More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0734 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0734  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 		 481 aa  950    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.667409 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3485  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.83 
 
 		 983 aa  256  7e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2768  FAD linked oxidase domain protein  29.12 
 
 		 974 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834372  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4721  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.08 
 
 		 990 aa  238  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00766177 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4574  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.13 
 
 		 990 aa  237  4e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0207313 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4204  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.74 
 
 		 990 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0106272  normal  0.500842 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1163  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.25 
 
 		 961 aa  234  2.0000000000000002e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.25056  normal  0.360544 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2896  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.24 
 
 		 1035 aa  234  3e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.228282  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0509  FAD linked oxidase domain protein  26.52 
 
 		 1024 aa  233  4.0000000000000004e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2905  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.77 
 
 		 995 aa  233  7.000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3126  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.69 
 
 		 962 aa  232  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2438  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.9 
 
 		 1015 aa  229  6e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.944739  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3858  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.2 
 
 		 978 aa  227  3e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.738511  hitchhiker  0.000383652 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3025  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.41 
 
 		 1038 aa  227  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.473379 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2991  FAD linked oxidase-like  28.94 
 
 		 1013 aa  226  6e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.207062 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0457  FAD linked oxidase domain protein  28.09 
 
 		 1014 aa  226  9e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.873167  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2375  FAD linked oxidase-like protein  27.72 
 
 		 952 aa  225  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4692  FAD linked oxidase domain protein  28.02 
 
 		 996 aa  224  3e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0507445  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3402  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.42 
 
 		 989 aa  223  4e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5731  D-lactate dehydrogenase / anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  28.14 
 
 		 984 aa  223  6e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2547  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.01 
 
 		 1023 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.846231  normal  0.179542 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3764  FAD linked oxidase domain protein  26.21 
 
 		 1070 aa  221  1.9999999999999999e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0200676  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3429  oxidoreductase  31.41 
 
 		 975 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4803  FAD linked oxidase domain protein  26.24 
 
 		 976 aa  220  3.9999999999999997e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0464  hypothetical protein  27.59 
 
 		 984 aa  219  7.999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0600  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.23 
 
 		 1025 aa  219  1e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6956  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.79 
 
 		 1007 aa  218  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4256  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.22 
 
 		 1005 aa  217  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2720  FAD linked oxidase-like protein  26.2 
 
 		 1024 aa  217  5e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2940  FAD linked oxidase domain protein  25.58 
 
 		 1055 aa  216  5e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0962  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.15 
 
 		 1006 aa  215  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.108577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2179  FAD linked oxidase domain protein  26.71 
 
 		 894 aa  216  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1787  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.28 
 
 		 948 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2130  FAD linked oxidase domain protein  24.71 
 
 		 973 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3054  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.11 
 
 		 1032 aa  214  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267975 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1470  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.5 
 
 		 997 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.271002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08570  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  24.71 
 
 		 945 aa  213  5.999999999999999e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.695725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0560  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.5 
 
 		 976 aa  212  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.389138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0957  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.34 
 
 		 950 aa  212  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.68 
 
 		 1046 aa  209  6e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.433377  normal  0.249121 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2904  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.17 
 
 		 1025 aa  209  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.83736  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3324  D-lactate dehydrogenase  29.45 
 
 		 973 aa  207  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.71 
 
 		 457 aa  208  2e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3016  FAD linked oxidase domain protein  24.03 
 
 		 1010 aa  207  3e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.17034  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0858  FAD linked oxidase domain protein  25.29 
 
 		 1052 aa  207  4e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2125  FAD linked oxidase domain protein  27.1 
 
 		 1015 aa  207  5e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2165  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.56 
 
 		 944 aa  206  7e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1074  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.68 
 
 		 1022 aa  206  8e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.899734  decreased coverage  0.000498092 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0210  FAD linked oxidase domain protein  27.32 
 
 		 1032 aa  206  8e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.23019 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3077  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.72 
 
 		 991 aa  206  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0862  FAD linked oxidase domain protein  25.88 
 
 		 1050 aa  206  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.961575  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0728  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.21 
 
 		 995 aa  205  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0289  FAD linked oxidase domain protein  26.03 
 
 		 976 aa  204  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2844  putative oxidoreductase  26.57 
 
 		 949 aa  204  3e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.788098  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4811  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.16 
 
 		 971 aa  204  3e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  25.73 
 
 		 989 aa  204  3e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4725  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.97 
 
 		 976 aa  204  4e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.881602  hitchhiker  0.000909988 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5632  D-lactate dehydrogenase  26.9 
 
 		 1007 aa  204  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2770  putative FAD-dependent oxidoreductase  23.98 
 
 		 999 aa  203  6e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1181  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.15 
 
 		 1037 aa  203  6e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.998854 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0810  hypothetical protein  24.71 
 
 		 1050 aa  202  7e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1400  FAD linked oxidase domain protein  26.61 
 
 		 1023 aa  202  9.999999999999999e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4442  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding:FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  25.24 
 
 		 966 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0686  FAD linked oxidase domain protein  25.51 
 
 		 985 aa  201  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17651  normal  0.98502 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0626  hypothetical protein  29.17 
 
 		 930 aa  201  3e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2417  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.48 
 
 		 977 aa  199  7e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5581  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.94 
 
 		 1050 aa  199  7e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2117  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.08 
 
 		 973 aa  199  7e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.715118  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0764  FAD linked oxidase domain protein  24.43 
 
 		 987 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0951  (S)-2-hydroxy-acid dehydrogenase  31.55 
 
 		 456 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3296  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.55 
 
 		 473 aa  198  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0160978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.88 
 
 		 999 aa  197  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32250  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  25.2 
 
 		 974 aa  196  6e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2129  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.74 
 
 		 968 aa  195  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702869  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0601  FAD linked oxidase domain protein  24.59 
 
 		 997 aa  195  1e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431766  normal  0.0923771 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4075  FAD linked oxidase domain protein  25.1 
 
 		 993 aa  195  1e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4174  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.37 
 
 		 1000 aa  194  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.57181  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5063  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.78 
 
 		 1009 aa  194  4e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1651  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.34 
 
 		 461 aa  193  4e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1604  hypothetical protein  30 
 
 		 966 aa  193  6e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11033  FAD linked oxidase-like protein  27.01 
 
 		 967 aa  193  7e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1998  oxidoreductase, FAD-binding  25.88 
 
 		 460 aa  192  1e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0843  FAD linked oxidase domain-containing protein  26 
 
 		 1011 aa  192  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.505983 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0392  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.67 
 
 		 460 aa  192  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.769694  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  28.24 
 
 		 470 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  28.24 
 
 		 470 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0362  FAD linked oxidase domain protein  28.6 
 
 		 1006 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0725  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.23 
 
 		 906 aa  192  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  28.45 
 
 		 470 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  28.45 
 
 		 470 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  28.45 
 
 		 470 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  28.24 
 
 		 470 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0988  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.87 
 
 		 475 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0857891  hitchhiker  0.00240363 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  28.48 
 
 		 460 aa  191  2.9999999999999997e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0369  FAD linked oxidase domain protein  28.6 
 
 		 1002 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  28.24 
 
 		 470 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  28.24 
 
 		 470 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  28.24 
 
 		 470 aa  189  7e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2011  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.2 
 
 		 947 aa  189  9e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00715823  decreased coverage  0.00037047 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4130  FAD linked oxidase domain protein  24.84 
 
 		 975 aa  188  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419398  normal  0.98348 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>