More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4603 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5492  oxidoreductase FAD-binding region  81.8 
 
 		 941 aa  1587    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.203928  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0694  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  95.19 
 
 		 936 aa  1849    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000209119 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1271  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.93 
 
 		 934 aa  804    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0752852  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1353  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.8 
 
 		 934 aa  777    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3008  FAD linked oxidase domain protein  42.8 
 
 		 934 aa  775    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000527922 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4737  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  99.79 
 
 		 936 aa  1926    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0148478 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43110  Fe-S/FAD domain protein  79.36 
 
 		 938 aa  1558    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326877  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4686  oxidoreductase, FAD-binding/iron-sulfur cluster-binding protein  54.06 
 
 		 944 aa  1035    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1521  iron-sulfur cluster-binding protein  44.93 
 
 		 914 aa  800    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0072  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  54.42 
 
 		 959 aa  1052    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2440  iron-sulfur cluster-binding protein  44.9 
 
 		 935 aa  784    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3171  FAD linked oxidase domain protein  52.55 
 
 		 961 aa  900    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1763  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding:FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  50.81 
 
 		 923 aa  927    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.575647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1418  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.22 
 
 		 943 aa  1032    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0749  FAD linked oxidase-like  83.85 
 
 		 940 aa  1639    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1439  FAD linked oxidase domain-containing protein  53.56 
 
 		 967 aa  935    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.96855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1546  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  47.63 
 
 		 938 aa  891    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.825134  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2256  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  53.28 
 
 		 937 aa  1015    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000277534  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3604  oxidoreductase  54.56 
 
 		 943 aa  1036    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00314932  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1339  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.8 
 
 		 934 aa  776    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4837  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.44 
 
 		 973 aa  728    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.286258  hitchhiker  0.00000327471 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2725  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  55.06 
 
 		 941 aa  1048    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.191321 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1410  4Fe-4S ferredoxin  55.5 
 
 		 960 aa  985    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.787039  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0253  oxidoreductase/iron-sulfur cluster-binding protein  55.32 
 
 		 959 aa  1046    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2973  FAD linked oxidase-like  52.55 
 
 		 955 aa  913    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.771032  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2995  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.49 
 
 		 939 aa  803    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0405  FAD linked oxidase-like protein  55.83 
 
 		 961 aa  1033    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0118244  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4603  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  100 
 
 		 936 aa  1929    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52713  normal  0.0292343 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13795  predicted protein  44.92 
 
 		 983 aa  836    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0857019  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2723  FAD linked oxidase-like  42.83 
 
 		 955 aa  766    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3228  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  47.33 
 
 		 978 aa  907    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.130904  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2281  FAD linked oxidase-like  52.75 
 
 		 949 aa  982    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2196  FAD linked oxidase domain protein  53.88 
 
 		 942 aa  1032    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0406  FAD linked oxidase-like  49.03 
 
 		 951 aa  888    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.955894  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3063  FAD linked oxidase domain protein  52.97 
 
 		 967 aa  922    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0460  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.93 
 
 		 992 aa  761    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.394566 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2735  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.73 
 
 		 934 aa  782    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2808  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.62 
 
 		 934 aa  780    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4738  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  97.44 
 
 		 936 aa  1886    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2794  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.54 
 
 		 934 aa  777    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3343  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.96 
 
 		 934 aa  759    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.641395 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63100  putative ferredoxin  81.8 
 
 		 938 aa  1581    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.153244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4141  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.76 
 
 		 941 aa  655    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0908  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.09 
 
 		 942 aa  763    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000203424 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1376  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.01 
 
 		 934 aa  780    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.915749 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2905  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.4 
 
 		 934 aa  776    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.520733  normal  0.168522 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3136  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.45 
 
 		 934 aa  781    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.502756 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1725  FAD linked oxidase domain protein  45.37 
 
 		 937 aa  792    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.250362  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1756  oxidoreductase, FAD-binding, iron-sulfur cluster-binding  36.83 
 
 		 923 aa  624  1e-177  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2007  FAD linked oxidase-like  38.08 
 
 		 955 aa  624  1e-177  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1936  oxidoreductase, FAD-binding, iron-sulfur cluster-binding  36.61 
 
 		 923 aa  618  1e-175  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3728  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.25 
 
 		 966 aa  617  1e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0224472  normal  0.621627 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2934  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.51 
 
 		 966 aa  600  1e-170  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0048436  hitchhiker  0.00113857 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0184  FAD linked oxidase domain protein  38.16 
 
 		 967 aa  597  1e-169  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4610  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.13 
 
 		 928 aa  591  1e-167  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.119537 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  27.34 
 
 		 989 aa  205  3e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2130  FAD linked oxidase domain protein  25.61 
 
 		 973 aa  203  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1470  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.78 
 
 		 997 aa  202  3e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.271002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2991  FAD linked oxidase-like  26.08 
 
 		 1013 aa  199  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.207062 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4692  FAD linked oxidase domain protein  26.01 
 
 		 996 aa  199  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0507445  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11033  FAD linked oxidase-like protein  24.7 
 
 		 967 aa  192  2e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2896  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.9 
 
 		 1035 aa  192  2.9999999999999997e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.228282  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2117  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.7 
 
 		 973 aa  192  2.9999999999999997e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.715118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5063  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.56 
 
 		 1009 aa  191  4e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4174  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.59 
 
 		 1000 aa  190  9e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.57181  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4811  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.84 
 
 		 971 aa  190  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3429  oxidoreductase  25.19 
 
 		 975 aa  190  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3025  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.43 
 
 		 1038 aa  189  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.473379 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2547  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.1 
 
 		 1023 aa  186  2.0000000000000003e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.846231  normal  0.179542 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3858  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.02 
 
 		 978 aa  186  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.738511  hitchhiker  0.000383652 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2375  FAD linked oxidase-like protein  26.38 
 
 		 952 aa  186  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3077  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.63 
 
 		 991 aa  185  3e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4256  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.07 
 
 		 1005 aa  185  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6956  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.02 
 
 		 1007 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1181  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.89 
 
 		 1037 aa  184  5.0000000000000004e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.998854 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2940  FAD linked oxidase domain protein  25.88 
 
 		 1055 aa  184  6e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2720  FAD linked oxidase-like protein  25.4 
 
 		 1024 aa  184  6e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0457  FAD linked oxidase domain protein  24.89 
 
 		 1014 aa  183  1e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.873167  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3485  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.71 
 
 		 983 aa  183  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0560  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.03 
 
 		 976 aa  182  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.389138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0509  FAD linked oxidase domain protein  26.5 
 
 		 1024 aa  182  2.9999999999999997e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4859  FAD linked oxidase domain protein  25.65 
 
 		 1043 aa  182  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0821468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5632  D-lactate dehydrogenase  25.55 
 
 		 1007 aa  180  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1983  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.68 
 
 		 1031 aa  179  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1787  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.67 
 
 		 948 aa  179  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4803  FAD linked oxidase domain protein  25 
 
 		 976 aa  178  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3155  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.96 
 
 		 983 aa  178  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0843  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.46 
 
 		 1011 aa  178  4e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.505983 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0464  hypothetical protein  23.78 
 
 		 984 aa  177  7e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0601  FAD linked oxidase domain protein  26.47 
 
 		 997 aa  177  9e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431766  normal  0.0923771 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3016  FAD linked oxidase domain protein  25.05 
 
 		 1010 aa  176  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.17034  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.26 
 
 		 999 aa  174  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0957  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.63 
 
 		 950 aa  174  5e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0210  FAD linked oxidase domain protein  25.26 
 
 		 1032 aa  174  9e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.23019 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32250  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  25.73 
 
 		 974 aa  173  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2768  FAD linked oxidase domain protein  26.38 
 
 		 974 aa  173  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834372  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2770  putative FAD-dependent oxidoreductase  24.49 
 
 		 999 aa  171  7e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0289  FAD linked oxidase domain protein  25.08 
 
 		 976 aa  171  7e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1074  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.92 
 
 		 1022 aa  170  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.899734  decreased coverage  0.000498092 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2125  FAD linked oxidase domain protein  24.87 
 
 		 1015 aa  170  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>