More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3136 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2995  FAD linked oxidase domain-containing protein  82.75 
 
 		 939 aa  1644    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3343  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.94 
 
 		 934 aa  662    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.641395 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3171  FAD linked oxidase domain protein  44.14 
 
 		 961 aa  769    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4737  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.34 
 
 		 936 aa  778    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0148478 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4686  oxidoreductase, FAD-binding/iron-sulfur cluster-binding protein  43.09 
 
 		 944 aa  785    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1756  oxidoreductase, FAD-binding, iron-sulfur cluster-binding  38.31 
 
 		 923 aa  672    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1521  iron-sulfur cluster-binding protein  82.6 
 
 		 914 aa  1587    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0908  FAD linked oxidase domain-containing protein  78.89 
 
 		 942 aa  1562    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000203424 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0694  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  44.05 
 
 		 936 aa  779    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000209119 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1546  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43 
 
 		 938 aa  779    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.825134  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1763  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding:FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  46.08 
 
 		 923 aa  838    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.575647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2256  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  46.01 
 
 		 937 aa  813    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000277534  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2725  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  45.4 
 
 		 941 aa  825    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.191321 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1339  FAD linked oxidase domain-containing protein  85.55 
 
 		 934 aa  1664    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0749  FAD linked oxidase-like  43.76 
 
 		 940 aa  773    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3063  FAD linked oxidase domain protein  43.82 
 
 		 967 aa  778    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13795  predicted protein  39.06 
 
 		 983 aa  692    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0857019  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1271  FAD linked oxidase domain-containing protein  83.08 
 
 		 934 aa  1623    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0752852  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4837  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.38 
 
 		 973 aa  653    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.286258  hitchhiker  0.00000327471 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1725  FAD linked oxidase domain protein  40.11 
 
 		 937 aa  679    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.250362  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3604  oxidoreductase  45.6 
 
 		 943 aa  841    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00314932  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1410  4Fe-4S ferredoxin  45.07 
 
 		 960 aa  808    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.787039  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1376  FAD linked oxidase domain-containing protein  85.65 
 
 		 934 aa  1667    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.915749 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2973  FAD linked oxidase-like  44.47 
 
 		 955 aa  772    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.771032  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1439  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.14 
 
 		 967 aa  759    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.96855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0405  FAD linked oxidase-like protein  44.37 
 
 		 961 aa  816    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0118244  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4738  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.95 
 
 		 936 aa  780    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1353  FAD linked oxidase domain-containing protein  85.55 
 
 		 934 aa  1664    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2723  FAD linked oxidase-like  39.72 
 
 		 955 aa  708    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1936  oxidoreductase, FAD-binding, iron-sulfur cluster-binding  38.03 
 
 		 923 aa  672    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2281  FAD linked oxidase-like  41.37 
 
 		 949 aa  763    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0406  FAD linked oxidase-like  41.04 
 
 		 951 aa  741    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.955894  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3008  FAD linked oxidase domain protein  85.33 
 
 		 934 aa  1661    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000527922 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2735  FAD linked oxidase domain-containing protein  86.19 
 
 		 934 aa  1696    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2808  FAD linked oxidase domain-containing protein  86.19 
 
 		 934 aa  1695    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0072  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.84 
 
 		 959 aa  813    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3136  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 		 934 aa  1941    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.502756 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2794  FAD linked oxidase domain-containing protein  82.87 
 
 		 934 aa  1653    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4603  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.45 
 
 		 936 aa  781    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52713  normal  0.0292343 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3228  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.65 
 
 		 978 aa  798    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.130904  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63100  putative ferredoxin  44.52 
 
 		 938 aa  788    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.153244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2196  FAD linked oxidase domain protein  43.74 
 
 		 942 aa  824    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5492  oxidoreductase FAD-binding region  44.52 
 
 		 941 aa  787    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.203928  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2905  FAD linked oxidase domain-containing protein  86.4 
 
 		 934 aa  1699    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.520733  normal  0.168522 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43110  Fe-S/FAD domain protein  43.2 
 
 		 938 aa  766    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326877  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2440  iron-sulfur cluster-binding protein  78.59 
 
 		 935 aa  1550    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1418  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.94 
 
 		 943 aa  812    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0253  oxidoreductase/iron-sulfur cluster-binding protein  41.55 
 
 		 959 aa  774    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0460  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.98 
 
 		 992 aa  627  1e-178  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.394566 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4141  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.52 
 
 		 941 aa  598  1e-169  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2007  FAD linked oxidase-like  34.19 
 
 		 955 aa  566  1e-160  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3728  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.62 
 
 		 966 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0224472  normal  0.621627 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2934  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.58 
 
 		 966 aa  556  1e-157  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0048436  hitchhiker  0.00113857 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4610  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.34 
 
 		 928 aa  548  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.119537 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0184  FAD linked oxidase domain protein  33.16 
 
 		 967 aa  530  1e-149  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2117  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.9 
 
 		 973 aa  238  4e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.715118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08570  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  25.48 
 
 		 945 aa  224  8e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.695725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32250  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  27.67 
 
 		 974 aa  220  7.999999999999999e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2130  FAD linked oxidase domain protein  26.3 
 
 		 973 aa  214  7e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11033  FAD linked oxidase-like protein  25.34 
 
 		 967 aa  213  1e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  26.16 
 
 		 989 aa  211  6e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0464  hypothetical protein  24.73 
 
 		 984 aa  208  4e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4174  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.73 
 
 		 1000 aa  208  4e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.57181  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5063  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.9 
 
 		 1009 aa  206  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4859  FAD linked oxidase domain protein  25.8 
 
 		 1043 aa  204  6e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0821468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3858  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.78 
 
 		 978 aa  202  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.738511  hitchhiker  0.000383652 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0560  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.55 
 
 		 976 aa  201  6e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.389138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2125  FAD linked oxidase domain protein  24.46 
 
 		 1015 aa  201  7e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4442  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding:FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  25.05 
 
 		 966 aa  199  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3016  FAD linked oxidase domain protein  26.18 
 
 		 1010 aa  198  3e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.17034  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2129  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.98 
 
 		 968 aa  198  5.000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702869  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1787  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.7 
 
 		 948 aa  196  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1181  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.45 
 
 		 1037 aa  192  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.998854 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3155  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.62 
 
 		 983 aa  192  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1470  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.1 
 
 		 997 aa  193  2e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.271002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0289  FAD linked oxidase domain protein  24.88 
 
 		 976 aa  192  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3485  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.2 
 
 		 983 aa  192  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1983  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.66 
 
 		 1031 aa  191  4e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4811  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.63 
 
 		 971 aa  191  7e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1163  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.26 
 
 		 961 aa  191  8e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.25056  normal  0.360544 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0626  hypothetical protein  27.26 
 
 		 930 aa  189  2e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4130  FAD linked oxidase domain protein  25.6 
 
 		 975 aa  186  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419398  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2991  FAD linked oxidase-like  24.39 
 
 		 1013 aa  184  7e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.207062 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3077  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.73 
 
 		 991 aa  184  9.000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0957  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.63 
 
 		 950 aa  184  9.000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4649  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.78 
 
 		 1034 aa  183  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4725  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.52 
 
 		 976 aa  182  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.881602  hitchhiker  0.000909988 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0843  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.11 
 
 		 1011 aa  182  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.505983 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0725  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.71 
 
 		 906 aa  182  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4075  FAD linked oxidase domain protein  25.56 
 
 		 993 aa  179  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1074  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.62 
 
 		 1022 aa  178  4e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.899734  decreased coverage  0.000498092 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4803  FAD linked oxidase domain protein  25.18 
 
 		 976 aa  178  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2011  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.59 
 
 		 947 aa  176  2.9999999999999996e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00715823  decreased coverage  0.00037047 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.06 
 
 		 999 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0764  FAD linked oxidase domain protein  27.45 
 
 		 987 aa  174  5.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0962  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.07 
 
 		 1006 aa  174  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.108577  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2165  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.71 
 
 		 944 aa  172  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0601  FAD linked oxidase domain protein  27.69 
 
 		 997 aa  173  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431766  normal  0.0923771 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3429  oxidoreductase  24.6 
 
 		 975 aa  172  2e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4692  FAD linked oxidase domain protein  23.71 
 
 		 996 aa  172  3e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0507445  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>