More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2441 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2441  FAD/FMN-containing dehydrogenase  100 
 
 		 532 aa  1067    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2940  FAD linked oxidase domain protein  30.73 
 
 		 1055 aa  209  9e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1400  FAD linked oxidase domain protein  28.8 
 
 		 1023 aa  206  1e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3858  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.93 
 
 		 978 aa  205  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.738511  hitchhiker  0.000383652 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3764  FAD linked oxidase domain protein  29.31 
 
 		 1070 aa  201  3.9999999999999996e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0200676  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2438  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.75 
 
 		 1015 aa  200  6e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.944739  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2547  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.93 
 
 		 1023 aa  199  1.0000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.846231  normal  0.179542 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2130  FAD linked oxidase domain protein  30.19 
 
 		 973 aa  197  3e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1418  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.47 
 
 		 943 aa  197  4.0000000000000005e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0457  FAD linked oxidase domain protein  30.5 
 
 		 1014 aa  194  3e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.873167  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0626  hypothetical protein  28.19 
 
 		 930 aa  192  9e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0560  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.01 
 
 		 976 aa  191  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.389138  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4686  oxidoreductase, FAD-binding/iron-sulfur cluster-binding protein  27.07 
 
 		 944 aa  190  5e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0460  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.45 
 
 		 992 aa  190  5.999999999999999e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.394566 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1439  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.09 
 
 		 967 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.96855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0509  FAD linked oxidase domain protein  30 
 
 		 1024 aa  187  3e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1725  FAD linked oxidase domain protein  30.43 
 
 		 937 aa  187  4e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.250362  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2896  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.92 
 
 		 1035 aa  187  4e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.228282  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4610  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.55 
 
 		 928 aa  187  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.119537 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2725  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.49 
 
 		 941 aa  187  5e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.191321 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4692  FAD linked oxidase domain protein  28.39 
 
 		 996 aa  186  8e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0507445  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2755  FAD linked oxidase domain protein  29.77 
 
 		 1017 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.190253  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0406  FAD linked oxidase-like  28.46 
 
 		 951 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.955894  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2440  iron-sulfur cluster-binding protein  27.14 
 
 		 935 aa  183  7e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8323  FAD linked oxidase domain protein  30.86 
 
 		 1022 aa  183  9.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.109641  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3054  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.24 
 
 		 1032 aa  182  9.000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267975 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4140  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.21 
 
 		 1017 aa  182  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1410  4Fe-4S ferredoxin  29.87 
 
 		 960 aa  182  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.787039  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4738  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.14 
 
 		 936 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2417  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.12 
 
 		 977 aa  181  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0843  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.87 
 
 		 1011 aa  179  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.505983 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3228  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.57 
 
 		 978 aa  179  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.130904  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3604  oxidoreductase  27.57 
 
 		 943 aa  179  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00314932  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4725  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.06 
 
 		 976 aa  178  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.881602  hitchhiker  0.000909988 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0253  oxidoreductase/iron-sulfur cluster-binding protein  27.91 
 
 		 959 aa  178  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1271  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.95 
 
 		 934 aa  178  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0752852  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4256  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.78 
 
 		 1005 aa  178  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0694  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.58 
 
 		 936 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000209119 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1691  FAD linked oxidase domain protein  29.61 
 
 		 1019 aa  177  4e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.572774  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0210  FAD linked oxidase domain protein  27.79 
 
 		 1032 aa  176  7e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.23019 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0072  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.06 
 
 		 959 aa  176  8e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2196  FAD linked oxidase domain protein  27.43 
 
 		 942 aa  176  9e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4837  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.71 
 
 		 973 aa  176  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.286258  hitchhiker  0.00000327471 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2375  FAD linked oxidase-like protein  30.44 
 
 		 952 aa  176  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63100  putative ferredoxin  27.53 
 
 		 938 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.153244  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4737  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.39 
 
 		 936 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0148478 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0362  FAD linked oxidase domain protein  26.06 
 
 		 1006 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5492  oxidoreductase FAD-binding region  27.53 
 
 		 941 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.203928  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0951  (S)-2-hydroxy-acid dehydrogenase  28.97 
 
 		 456 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0369  FAD linked oxidase domain protein  26.06 
 
 		 1002 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3025  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.6 
 
 		 1038 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.473379 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6956  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.05 
 
 		 1007 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3136  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.09 
 
 		 934 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.502756 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1521  iron-sulfur cluster-binding protein  25.6 
 
 		 914 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2904  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.98 
 
 		 1025 aa  174  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.83736  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4141  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.07 
 
 		 941 aa  174  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6630  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.11 
 
 		 1018 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4603  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.2 
 
 		 936 aa  174  5e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52713  normal  0.0292343 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5622  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.66 
 
 		 1020 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.45368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5785  FAD linked oxidase-like  28.67 
 
 		 1018 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2453  FAD linked oxidase domain protein  28.79 
 
 		 1017 aa  173  5.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.999389  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6150  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.67 
 
 		 1018 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0734  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.51 
 
 		 481 aa  173  6.999999999999999e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.667409 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3171  FAD linked oxidase domain protein  29.98 
 
 		 961 aa  173  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5063  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.21 
 
 		 1009 aa  173  7.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2256  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.88 
 
 		 937 aa  172  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000277534  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3281  FAD linked oxidase-like  28.83 
 
 		 1009 aa  172  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.539054  normal  0.121942 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0953  FAD linked oxidase-like protein  28.29 
 
 		 474 aa  172  1e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  26.02 
 
 		 456 aa  172  1e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1496  FAD linked oxidase  28.4 
 
 		 1018 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.237885  hitchhiker  0.00132557 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1461  FAD linked oxidase domain protein  28.4 
 
 		 1018 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.236754 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1470  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.56 
 
 		 997 aa  172  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.271002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1978  FAD linked oxidase  28.4 
 
 		 1018 aa  172  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000994047 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0600  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.5 
 
 		 1025 aa  171  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0764  FAD linked oxidase domain protein  30.28 
 
 		 987 aa  172  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5809  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.2 
 
 		 1017 aa  172  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1807  FAD linked oxidase  28.26 
 
 		 1018 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.354547  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1509  oxidoreductase, FAD-binding  29.07 
 
 		 1018 aa  172  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.784999  hitchhiker  0.0000155929 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1477  FAD linked oxidase domain protein  28.4 
 
 		 1018 aa  172  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000065688 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1903  oxidoreductase, FAD-binding  29.07 
 
 		 1018 aa  171  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.610317  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0749  FAD linked oxidase-like  26.83 
 
 		 940 aa  171  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3485  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.83 
 
 		 983 aa  171  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1659  FAD linked oxidase domain protein  27.76 
 
 		 1021 aa  171  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.370272  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  27.63 
 
 		 472 aa  171  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1944  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.07 
 
 		 1018 aa  171  3e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150005 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6081  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.39 
 
 		 1023 aa  171  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0150  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.27 
 
 		 977 aa  171  4e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11033  FAD linked oxidase-like protein  26.94 
 
 		 967 aa  170  5e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1546  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.32 
 
 		 938 aa  170  6e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.825134  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01656  predicted FAD-linked oxidoreductase  28.65 
 
 		 1018 aa  169  8e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1888  oxidoreductase, FAD-binding  28.65 
 
 		 1018 aa  170  8e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01645  hypothetical protein  28.65 
 
 		 1018 aa  169  8e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1768  oxidoreductase, FAD-binding  28.65 
 
 		 1018 aa  169  8e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1955  FAD linked oxidase domain protein  28.65 
 
 		 1018 aa  169  9e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.181771  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43110  Fe-S/FAD domain protein  26.73 
 
 		 938 aa  169  9e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326877  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2995  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.13 
 
 		 939 aa  169  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0908  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.51 
 
 		 942 aa  169  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000203424 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2973  FAD linked oxidase-like  29.7 
 
 		 955 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.771032  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3063  FAD linked oxidase domain protein  29.39 
 
 		 967 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2718  FAD linked oxidase-like  29.5 
 
 		 1010 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.400601 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>