More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2973 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_2995  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.92 
 
 
939 aa  818    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4737  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  52.87 
 
 
936 aa  942    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0148478 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4837  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.01 
 
 
973 aa  695    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.286258  hitchhiker  0.00000327471 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5492  oxidoreductase FAD-binding region  53.48 
 
 
941 aa  931    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.203928  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1546  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  50.75 
 
 
938 aa  949    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.825134  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4686  oxidoreductase, FAD-binding/iron-sulfur cluster-binding protein  49.68 
 
 
944 aa  975    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1756  oxidoreductase, FAD-binding, iron-sulfur cluster-binding  34.62 
 
 
923 aa  636    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1521  iron-sulfur cluster-binding protein  43.73 
 
 
914 aa  780    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3136  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.47 
 
 
934 aa  800    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.502756 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0253  oxidoreductase/iron-sulfur cluster-binding protein  49.79 
 
 
959 aa  954    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1763  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding:FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  50.97 
 
 
923 aa  916    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.575647  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0908  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.34 
 
 
942 aa  806    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000203424 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13795  predicted protein  44.77 
 
 
983 aa  824    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0857019  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0694  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  52.39 
 
 
936 aa  927    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000209119 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0749  FAD linked oxidase-like  51.97 
 
 
940 aa  937    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1339  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.41 
 
 
934 aa  800    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3171  FAD linked oxidase domain protein  94.65 
 
 
961 aa  1698    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3604  oxidoreductase  54.93 
 
 
943 aa  1038    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00314932  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3728  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.69 
 
 
966 aa  644    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0224472  normal  0.621627 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1410  4Fe-4S ferredoxin  55.48 
 
 
960 aa  925    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.787039  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2973  FAD linked oxidase-like  100 
 
 
955 aa  1886    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.771032  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2196  FAD linked oxidase domain protein  55.3 
 
 
942 aa  1035    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0072  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  50.05 
 
 
959 aa  949    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1725  FAD linked oxidase domain protein  47.22 
 
 
937 aa  798    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.250362  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0405  FAD linked oxidase-like protein  53.85 
 
 
961 aa  969    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0118244  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1439  FAD linked oxidase domain-containing protein  72.51 
 
 
967 aa  1313    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.96855  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2723  FAD linked oxidase-like  46.19 
 
 
955 aa  838    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2725  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  54.95 
 
 
941 aa  1030    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.191321 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4610  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  45.61 
 
 
928 aa  642    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.119537 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3228  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  51.32 
 
 
978 aa  1028    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.130904  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1376  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.3 
 
 
934 aa  799    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.915749 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2281  FAD linked oxidase-like  47.49 
 
 
949 aa  894    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0406  FAD linked oxidase-like  49.57 
 
 
951 aa  850    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.955894  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4603  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  52.97 
 
 
936 aa  944    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52713  normal  0.0292343 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2735  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.62 
 
 
934 aa  806    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2808  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.62 
 
 
934 aa  807    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3343  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.77 
 
 
934 aa  754    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.641395 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2794  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.73 
 
 
934 aa  805    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63100  putative ferredoxin  53.59 
 
 
938 aa  921    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.153244  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4738  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  53.08 
 
 
936 aa  940    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0460  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  45.7 
 
 
992 aa  746    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.394566 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4141  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.81 
 
 
941 aa  638    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1353  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.41 
 
 
934 aa  799    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3063  FAD linked oxidase domain protein  94.83 
 
 
967 aa  1717    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2256  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  55.01 
 
 
937 aa  1019    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000277534  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2905  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.64 
 
 
934 aa  801    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.520733  normal  0.168522 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43110  Fe-S/FAD domain protein  53.7 
 
 
938 aa  930    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326877  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1271  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.62 
 
 
934 aa  795    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0752852  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2440  iron-sulfur cluster-binding protein  45.03 
 
 
935 aa  806    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1418  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.5 
 
 
943 aa  945    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3008  FAD linked oxidase domain protein  43.41 
 
 
934 aa  800    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000527922 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2934  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.18 
 
 
966 aa  633  1e-180  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0048436  hitchhiker  0.00113857 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0184  FAD linked oxidase domain protein  43.77 
 
 
967 aa  628  1e-178  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1936  oxidoreductase, FAD-binding, iron-sulfur cluster-binding  34.19 
 
 
923 aa  627  1e-178  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2007  FAD linked oxidase-like  41.45 
 
 
955 aa  598  1e-169  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2130  FAD linked oxidase domain protein  28.79 
 
 
973 aa  206  1e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11033  FAD linked oxidase-like protein  24.41 
 
 
967 aa  190  1e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4130  FAD linked oxidase domain protein  28.48 
 
 
975 aa  187  7e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419398  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2375  FAD linked oxidase-like protein  29.71 
 
 
952 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6956  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.63 
 
 
1007 aa  184  6e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4174  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.66 
 
 
1000 aa  182  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.57181  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5731  D-lactate dehydrogenase / anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  27.44 
 
 
984 aa  180  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  28.42 
 
 
989 aa  179  2e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3429  oxidoreductase  24.03 
 
 
975 aa  179  2e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5063  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26 
 
 
1009 aa  179  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424632  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2991  FAD linked oxidase-like  25.98 
 
 
1013 aa  179  3e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.207062 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3025  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.98 
 
 
1038 aa  177  7e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.473379 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0764  FAD linked oxidase domain protein  26.05 
 
 
987 aa  176  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08570  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  28.56 
 
 
945 aa  176  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.695725  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0600  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.28 
 
 
1025 aa  174  9e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2125  FAD linked oxidase domain protein  25.81 
 
 
1015 aa  172  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3155  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.09 
 
 
983 aa  172  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4256  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.1 
 
 
1005 aa  172  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2905  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.77 
 
 
995 aa  172  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129344  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4811  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  22.63 
 
 
971 aa  170  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2904  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.64 
 
 
1025 aa  169  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.83736  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0725  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.39 
 
 
906 aa  169  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0957  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.61 
 
 
950 aa  168  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1181  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.17 
 
 
1037 aa  167  6.9999999999999995e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.998854 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4442  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding:FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  26.36 
 
 
966 aa  167  6.9999999999999995e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5632  D-lactate dehydrogenase  27.8 
 
 
1007 aa  167  9e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2117  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.94 
 
 
973 aa  167  1.0000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.715118  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1163  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.29 
 
 
961 aa  166  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.25056  normal  0.360544 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3324  D-lactate dehydrogenase  25.83 
 
 
973 aa  166  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1983  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.62 
 
 
1031 aa  166  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2940  FAD linked oxidase domain protein  26.24 
 
 
1055 aa  164  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0464  hypothetical protein  24.82 
 
 
984 aa  163  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1470  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.14 
 
 
997 aa  164  1e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.271002  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1787  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.8 
 
 
948 aa  162  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.72 
 
 
1046 aa  162  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.433377  normal  0.249121 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3054  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.33 
 
 
1032 aa  162  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.267975 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3077  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.41 
 
 
991 aa  163  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2129  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  21.9 
 
 
968 aa  161  4e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702869  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3764  FAD linked oxidase domain protein  25.52 
 
 
1070 aa  161  5e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0200676  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2770  putative FAD-dependent oxidoreductase  25.66 
 
 
999 aa  161  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0626  hypothetical protein  22.06 
 
 
930 aa  161  6e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  29.69 
 
 
466 aa  161  7e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2441  FAD/FMN-containing dehydrogenase  29.7 
 
 
532 aa  160  9e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1924  FAD linked oxidase-like  29.48 
 
 
967 aa  160  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0988  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.98 
 
 
475 aa  160  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0857891  hitchhiker  0.00240363 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>