More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_1376 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_1339  FAD linked oxidase domain-containing protein  99.25 
 
 
934 aa  1931    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1546  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.47 
 
 
938 aa  774    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.825134  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4737  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.9 
 
 
936 aa  781    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0148478 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4686  oxidoreductase, FAD-binding/iron-sulfur cluster-binding protein  42.28 
 
 
944 aa  785    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13795  predicted protein  38.76 
 
 
983 aa  688    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0857019  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1756  oxidoreductase, FAD-binding, iron-sulfur cluster-binding  38.43 
 
 
923 aa  667    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1521  iron-sulfur cluster-binding protein  85.01 
 
 
914 aa  1630    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3008  FAD linked oxidase domain protein  99.36 
 
 
934 aa  1928    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000527922 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0253  oxidoreductase/iron-sulfur cluster-binding protein  41.73 
 
 
959 aa  793    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4738  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.9 
 
 
936 aa  778    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4603  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.01 
 
 
936 aa  783    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52713  normal  0.0292343 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1763  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding:FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  45.49 
 
 
923 aa  827    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.575647  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0908  FAD linked oxidase domain-containing protein  78.36 
 
 
942 aa  1559    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000203424 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0749  FAD linked oxidase-like  42.87 
 
 
940 aa  777    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2440  iron-sulfur cluster-binding protein  78.27 
 
 
935 aa  1562    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4837  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.93 
 
 
973 aa  667    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.286258  hitchhiker  0.00000327471 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2995  FAD linked oxidase domain-containing protein  83.39 
 
 
939 aa  1660    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0072  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.86 
 
 
959 aa  803    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3604  oxidoreductase  44.44 
 
 
943 aa  849    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00314932  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0694  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.81 
 
 
936 aa  772    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000209119 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1410  4Fe-4S ferredoxin  44.54 
 
 
960 aa  806    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.787039  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1353  FAD linked oxidase domain-containing protein  99.14 
 
 
934 aa  1929    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2973  FAD linked oxidase-like  43.3 
 
 
955 aa  775    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.771032  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3171  FAD linked oxidase domain protein  42.92 
 
 
961 aa  773    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1936  oxidoreductase, FAD-binding, iron-sulfur cluster-binding  38.04 
 
 
923 aa  664    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2256  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  44.77 
 
 
937 aa  798    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000277534  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3343  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.38 
 
 
934 aa  652    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.641395 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0405  FAD linked oxidase-like protein  43.22 
 
 
961 aa  807    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0118244  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2723  FAD linked oxidase-like  39.24 
 
 
955 aa  707    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1271  FAD linked oxidase domain-containing protein  86.62 
 
 
934 aa  1683    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0752852  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3136  FAD linked oxidase domain-containing protein  85.65 
 
 
934 aa  1687    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.502756 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3063  FAD linked oxidase domain protein  42.63 
 
 
967 aa  783    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2281  FAD linked oxidase-like  41.21 
 
 
949 aa  773    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0406  FAD linked oxidase-like  40.72 
 
 
951 aa  749    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.955894  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3228  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.77 
 
 
978 aa  795    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.130904  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2735  FAD linked oxidase domain-containing protein  94.43 
 
 
934 aa  1856    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2808  FAD linked oxidase domain-containing protein  94.33 
 
 
934 aa  1852    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1439  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.47 
 
 
967 aa  767    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.96855  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2794  FAD linked oxidase domain-containing protein  83.3 
 
 
934 aa  1644    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2196  FAD linked oxidase domain protein  43.21 
 
 
942 aa  827    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63100  putative ferredoxin  43.63 
 
 
938 aa  790    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.153244  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1376  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 
934 aa  1941    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.915749 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43110  Fe-S/FAD domain protein  43.15 
 
 
938 aa  795    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326877  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2905  FAD linked oxidase domain-containing protein  94.33 
 
 
934 aa  1854    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.520733  normal  0.168522 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1418  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.64 
 
 
943 aa  801    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1725  FAD linked oxidase domain protein  38.94 
 
 
937 aa  660    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.250362  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2725  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  44.97 
 
 
941 aa  835    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.191321 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5492  oxidoreductase FAD-binding region  43.72 
 
 
941 aa  792    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.203928  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0460  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.56 
 
 
992 aa  627  1e-178  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.394566 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4141  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.21 
 
 
941 aa  605  1.0000000000000001e-171  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2007  FAD linked oxidase-like  34.38 
 
 
955 aa  581  1e-164  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3728  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.15 
 
 
966 aa  565  1.0000000000000001e-159  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0224472  normal  0.621627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4610  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.38 
 
 
928 aa  555  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.119537 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2934  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.48 
 
 
966 aa  545  1e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0048436  hitchhiker  0.00113857 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0184  FAD linked oxidase domain protein  33.4 
 
 
967 aa  538  1e-151  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  25.67 
 
 
989 aa  226  2e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2117  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.24 
 
 
973 aa  220  1e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.715118  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08570  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  24.36 
 
 
945 aa  218  4e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.695725  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2130  FAD linked oxidase domain protein  25.58 
 
 
973 aa  217  8e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1470  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.37 
 
 
997 aa  215  2.9999999999999995e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.271002  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0560  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.58 
 
 
976 aa  210  9e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.389138  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0626  hypothetical protein  28.01 
 
 
930 aa  210  1e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11033  FAD linked oxidase-like protein  24.74 
 
 
967 aa  208  4e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3858  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.8 
 
 
978 aa  207  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.738511  hitchhiker  0.000383652 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32250  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  24.63 
 
 
974 aa  206  2e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4174  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.82 
 
 
1000 aa  205  4e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.57181  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3016  FAD linked oxidase domain protein  24.65 
 
 
1010 aa  204  5e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.17034  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4442  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding:FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  24.05 
 
 
966 aa  204  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1787  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.18 
 
 
948 aa  204  7e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5063  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.27 
 
 
1009 aa  199  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424632  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4725  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.31 
 
 
976 aa  197  7e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.881602  hitchhiker  0.000909988 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2129  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.17 
 
 
968 aa  197  9e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702869  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0957  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.8 
 
 
950 aa  196  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2125  FAD linked oxidase domain protein  24.79 
 
 
1015 aa  196  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4803  FAD linked oxidase domain protein  26.45 
 
 
976 aa  196  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0464  hypothetical protein  23.51 
 
 
984 aa  194  7e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1181  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.95 
 
 
1037 aa  191  7e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.998854 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3155  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.64 
 
 
983 aa  188  4e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1983  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.75 
 
 
1031 aa  188  5e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4130  FAD linked oxidase domain protein  24.67 
 
 
975 aa  186  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419398  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3485  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.56 
 
 
983 aa  185  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0725  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.21 
 
 
906 aa  185  4.0000000000000006e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1163  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.24 
 
 
961 aa  184  8.000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.25056  normal  0.360544 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4859  FAD linked oxidase domain protein  23.65 
 
 
1043 aa  183  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0821468  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2165  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.45 
 
 
944 aa  182  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4811  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.61 
 
 
971 aa  182  2.9999999999999997e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3429  oxidoreductase  24.11 
 
 
975 aa  181  5.999999999999999e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0686  FAD linked oxidase domain protein  27.26 
 
 
985 aa  180  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17651  normal  0.98502 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4649  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.4 
 
 
1034 aa  177  6e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2011  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.97 
 
 
947 aa  177  7e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00715823  decreased coverage  0.00037047 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0289  FAD linked oxidase domain protein  22.66 
 
 
976 aa  177  7e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3077  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.05 
 
 
991 aa  176  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1924  FAD linked oxidase-like  26.42 
 
 
967 aa  176  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2438  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.26 
 
 
1015 aa  176  1.9999999999999998e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.944739  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5632  D-lactate dehydrogenase  24.35 
 
 
1007 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2991  FAD linked oxidase-like  23.67 
 
 
1013 aa  176  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.207062 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0150  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.59 
 
 
977 aa  175  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0764  FAD linked oxidase domain protein  27.34 
 
 
987 aa  174  7.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6956  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  22.95 
 
 
1007 aa  174  9e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0457  FAD linked oxidase domain protein  22.99 
 
 
1014 aa  173  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.873167  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>