More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_43110 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009355  OSTLU_13795  predicted protein  44.21 
 
 
983 aa  811    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0857019  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0694  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  77.94 
 
 
936 aa  1532    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000209119 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3171  FAD linked oxidase domain protein  52.71 
 
 
961 aa  890    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4737  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  79.36 
 
 
936 aa  1557    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0148478 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2995  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.73 
 
 
939 aa  782    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4686  oxidoreductase, FAD-binding/iron-sulfur cluster-binding protein  53.12 
 
 
944 aa  1019    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1756  oxidoreductase, FAD-binding, iron-sulfur cluster-binding  36.65 
 
 
923 aa  637    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1521  iron-sulfur cluster-binding protein  44.5 
 
 
914 aa  796    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1339  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.03 
 
 
934 aa  786    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3008  FAD linked oxidase domain protein  43.13 
 
 
934 aa  786    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000527922 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1763  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding:FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  51.02 
 
 
923 aa  918    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.575647  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3343  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.21 
 
 
934 aa  761    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.641395 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0460  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.93 
 
 
992 aa  738    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.394566 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1353  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.03 
 
 
934 aa  786    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0749  FAD linked oxidase-like  75.83 
 
 
940 aa  1494    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4738  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  78.72 
 
 
936 aa  1545    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1376  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.15 
 
 
934 aa  788    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.915749 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4603  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  79.36 
 
 
936 aa  1558    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52713  normal  0.0292343 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5492  oxidoreductase FAD-binding region  79.72 
 
 
941 aa  1553    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.203928  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1546  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  49.52 
 
 
938 aa  919    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.825134  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3604  oxidoreductase  54.24 
 
 
943 aa  1019    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00314932  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1439  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.02 
 
 
967 aa  909    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.96855  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3136  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.2 
 
 
934 aa  766    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.502756 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1410  4Fe-4S ferredoxin  56.89 
 
 
960 aa  999    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.787039  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1418  FAD linked oxidase domain-containing protein  53.56 
 
 
943 aa  1014    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2973  FAD linked oxidase-like  53.16 
 
 
955 aa  902    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.771032  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3228  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  48.72 
 
 
978 aa  902    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.130904  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4837  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.89 
 
 
973 aa  704    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.286258  hitchhiker  0.00000327471 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0405  FAD linked oxidase-like protein  56.59 
 
 
961 aa  1017    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0118244  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2725  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  55.9 
 
 
941 aa  1042    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.191321 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1271  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.46 
 
 
934 aa  798    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0752852  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2723  FAD linked oxidase-like  42.51 
 
 
955 aa  753    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0072  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  53.35 
 
 
959 aa  1025    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43110  Fe-S/FAD domain protein  100 
 
 
938 aa  1915    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326877  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2281  FAD linked oxidase-like  51.38 
 
 
949 aa  960    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0406  FAD linked oxidase-like  49.04 
 
 
951 aa  874    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.955894  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2735  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.62 
 
 
934 aa  792    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2808  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.51 
 
 
934 aa  790    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2794  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.81 
 
 
934 aa  769    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0253  oxidoreductase/iron-sulfur cluster-binding protein  54.25 
 
 
959 aa  1022    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63100  putative ferredoxin  80.36 
 
 
938 aa  1546    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.153244  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1725  FAD linked oxidase domain protein  46.49 
 
 
937 aa  810    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.250362  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4141  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.54 
 
 
941 aa  663    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0908  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.59 
 
 
942 aa  764    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000203424 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2440  iron-sulfur cluster-binding protein  45.59 
 
 
935 aa  796    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2256  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  55.1 
 
 
937 aa  1034    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000277534  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2196  FAD linked oxidase domain protein  54.04 
 
 
942 aa  1021    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2905  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.51 
 
 
934 aa  789    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.520733  normal  0.168522 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3063  FAD linked oxidase domain protein  53.24 
 
 
967 aa  908    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1936  oxidoreductase, FAD-binding, iron-sulfur cluster-binding  36.11 
 
 
923 aa  628  1e-178  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3728  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.08 
 
 
966 aa  626  1e-178  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0224472  normal  0.621627 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2007  FAD linked oxidase-like  39.02 
 
 
955 aa  626  1e-178  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2934  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.87 
 
 
966 aa  614  9.999999999999999e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0048436  hitchhiker  0.00113857 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4610  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.57 
 
 
928 aa  604  1.0000000000000001e-171  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.119537 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0184  FAD linked oxidase domain protein  38.66 
 
 
967 aa  582  1e-164  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2117  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.05 
 
 
973 aa  206  1e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.715118  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4692  FAD linked oxidase domain protein  27.6 
 
 
996 aa  197  6e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0507445  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2940  FAD linked oxidase domain protein  26.95 
 
 
1055 aa  196  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  26.96 
 
 
989 aa  195  3e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0560  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.84 
 
 
976 aa  193  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.389138  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2896  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.46 
 
 
1035 aa  192  2e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.228282  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3764  FAD linked oxidase domain protein  26.36 
 
 
1070 aa  190  1e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0200676  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3485  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.17 
 
 
983 aa  189  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2547  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.17 
 
 
1023 aa  189  3e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.846231  normal  0.179542 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3858  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.98 
 
 
978 aa  188  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.738511  hitchhiker  0.000383652 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11033  FAD linked oxidase-like protein  24.31 
 
 
967 aa  188  4e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1983  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.82 
 
 
1031 aa  186  3e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2130  FAD linked oxidase domain protein  25.18 
 
 
973 aa  184  8.000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4174  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.58 
 
 
1000 aa  181  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.57181  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1470  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.64 
 
 
997 aa  181  4.999999999999999e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.271002  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2375  FAD linked oxidase-like protein  26.29 
 
 
952 aa  180  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0957  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.12 
 
 
950 aa  179  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3016  FAD linked oxidase domain protein  25.45 
 
 
1010 aa  178  5e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.17034  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2991  FAD linked oxidase-like  24.11 
 
 
1013 aa  176  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.207062 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4811  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.22 
 
 
971 aa  176  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32250  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  26.13 
 
 
974 aa  175  3.9999999999999995e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3077  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.87 
 
 
991 aa  175  3.9999999999999995e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0457  FAD linked oxidase domain protein  25.27 
 
 
1014 aa  174  9e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.873167  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2905  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.24 
 
 
995 aa  173  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129344  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0464  hypothetical protein  23.48 
 
 
984 aa  173  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4204  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.88 
 
 
990 aa  172  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0106272  normal  0.500842 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4803  FAD linked oxidase domain protein  26.04 
 
 
976 aa  171  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1181  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.84 
 
 
1037 aa  171  6e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.998854 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5632  D-lactate dehydrogenase  25.69 
 
 
1007 aa  171  7e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0509  FAD linked oxidase domain protein  25.78 
 
 
1024 aa  170  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0843  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.99 
 
 
1011 aa  170  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.505983 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3429  oxidoreductase  24.03 
 
 
975 aa  170  1e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2770  putative FAD-dependent oxidoreductase  24.79 
 
 
999 aa  169  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2129  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.34 
 
 
968 aa  168  2.9999999999999998e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702869  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2438  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.31 
 
 
1015 aa  168  4e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.944739  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3126  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.62 
 
 
962 aa  168  4e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6956  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.57 
 
 
1007 aa  168  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4721  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.62 
 
 
990 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00766177 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4574  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.3 
 
 
990 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0207313 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1163  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.68 
 
 
961 aa  166  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.25056  normal  0.360544 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0862  FAD linked oxidase domain protein  25.78 
 
 
1050 aa  165  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.961575  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4859  FAD linked oxidase domain protein  24.81 
 
 
1043 aa  165  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0821468  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2768  FAD linked oxidase domain protein  25.41 
 
 
974 aa  165  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834372  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0988  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.43 
 
 
475 aa  164  7e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0857891  hitchhiker  0.00240363 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3155  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.17 
 
 
983 aa  163  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>