More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2934 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_1439  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.13 
 
 		 967 aa  669    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.96855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2934  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  100 
 
 		 966 aa  1942    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0048436  hitchhiker  0.00113857 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0184  FAD linked oxidase domain protein  53.21 
 
 		 967 aa  938    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3728  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  84.42 
 
 		 966 aa  1655    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0224472  normal  0.621627 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2007  FAD linked oxidase-like  56.32 
 
 		 955 aa  975    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4837  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.7 
 
 		 973 aa  697    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.286258  hitchhiker  0.00000327471 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4610  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  60.41 
 
 		 928 aa  1052    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.119537 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0405  FAD linked oxidase-like protein  40.37 
 
 		 961 aa  641    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0118244  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2723  FAD linked oxidase-like  43.67 
 
 		 955 aa  756    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0460  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43 
 
 		 992 aa  718    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.394566 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4141  FAD linked oxidase domain-containing protein  62.09 
 
 		 941 aa  1149    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3343  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.68 
 
 		 934 aa  722    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.641395 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2196  FAD linked oxidase domain protein  37.51 
 
 		 942 aa  634  1e-180  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3063  FAD linked oxidase domain protein  42.39 
 
 		 967 aa  632  1e-180  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0253  oxidoreductase/iron-sulfur cluster-binding protein  37.16 
 
 		 959 aa  630  1e-179  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2973  FAD linked oxidase-like  41.97 
 
 		 955 aa  630  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.771032  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43110  Fe-S/FAD domain protein  38.93 
 
 		 938 aa  628  1e-178  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326877  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5492  oxidoreductase FAD-binding region  39.59 
 
 		 941 aa  625  1e-177  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.203928  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3171  FAD linked oxidase domain protein  42.28 
 
 		 961 aa  622  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1410  4Fe-4S ferredoxin  40.61 
 
 		 960 aa  623  1e-177  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.787039  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1418  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.65 
 
 		 943 aa  621  1e-176  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0749  FAD linked oxidase-like  38.85 
 
 		 940 aa  617  1e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3604  oxidoreductase  37.89 
 
 		 943 aa  619  1e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00314932  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0406  FAD linked oxidase-like  39.03 
 
 		 951 aa  618  1e-175  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.955894  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63100  putative ferredoxin  39.52 
 
 		 938 aa  616  1e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.153244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2725  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.23 
 
 		 941 aa  617  1e-175  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.191321 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2281  FAD linked oxidase-like  35.83 
 
 		 949 aa  615  9.999999999999999e-175  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4603  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.51 
 
 		 936 aa  610  1e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52713  normal  0.0292343 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4737  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.4 
 
 		 936 aa  608  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0148478 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2256  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.47 
 
 		 937 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000277534  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4738  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.3 
 
 		 936 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4686  oxidoreductase, FAD-binding/iron-sulfur cluster-binding protein  35.81 
 
 		 944 aa  600  1e-170  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3228  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.7 
 
 		 978 aa  599  1e-170  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.130904  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1546  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.37 
 
 		 938 aa  601  1e-170  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.825134  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0694  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.02 
 
 		 936 aa  592  1e-168  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000209119 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1763  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding:FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  38.19 
 
 		 923 aa  591  1e-167  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.575647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0072  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.22 
 
 		 959 aa  587  1e-166  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2995  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.14 
 
 		 939 aa  581  1e-164  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2440  iron-sulfur cluster-binding protein  35.87 
 
 		 935 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2794  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.47 
 
 		 934 aa  575  1.0000000000000001e-162  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0908  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.4 
 
 		 942 aa  566  1e-160  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000203424 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1521  iron-sulfur cluster-binding protein  34.52 
 
 		 914 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3136  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.58 
 
 		 934 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.502756 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1725  FAD linked oxidase domain protein  36.64 
 
 		 937 aa  560  1e-158  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.250362  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1271  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.63 
 
 		 934 aa  561  1e-158  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0752852  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2735  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.65 
 
 		 934 aa  559  1e-158  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2905  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.76 
 
 		 934 aa  559  1e-158  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.520733  normal  0.168522 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2808  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.44 
 
 		 934 aa  554  1e-156  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1353  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.48 
 
 		 934 aa  553  1e-156  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1339  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.48 
 
 		 934 aa  553  1e-156  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1376  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.48 
 
 		 934 aa  551  1e-155  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.915749 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3008  FAD linked oxidase domain protein  33.48 
 
 		 934 aa  551  1e-155  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000527922 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13795  predicted protein  33.84 
 
 		 983 aa  533  1e-150  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0857019  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1936  oxidoreductase, FAD-binding, iron-sulfur cluster-binding  30.35 
 
 		 923 aa  499  1e-140  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1756  oxidoreductase, FAD-binding, iron-sulfur cluster-binding  30.56 
 
 		 923 aa  498  1e-139  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2130  FAD linked oxidase domain protein  27.98 
 
 		 973 aa  223  1.9999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0764  FAD linked oxidase domain protein  27.71 
 
 		 987 aa  211  4e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0509  FAD linked oxidase domain protein  26.73 
 
 		 1024 aa  209  3e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2940  FAD linked oxidase domain protein  26.07 
 
 		 1055 aa  206  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4803  FAD linked oxidase domain protein  28.48 
 
 		 976 aa  207  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0289  FAD linked oxidase domain protein  25.38 
 
 		 976 aa  207  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32250  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  27.15 
 
 		 974 aa  206  2e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2896  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.13 
 
 		 1035 aa  205  4e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.228282  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1470  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.96 
 
 		 997 aa  204  4e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.271002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4859  FAD linked oxidase domain protein  26.55 
 
 		 1043 aa  204  6e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0821468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0464  hypothetical protein  24.91 
 
 		 984 aa  203  9.999999999999999e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2547  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.63 
 
 		 1023 aa  203  9.999999999999999e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.846231  normal  0.179542 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2011  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.79 
 
 		 947 aa  204  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00715823  decreased coverage  0.00037047 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0957  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.42 
 
 		 950 aa  199  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2125  FAD linked oxidase domain protein  25.35 
 
 		 1015 aa  198  4.0000000000000005e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2720  FAD linked oxidase-like protein  26.08 
 
 		 1024 aa  197  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2117  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.83 
 
 		 973 aa  196  2e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.715118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3764  FAD linked oxidase domain protein  25.6 
 
 		 1070 aa  196  2e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0200676  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2438  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.22 
 
 		 1015 aa  195  3e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.944739  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4130  FAD linked oxidase domain protein  27.59 
 
 		 975 aa  195  4e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419398  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2375  FAD linked oxidase-like protein  27.1 
 
 		 952 aa  195  4e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  28.28 
 
 		 989 aa  194  7e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4204  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.71 
 
 		 990 aa  194  9e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0106272  normal  0.500842 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0862  FAD linked oxidase domain protein  27.17 
 
 		 1050 aa  192  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.961575  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3126  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.35 
 
 		 962 aa  191  4e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2991  FAD linked oxidase-like  24.76 
 
 		 1013 aa  191  5e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.207062 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0560  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.82 
 
 		 976 aa  191  8e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.389138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3054  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.47 
 
 		 1032 aa  190  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267975 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4692  FAD linked oxidase domain protein  25.13 
 
 		 996 aa  189  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0507445  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6956  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.03 
 
 		 1007 aa  189  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0858  FAD linked oxidase domain protein  27.02 
 
 		 1052 aa  189  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3858  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.35 
 
 		 978 aa  189  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.738511  hitchhiker  0.000383652 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1400  FAD linked oxidase domain protein  26.03 
 
 		 1023 aa  188  5e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0457  FAD linked oxidase domain protein  26.21 
 
 		 1014 aa  187  9e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.873167  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1983  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.03 
 
 		 1031 aa  187  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0600  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.05 
 
 		 1025 aa  186  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1074  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.91 
 
 		 1022 aa  186  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.899734  decreased coverage  0.000498092 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4174  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.51 
 
 		 1000 aa  186  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.57181  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1163  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.33 
 
 		 961 aa  185  3e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.25056  normal  0.360544 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2770  putative FAD-dependent oxidoreductase  25.82 
 
 		 999 aa  186  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1787  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.18 
 
 		 948 aa  185  4.0000000000000006e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0369  FAD linked oxidase domain protein  24.55 
 
 		 1002 aa  185  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0601  FAD linked oxidase domain protein  26.2 
 
 		 997 aa  184  6e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431766  normal  0.0923771 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1181  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.43 
 
 		 1037 aa  183  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.998854 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5632  D-lactate dehydrogenase  25.83 
 
 		 1007 aa  183  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>