More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1725 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011145  AnaeK_3063  FAD linked oxidase domain protein  46.69 
 
 		 967 aa  785    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2725  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  48.22 
 
 		 941 aa  875    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.191321 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4737  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  45.85 
 
 		 936 aa  801    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0148478 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1271  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.09 
 
 		 934 aa  691    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0752852  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1546  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  44.87 
 
 		 938 aa  808    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.825134  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4686  oxidoreductase, FAD-binding/iron-sulfur cluster-binding protein  43.8 
 
 		 944 aa  798    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0072  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.2 
 
 		 959 aa  786    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1521  iron-sulfur cluster-binding protein  40.77 
 
 		 914 aa  686    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3171  FAD linked oxidase domain protein  46.47 
 
 		 961 aa  771    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1439  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.26 
 
 		 967 aa  759    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.96855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43110  Fe-S/FAD domain protein  46.49 
 
 		 938 aa  816    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326877  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1376  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.73 
 
 		 934 aa  656    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.915749 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0908  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.89 
 
 		 942 aa  689    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000203424 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1763  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding:FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  42.11 
 
 		 923 aa  724    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.575647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0694  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  45.26 
 
 		 936 aa  798    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000209119 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3136  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.11 
 
 		 934 aa  684    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.502756 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1725  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 		 937 aa  1903    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.250362  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0749  FAD linked oxidase-like  45.21 
 
 		 940 aa  813    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1353  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.3 
 
 		 934 aa  651    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3604  oxidoreductase  47.04 
 
 		 943 aa  868    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00314932  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2995  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.92 
 
 		 939 aa  649    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1410  4Fe-4S ferredoxin  45.65 
 
 		 960 aa  761    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.787039  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2196  FAD linked oxidase domain protein  46.24 
 
 		 942 aa  838    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0460  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.1 
 
 		 992 aa  640    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.394566 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2973  FAD linked oxidase-like  46.47 
 
 		 955 aa  769    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.771032  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3008  FAD linked oxidase domain protein  38.41 
 
 		 934 aa  649    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000527922 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4603  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  45.37 
 
 		 936 aa  798    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52713  normal  0.0292343 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2256  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  47.52 
 
 		 937 aa  867    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000277534  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3228  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.18 
 
 		 978 aa  758    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.130904  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0405  FAD linked oxidase-like protein  48.88 
 
 		 961 aa  860    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0118244  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2723  FAD linked oxidase-like  37.88 
 
 		 955 aa  653    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2281  FAD linked oxidase-like  40.69 
 
 		 949 aa  705    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0406  FAD linked oxidase-like  42.57 
 
 		 951 aa  727    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.955894  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2735  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.16 
 
 		 934 aa  660    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2808  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.16 
 
 		 934 aa  660    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4738  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  45.26 
 
 		 936 aa  798    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2794  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.95 
 
 		 934 aa  675    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63100  putative ferredoxin  46.28 
 
 		 938 aa  798    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.153244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1339  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.41 
 
 		 934 aa  652    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0253  oxidoreductase/iron-sulfur cluster-binding protein  43.57 
 
 		 959 aa  769    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5492  oxidoreductase FAD-binding region  45.95 
 
 		 941 aa  794    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.203928  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13795  predicted protein  38.7 
 
 		 983 aa  700    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0857019  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2905  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.94 
 
 		 934 aa  656    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.520733  normal  0.168522 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2440  iron-sulfur cluster-binding protein  40.79 
 
 		 935 aa  675    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1418  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.51 
 
 		 943 aa  768    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3343  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.97 
 
 		 934 aa  622  1e-176  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.641395 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4837  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.91 
 
 		 973 aa  594  1e-168  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.286258  hitchhiker  0.00000327471 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2934  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.64 
 
 		 966 aa  553  1e-156  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0048436  hitchhiker  0.00113857 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4141  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.25 
 
 		 941 aa  550  1e-155  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1756  oxidoreductase, FAD-binding, iron-sulfur cluster-binding  33.58 
 
 		 923 aa  542  9.999999999999999e-153  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1936  oxidoreductase, FAD-binding, iron-sulfur cluster-binding  33.4 
 
 		 923 aa  541  9.999999999999999e-153  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4610  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.25 
 
 		 928 aa  540  9.999999999999999e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.119537 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2007  FAD linked oxidase-like  36.9 
 
 		 955 aa  538  1e-151  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3728  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.39 
 
 		 966 aa  530  1e-149  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0224472  normal  0.621627 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0184  FAD linked oxidase domain protein  36.69 
 
 		 967 aa  513  1e-144  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2375  FAD linked oxidase-like protein  26.46 
 
 		 952 aa  194  7e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2130  FAD linked oxidase domain protein  25.57 
 
 		 973 aa  184  7e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4725  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24 
 
 		 976 aa  182  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.881602  hitchhiker  0.000909988 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2441  FAD/FMN-containing dehydrogenase  30.43 
 
 		 532 aa  179  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3077  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.79 
 
 		 991 aa  179  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3429  oxidoreductase  23.93 
 
 		 975 aa  178  5e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6956  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.38 
 
 		 1007 aa  177  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0843  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.54 
 
 		 1011 aa  175  3.9999999999999995e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.505983 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4692  FAD linked oxidase domain protein  24.74 
 
 		 996 aa  172  3e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0507445  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2117  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.84 
 
 		 973 aa  169  2e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.715118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3126  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.1 
 
 		 962 aa  169  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2896  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.77 
 
 		 1035 aa  169  2.9999999999999998e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.228282  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5632  D-lactate dehydrogenase  25.57 
 
 		 1007 aa  168  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0509  FAD linked oxidase domain protein  25.73 
 
 		 1024 aa  166  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0464  hypothetical protein  22.61 
 
 		 984 aa  166  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5063  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.19 
 
 		 1009 aa  166  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2720  FAD linked oxidase-like protein  24.9 
 
 		 1024 aa  166  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2904  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.67 
 
 		 1025 aa  165  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.83736  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4174  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.71 
 
 		 1000 aa  165  4.0000000000000004e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.57181  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1737  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.28 
 
 		 1013 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.187765  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0764  FAD linked oxidase domain protein  25.22 
 
 		 987 aa  164  7e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3858  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.79 
 
 		 978 aa  164  9e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.738511  hitchhiker  0.000383652 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1593  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.98 
 
 		 1013 aa  163  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.125155  normal  0.43288 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2438  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.33 
 
 		 1015 aa  163  2e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.944739  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32250  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  24.47 
 
 		 974 aa  162  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1787  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.08 
 
 		 948 aa  162  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1668  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.28 
 
 		 1013 aa  162  4e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.157229  hitchhiker  0.00241785 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0210  FAD linked oxidase domain protein  23.29 
 
 		 1032 aa  161  6e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.23019 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3025  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.87 
 
 		 1038 aa  161  6e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.473379 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2940  FAD linked oxidase domain protein  24.12 
 
 		 1055 aa  160  7e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4256  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.55 
 
 		 1005 aa  160  8e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4803  FAD linked oxidase domain protein  26.18 
 
 		 976 aa  160  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0686  FAD linked oxidase domain protein  25 
 
 		 985 aa  160  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17651  normal  0.98502 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2643  oxidoreductase, FAD-binding, putative  26.05 
 
 		 1013 aa  159  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1739  oxidase, FAD binding  26.73 
 
 		 1018 aa  159  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1845  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.73 
 
 		 1018 aa  159  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5731  D-lactate dehydrogenase / anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  25.5 
 
 		 984 aa  159  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0560  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.91 
 
 		 976 aa  158  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.389138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0457  FAD linked oxidase domain protein  24.47 
 
 		 1014 aa  158  4e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.873167  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0957  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.58 
 
 		 950 aa  158  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1163  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.83 
 
 		 961 aa  157  7e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.25056  normal  0.360544 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0601  FAD linked oxidase domain protein  25.67 
 
 		 997 aa  157  8e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431766  normal  0.0923771 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2596  hypothetical protein  26.58 
 
 		 1018 aa  157  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1470  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.97 
 
 		 997 aa  157  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.271002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08570  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  25 
 
 		 945 aa  157  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.695725  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>