S/FAD domain protein  36.65 
 
 
938 aa  637    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326877  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2995  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.5 
 
 
939 aa  640    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2725  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.49 
 
 
941 aa  647    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.191321 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2735  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.54 
 
 
934 aa  667    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1376  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.43 
 
 
934 aa  661    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.915749 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2808  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.64 
 
 
934 aa  670    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2794  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.66 
 
 
934 aa  649    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1271  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.11 
 
 
934 aa  647    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0752852  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0072  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.94 
 
 
959 aa  647    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1353  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.36 
 
 
934 aa  657    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0908  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.03 
 
 
942 aa  643    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000203424 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2905  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.43 
 
 
934 aa  663    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.520733  normal  0.168522 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2196  FAD linked oxidase domain protein  37.91 
 
 
942 aa  655    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2440  iron-sulfur cluster-binding protein  37.67 
 
 
935 aa  649    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3136  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.31 
 
 
934 aa  672    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.502756 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4686  oxidoreductase, FAD-binding/iron-sulfur cluster-binding protein  37.71 
 
 
944 aa  633  1e-180  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1410  4Fe-4S ferredoxin  37.73 
 
 
960 aa  634  1e-180  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.787039  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0405  FAD linked oxidase-like protein  36 
 
 
961 aa  630  1e-179  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0118244  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2973  FAD linked oxidase-like  34.44 
 
 
955 aa  625  1e-178  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.771032  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2256  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.93 
 
 
937 aa  627  1e-178  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000277534  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4738  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.66 
 
 
936 aa  624  1e-177  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4603  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.83 
 
 
936 aa  624  1e-177  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52713  normal  0.0292343 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0694  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.45 
 
 
936 aa  625  1e-177  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000209119 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3063  FAD linked oxidase domain protein  34.55 
 
 
967 aa  622  1e-177  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4737  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.61 
 
 
936 aa  619  1e-176  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0148478 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3171  FAD linked oxidase domain protein  34.76 
 
 
961 aa  618  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1418  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.72 
 
 
943 aa  618  1e-175  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0749  FAD linked oxidase-like  36.22 
 
 
940 aa  615  9.999999999999999e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0253  oxidoreductase/iron-sulfur cluster-binding protein  36.95 
 
 
959 aa  612  9.999999999999999e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1439  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.5 
 
 
967 aa  612  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.96855  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0406  FAD linked oxidase-like  35.11 
 
 
951 aa  614  9.999999999999999e-175  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.955894  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1546  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.5 
 
 
938 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.825134  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5492  oxidoreductase FAD-binding region  36.21 
 
 
941 aa  608  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.203928  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2281  FAD linked oxidase-like  35.72 
 
 
949 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63100  putative ferredoxin  36.11 
 
 
938 aa  602  1e-170  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.153244  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13795  predicted protein  32.93 
 
 
983 aa  566  1e-160  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0857019  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2723  FAD linked oxidase-like  33.16 
 
 
955 aa  561  1e-158  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3343  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.28 
 
 
934 aa  556  1e-157  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.641395 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1725  FAD linked oxidase domain protein  33.58 
 
 
937 aa  538  1e-151  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.250362  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0460  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.18 
 
 
992 aa  522  1e-146  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.394566 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3728  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.5 
 
 
966 aa  507  9.999999999999999e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0224472  normal  0.621627 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4141  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.36 
 
 
941 aa  503  1e-141  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2934  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.35 
 
 
966 aa  489  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0048436  hitchhiker  0.00113857 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4837  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.7 
 
 
973 aa  478  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.286258  hitchhiker  0.00000327471 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4610  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.22 
 
 
928 aa  462  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.119537 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0184  FAD linked oxidase domain protein  28.3 
 
 
967 aa  455  1.0000000000000001e-126  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2007  FAD linked oxidase-like  29.09 
 
 
955 aa  417  9.999999999999999e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0626  hypothetical protein  25.22 
 
 
930 aa  189  3e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4811  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.23 
 
 
971 aa  186  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2991  FAD linked oxidase-like  23.69 
 
 
1013 aa  185  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.207062 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4692  FAD linked oxidase domain protein  24.46 
 
 
996 aa  179  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0507445  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11033  FAD linked oxidase-like protein  27.8 
 
 
967 aa  177  8e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3077  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.86 
 
 
991 aa  175  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0457  FAD linked oxidase domain protein  24.17 
 
 
1014 aa  172  2e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.873167  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6956  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  21.38 
 
 
1007 aa  172  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2375  FAD linked oxidase-like protein  21.87 
 
 
952 aa  171  5e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5063  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.32 
 
 
1009 aa  171  5e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424632  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1983  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  20.48 
 
 
1031 aa  170  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4725  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25 
 
 
976 aa  170  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.881602  hitchhiker  0.000909988 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2130  FAD linked oxidase domain protein  21.04 
 
 
973 aa  169  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2125  FAD linked oxidase domain protein  21.96 
 
 
1015 aa  169  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4256  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  22.47 
 
 
1005 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3155  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.64 
 
 
983 aa  165  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1163  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  22.41 
 
 
961 aa  163  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.25056  normal  0.360544 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2438  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.46 
 
 
1015 aa  163  2e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.944739  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0560  FAD linked oxidase domain-containing protein  21.6 
 
 
976 aa  162  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.389138  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0369  FAD linked oxidase domain protein  25 
 
 
1002 aa  160  8e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0362  FAD linked oxidase domain protein  24.86 
 
 
1006 aa  159  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4649  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.6 
 
 
1034 aa  159  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3025  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.44 
 
 
1038 aa  158  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.473379 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3858  FAD linked oxidase domain-containing protein  21.4 
 
 
978 aa  158  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.738511  hitchhiker  0.000383652 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4442  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding:FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  21.82 
 
 
966 aa  157  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0210  FAD linked oxidase domain protein  23.69 
 
 
1032 aa  157  6e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.23019 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1924  FAD linked oxidase-like  23.14 
 
 
967 aa  156  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3429  oxidoreductase  23.89 
 
 
975 aa  156  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3764  FAD linked oxidase domain protein  23.65 
 
 
1070 aa  155  4e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0200676  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2940  FAD linked oxidase domain protein  22.46 
 
 
1055 aa  154  8e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2417  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.1 
 
 
977 aa  152  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3324  D-lactate dehydrogenase  24.11 
 
 
973 aa  153  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1604  hypothetical protein  23.39 
 
 
966 aa  152  3e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2176  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.71 
 
 
1018 aa  150  9e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0114816 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  24.8 
 
 
470 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2117  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  22.13 
 
 
973 aa  150  1.0000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.715118  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4803  FAD linked oxidase domain protein  20.22 
 
 
976 aa  150  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3402  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  21.44 
 
 
989 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3485  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.36 
 
 
983 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1787  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  21.42 
 
 
948 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2129  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.77 
 
 
968 aa  149  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702869  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5731  D-lactate dehydrogenase / anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  25.22 
 
 
984 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  20.41 
 
 
999 aa  150  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2905  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.49 
 
 
995 aa  149  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129344  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0957  FAD linked oxidase domain-containing protein  21.16 
 
 
950 aa  148  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.36697 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>