More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4686 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3343  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.43 
 
 		 934 aa  746    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.641395 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4737  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  53.95 
 
 		 936 aa  1033    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0148478 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4738  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  53.94 
 
 		 936 aa  1034    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4686  oxidoreductase, FAD-binding/iron-sulfur cluster-binding protein  100 
 
 		 944 aa  1955    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1521  iron-sulfur cluster-binding protein  42.76 
 
 		 914 aa  764    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3008  FAD linked oxidase domain protein  42.28 
 
 		 934 aa  781    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000527922 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43110  Fe-S/FAD domain protein  53.12 
 
 		 938 aa  1019    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326877  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2995  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.35 
 
 		 939 aa  783    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1763  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding:FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  48.86 
 
 		 923 aa  937    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.575647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1725  FAD linked oxidase domain protein  43.8 
 
 		 937 aa  793    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.250362  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4837  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.34 
 
 		 973 aa  656    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.286258  hitchhiker  0.00000327471 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2440  iron-sulfur cluster-binding protein  42.93 
 
 		 935 aa  780    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0749  FAD linked oxidase-like  54.83 
 
 		 940 aa  1045    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13795  predicted protein  42.9 
 
 		 983 aa  815    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0857019  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4603  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  54.06 
 
 		 936 aa  1035    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52713  normal  0.0292343 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1353  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.17 
 
 		 934 aa  780    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1546  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  49.15 
 
 		 938 aa  940    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.825134  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3604  oxidoreductase  53.18 
 
 		 943 aa  1031    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00314932  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0908  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.76 
 
 		 942 aa  782    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000203424 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1410  4Fe-4S ferredoxin  51.03 
 
 		 960 aa  938    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.787039  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2725  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  51.8 
 
 		 941 aa  1021    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.191321 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2196  FAD linked oxidase domain protein  52.23 
 
 		 942 aa  1017    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2973  FAD linked oxidase-like  49.68 
 
 		 955 aa  939    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.771032  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0460  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.8 
 
 		 992 aa  775    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.394566 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5492  oxidoreductase FAD-binding region  53.33 
 
 		 941 aa  1022    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.203928  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1376  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.28 
 
 		 934 aa  781    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.915749 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2256  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  51.27 
 
 		 937 aa  983    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000277534  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0405  FAD linked oxidase-like protein  53.57 
 
 		 961 aa  1014    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0118244  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2723  FAD linked oxidase-like  43.75 
 
 		 955 aa  808    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1339  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.17 
 
 		 934 aa  780    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0694  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  53.9 
 
 		 936 aa  1023    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000209119 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2281  FAD linked oxidase-like  52.83 
 
 		 949 aa  999    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0406  FAD linked oxidase-like  46.19 
 
 		 951 aa  867    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.955894  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0072  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  53.76 
 
 		 959 aa  1020    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2735  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.6 
 
 		 934 aa  786    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3228  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  49.21 
 
 		 978 aa  979    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.130904  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2808  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.72 
 
 		 934 aa  785    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1418  FAD linked oxidase domain-containing protein  58.21 
 
 		 943 aa  1142    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1271  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.28 
 
 		 934 aa  770    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0752852  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2794  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.3 
 
 		 934 aa  791    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63100  putative ferredoxin  53.23 
 
 		 938 aa  1013    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.153244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0253  oxidoreductase/iron-sulfur cluster-binding protein  57.28 
 
 		 959 aa  1125    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4141  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.17 
 
 		 941 aa  639    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3171  FAD linked oxidase domain protein  49.68 
 
 		 961 aa  936    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1439  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.26 
 
 		 967 aa  937    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.96855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2905  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.49 
 
 		 934 aa  781    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.520733  normal  0.168522 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3063  FAD linked oxidase domain protein  50.11 
 
 		 967 aa  953    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3136  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.09 
 
 		 934 aa  785    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.502756 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1756  oxidoreductase, FAD-binding, iron-sulfur cluster-binding  37.71 
 
 		 923 aa  633  1e-180  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1936  oxidoreductase, FAD-binding, iron-sulfur cluster-binding  37.18 
 
 		 923 aa  624  1e-177  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3728  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.26 
 
 		 966 aa  609  1e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0224472  normal  0.621627 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2934  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.57 
 
 		 966 aa  592  1e-168  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0048436  hitchhiker  0.00113857 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2007  FAD linked oxidase-like  36.08 
 
 		 955 aa  581  1e-164  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4610  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.97 
 
 		 928 aa  565  1.0000000000000001e-159  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.119537 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0184  FAD linked oxidase domain protein  34 
 
 		 967 aa  544  1e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32250  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  26.68 
 
 		 974 aa  219  1e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2130  FAD linked oxidase domain protein  26.72 
 
 		 973 aa  217  7e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1470  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.37 
 
 		 997 aa  208  4e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.271002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4811  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.05 
 
 		 971 aa  197  9e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2117  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.62 
 
 		 973 aa  193  1e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.715118  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0601  FAD linked oxidase domain protein  26.88 
 
 		 997 aa  189  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431766  normal  0.0923771 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2125  FAD linked oxidase domain protein  24.06 
 
 		 1015 aa  185  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3016  FAD linked oxidase domain protein  24.45 
 
 		 1010 aa  185  3e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.17034  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4692  FAD linked oxidase domain protein  23.24 
 
 		 996 aa  183  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0507445  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4803  FAD linked oxidase domain protein  25.14 
 
 		 976 aa  183  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3429  oxidoreductase  24.42 
 
 		 975 aa  182  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4174  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.03 
 
 		 1000 aa  181  4.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.57181  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  25.63 
 
 		 989 aa  181  5.999999999999999e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2940  FAD linked oxidase domain protein  25.42 
 
 		 1055 aa  181  7e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0464  hypothetical protein  22.36 
 
 		 984 aa  180  1e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2441  FAD/FMN-containing dehydrogenase  27.07 
 
 		 532 aa  180  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11033  FAD linked oxidase-like protein  26.34 
 
 		 967 aa  180  1e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2129  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.41 
 
 		 968 aa  179  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702869  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1787  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.03 
 
 		 948 aa  179  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0457  FAD linked oxidase domain protein  23.97 
 
 		 1014 aa  177  7e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.873167  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6956  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.04 
 
 		 1007 aa  177  8e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2375  FAD linked oxidase-like protein  22.69 
 
 		 952 aa  176  2.9999999999999996e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0509  FAD linked oxidase domain protein  23.91 
 
 		 1024 aa  174  9e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4256  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.79 
 
 		 1005 aa  173  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2438  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.71 
 
 		 1015 aa  173  1e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.944739  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.68 
 
 		 464 aa  172  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0626  hypothetical protein  24 
 
 		 930 aa  172  3e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1163  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.38 
 
 		 961 aa  171  8e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.25056  normal  0.360544 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0728  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.19 
 
 		 995 aa  170  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4130  FAD linked oxidase domain protein  24.46 
 
 		 975 aa  170  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419398  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2991  FAD linked oxidase-like  23.35 
 
 		 1013 aa  169  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.207062 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3858  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.15 
 
 		 978 aa  169  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.738511  hitchhiker  0.000383652 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3764  FAD linked oxidase domain protein  24.32 
 
 		 1070 aa  167  5.9999999999999996e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0200676  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5632  D-lactate dehydrogenase  22.85 
 
 		 1007 aa  167  8e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2547  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.03 
 
 		 1023 aa  167  1.0000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.846231  normal  0.179542 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5063  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.31 
 
 		 1009 aa  166  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4859  FAD linked oxidase domain protein  24.46 
 
 		 1043 aa  165  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0821468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2720  FAD linked oxidase-like protein  22.44 
 
 		 1024 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0600  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.3 
 
 		 1025 aa  164  7e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1181  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.74 
 
 		 1037 aa  164  8.000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.998854 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0725  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.14 
 
 		 906 aa  163  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4442  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding:FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  22.32 
 
 		 966 aa  162  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2896  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.19 
 
 		 1035 aa  162  2e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.228282  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.73 
 
 		 469 aa  162  3e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0210  FAD linked oxidase domain protein  23.01 
 
 		 1032 aa  162  3e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.23019 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>