More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2725 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2256  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  64.82 
 
 		 937 aa  1251    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000277534  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0253  oxidoreductase/iron-sulfur cluster-binding protein  51.76 
 
 		 959 aa  999    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3171  FAD linked oxidase domain protein  54.1 
 
 		 961 aa  995    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1271  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.47 
 
 		 934 aa  852    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0752852  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4737  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  55.17 
 
 		 936 aa  1049    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0148478 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1376  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.86 
 
 		 934 aa  831    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.915749 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4686  oxidoreductase, FAD-binding/iron-sulfur cluster-binding protein  51.8 
 
 		 944 aa  1021    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0908  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.67 
 
 		 942 aa  818    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000203424 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1756  oxidoreductase, FAD-binding, iron-sulfur cluster-binding  37.49 
 
 		 923 aa  647    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1521  iron-sulfur cluster-binding protein  46.51 
 
 		 914 aa  845    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4738  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  55.53 
 
 		 936 aa  1048    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1763  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding:FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  51.18 
 
 		 923 aa  935    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.575647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5492  oxidoreductase FAD-binding region  55.65 
 
 		 941 aa  1030    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.203928  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0460  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.28 
 
 		 992 aa  780    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.394566 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0694  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  55.06 
 
 		 936 aa  1044    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000209119 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0749  FAD linked oxidase-like  55.72 
 
 		 940 aa  1057    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3008  FAD linked oxidase domain protein  44.86 
 
 		 934 aa  831    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000527922 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3343  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.86 
 
 		 934 aa  780    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.641395 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3136  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.4 
 
 		 934 aa  825    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.502756 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3604  oxidoreductase  72.13 
 
 		 943 aa  1411    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00314932  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1936  oxidoreductase, FAD-binding, iron-sulfur cluster-binding  37.46 
 
 		 923 aa  641    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0072  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  52.2 
 
 		 959 aa  993    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4603  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  55.06 
 
 		 936 aa  1048    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52713  normal  0.0292343 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1410  4Fe-4S ferredoxin  56.34 
 
 		 960 aa  1004    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.787039  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4837  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.26 
 
 		 973 aa  676    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.286258  hitchhiker  0.00000327471 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2973  FAD linked oxidase-like  54.42 
 
 		 955 aa  1002    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.771032  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1353  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.75 
 
 		 934 aa  831    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1339  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.75 
 
 		 934 aa  831    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1439  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.74 
 
 		 967 aa  1008    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.96855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0405  FAD linked oxidase-like protein  54.84 
 
 		 961 aa  1039    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0118244  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2725  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  100 
 
 		 941 aa  1937    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.191321 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2995  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.38 
 
 		 939 aa  852    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2723  FAD linked oxidase-like  42.77 
 
 		 955 aa  762    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43110  Fe-S/FAD domain protein  55.9 
 
 		 938 aa  1042    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326877  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1546  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  57.89 
 
 		 938 aa  1154    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.825134  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13795  predicted protein  46.63 
 
 		 983 aa  875    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0857019  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2281  FAD linked oxidase-like  48.13 
 
 		 949 aa  919    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0406  FAD linked oxidase-like  47.69 
 
 		 951 aa  875    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.955894  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2196  FAD linked oxidase domain protein  78.38 
 
 		 942 aa  1555    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2735  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.97 
 
 		 934 aa  830    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2808  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.86 
 
 		 934 aa  828    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2794  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.1 
 
 		 934 aa  842    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3228  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  50.53 
 
 		 978 aa  993    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.130904  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63100  putative ferredoxin  55.14 
 
 		 938 aa  1025    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.153244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1418  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.19 
 
 		 943 aa  1013    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4141  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.24 
 
 		 941 aa  655    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3063  FAD linked oxidase domain protein  54.42 
 
 		 967 aa  1015    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2905  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.18 
 
 		 934 aa  831    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.520733  normal  0.168522 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1725  FAD linked oxidase domain protein  48.22 
 
 		 937 aa  868    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.250362  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2440  iron-sulfur cluster-binding protein  46.23 
 
 		 935 aa  832    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3728  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.23 
 
 		 966 aa  619  1e-176  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0224472  normal  0.621627 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2934  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.23 
 
 		 966 aa  607  9.999999999999999e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0048436  hitchhiker  0.00113857 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2007  FAD linked oxidase-like  37.49 
 
 		 955 aa  600  1e-170  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4610  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.56 
 
 		 928 aa  595  1e-169  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.119537 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0184  FAD linked oxidase domain protein  37.04 
 
 		 967 aa  587  1e-166  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2130  FAD linked oxidase domain protein  27.53 
 
 		 973 aa  221  3.9999999999999997e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3077  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.94 
 
 		 991 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4174  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.15 
 
 		 1000 aa  197  9e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.57181  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4811  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.59 
 
 		 971 aa  196  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2375  FAD linked oxidase-like protein  25.96 
 
 		 952 aa  193  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0843  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.04 
 
 		 1011 aa  192  2.9999999999999997e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.505983 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4256  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.69 
 
 		 1005 aa  191  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3429  oxidoreductase  25.05 
 
 		 975 aa  190  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2720  FAD linked oxidase-like protein  24.95 
 
 		 1024 aa  189  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6956  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.68 
 
 		 1007 aa  188  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3858  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.08 
 
 		 978 aa  186  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.738511  hitchhiker  0.000383652 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3155  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.13 
 
 		 983 aa  186  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2940  FAD linked oxidase domain protein  24.95 
 
 		 1055 aa  185  3e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2129  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.14 
 
 		 968 aa  186  3e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702869  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3025  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.49 
 
 		 1038 aa  184  9.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.473379 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2991  FAD linked oxidase-like  25.11 
 
 		 1013 aa  184  9.000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.207062 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5063  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.97 
 
 		 1009 aa  184  9.000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0509  FAD linked oxidase domain protein  25.05 
 
 		 1024 aa  183  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3126  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.62 
 
 		 962 aa  183  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32250  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  25.68 
 
 		 974 aa  182  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2117  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.49 
 
 		 973 aa  181  4e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.715118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5632  D-lactate dehydrogenase  25.23 
 
 		 1007 aa  181  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2896  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.76 
 
 		 1035 aa  180  1e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.228282  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5731  D-lactate dehydrogenase / anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  25.73 
 
 		 984 aa  179  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3485  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.57 
 
 		 983 aa  179  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1924  FAD linked oxidase-like  27.47 
 
 		 967 aa  178  3e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2441  FAD/FMN-containing dehydrogenase  28.49 
 
 		 532 aa  178  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2438  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.95 
 
 		 1015 aa  179  3e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.944739  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  26.53 
 
 		 989 aa  179  3e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0862  FAD linked oxidase domain protein  26.01 
 
 		 1050 aa  177  6e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.961575  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4725  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.92 
 
 		 976 aa  177  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.881602  hitchhiker  0.000909988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2768  FAD linked oxidase domain protein  25.46 
 
 		 974 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834372  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2547  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.58 
 
 		 1023 aa  176  1.9999999999999998e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.846231  normal  0.179542 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2905  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.16 
 
 		 995 aa  175  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1163  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.47 
 
 		 961 aa  175  3.9999999999999995e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.25056  normal  0.360544 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0858  FAD linked oxidase domain protein  25.88 
 
 		 1052 aa  174  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0464  hypothetical protein  22.54 
 
 		 984 aa  174  6.999999999999999e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3054  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.58 
 
 		 1032 aa  173  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267975 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1983  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.72 
 
 		 1031 aa  173  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0560  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.76 
 
 		 976 aa  173  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.389138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4442  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding:FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  24.75 
 
 		 966 aa  172  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4649  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.66 
 
 		 1034 aa  171  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2125  FAD linked oxidase domain protein  24.4 
 
 		 1015 aa  171  5e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2417  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.66 
 
 		 977 aa  171  7e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11033  FAD linked oxidase-like protein  23.77 
 
 		 967 aa  170  1e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>