More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4141 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1418  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.29 
 
 		 943 aa  641    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4737  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.76 
 
 		 936 aa  655    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0148478 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4686  oxidoreductase, FAD-binding/iron-sulfur cluster-binding protein  36.17 
 
 		 944 aa  639    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4738  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.76 
 
 		 936 aa  650    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2196  FAD linked oxidase domain protein  39.35 
 
 		 942 aa  667    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3728  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  60.13 
 
 		 966 aa  1140    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0224472  normal  0.621627 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43110  Fe-S/FAD domain protein  41.54 
 
 		 938 aa  663    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326877  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4837  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.4 
 
 		 973 aa  686    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.286258  hitchhiker  0.00000327471 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0749  FAD linked oxidase-like  41.35 
 
 		 940 aa  657    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2256  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.53 
 
 		 937 aa  657    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000277534  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0694  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.28 
 
 		 936 aa  646    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000209119 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5492  oxidoreductase FAD-binding region  41.57 
 
 		 941 aa  671    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.203928  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3604  oxidoreductase  38.37 
 
 		 943 aa  650    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00314932  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0460  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.96 
 
 		 992 aa  678    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.394566 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4610  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  59.14 
 
 		 928 aa  1020    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.119537 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2725  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.24 
 
 		 941 aa  655    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.191321 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2007  FAD linked oxidase-like  57.21 
 
 		 955 aa  1005    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0184  FAD linked oxidase domain protein  53.69 
 
 		 967 aa  935    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4603  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.76 
 
 		 936 aa  655    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52713  normal  0.0292343 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1439  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.06 
 
 		 967 aa  639    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.96855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1546  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.14 
 
 		 938 aa  638    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.825134  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0405  FAD linked oxidase-like protein  40.13 
 
 		 961 aa  644    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0118244  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2723  FAD linked oxidase-like  44.12 
 
 		 955 aa  779    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0253  oxidoreductase/iron-sulfur cluster-binding protein  37.75 
 
 		 959 aa  649    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63100  putative ferredoxin  40.93 
 
 		 938 aa  650    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.153244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2934  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  62.09 
 
 		 966 aa  1125    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0048436  hitchhiker  0.00113857 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4141  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 		 941 aa  1904    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3343  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.06 
 
 		 934 aa  731    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.641395 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0072  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.2 
 
 		 959 aa  634  1e-180  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1410  4Fe-4S ferredoxin  40.41 
 
 		 960 aa  634  1e-180  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.787039  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3228  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.88 
 
 		 978 aa  627  1e-178  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.130904  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2281  FAD linked oxidase-like  36.8 
 
 		 949 aa  625  1e-177  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2794  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.74 
 
 		 934 aa  622  1e-177  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1763  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding:FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  38.51 
 
 		 923 aa  616  1e-175  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.575647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2973  FAD linked oxidase-like  41.16 
 
 		 955 aa  617  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.771032  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3063  FAD linked oxidase domain protein  41.89 
 
 		 967 aa  614  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2995  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.06 
 
 		 939 aa  612  1e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1271  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.24 
 
 		 934 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0752852  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3171  FAD linked oxidase domain protein  41.57 
 
 		 961 aa  606  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1521  iron-sulfur cluster-binding protein  35.92 
 
 		 914 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1353  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.31 
 
 		 934 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1339  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.31 
 
 		 934 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3008  FAD linked oxidase domain protein  36.31 
 
 		 934 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000527922 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2735  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.55 
 
 		 934 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2808  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.44 
 
 		 934 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0908  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.75 
 
 		 942 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000203424 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2440  iron-sulfur cluster-binding protein  35.94 
 
 		 935 aa  601  1e-170  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1376  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.21 
 
 		 934 aa  601  1e-170  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.915749 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2905  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.22 
 
 		 934 aa  601  1e-170  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.520733  normal  0.168522 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3136  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.52 
 
 		 934 aa  598  1e-169  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.502756 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0406  FAD linked oxidase-like  37.94 
 
 		 951 aa  588  1e-166  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.955894  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1725  FAD linked oxidase domain protein  37.25 
 
 		 937 aa  544  1e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.250362  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13795  predicted protein  33.6 
 
 		 983 aa  520  1e-146  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0857019  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1756  oxidoreductase, FAD-binding, iron-sulfur cluster-binding  30.36 
 
 		 923 aa  503  1e-141  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1936  oxidoreductase, FAD-binding, iron-sulfur cluster-binding  29.97 
 
 		 923 aa  501  1e-140  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0764  FAD linked oxidase domain protein  27.44 
 
 		 987 aa  221  6e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2991  FAD linked oxidase-like  27.19 
 
 		 1013 aa  216  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.207062 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2130  FAD linked oxidase domain protein  27.42 
 
 		 973 aa  216  1.9999999999999998e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0560  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.34 
 
 		 976 aa  213  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.389138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3858  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.67 
 
 		 978 aa  211  4e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.738511  hitchhiker  0.000383652 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4803  FAD linked oxidase domain protein  28.21 
 
 		 976 aa  211  7e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2896  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.27 
 
 		 1035 aa  210  9e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.228282  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1470  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.16 
 
 		 997 aa  210  1e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.271002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0464  hypothetical protein  25.44 
 
 		 984 aa  208  4e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2547  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.68 
 
 		 1023 aa  207  1e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.846231  normal  0.179542 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2720  FAD linked oxidase-like protein  26.67 
 
 		 1024 aa  207  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3077  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.27 
 
 		 991 aa  204  5e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0686  FAD linked oxidase domain protein  28.54 
 
 		 985 aa  203  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17651  normal  0.98502 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1181  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.82 
 
 		 1037 aa  201  7e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.998854 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1074  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.87 
 
 		 1022 aa  200  9e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.899734  decreased coverage  0.000498092 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0509  FAD linked oxidase domain protein  28.06 
 
 		 1024 aa  199  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2438  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.93 
 
 		 1015 aa  198  3e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.944739  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0289  FAD linked oxidase domain protein  25.43 
 
 		 976 aa  199  3e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4174  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.7 
 
 		 1000 aa  198  3e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.57181  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2117  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.44 
 
 		 973 aa  197  6e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.715118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  27.58 
 
 		 989 aa  197  1e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4692  FAD linked oxidase domain protein  26.2 
 
 		 996 aa  196  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0507445  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08570  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  26.74 
 
 		 945 aa  195  3e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.695725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2179  FAD linked oxidase domain protein  29.35 
 
 		 894 aa  193  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4859  FAD linked oxidase domain protein  26.29 
 
 		 1043 aa  191  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0821468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0457  FAD linked oxidase domain protein  28.77 
 
 		 1014 aa  191  5e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.873167  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32250  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  28.18 
 
 		 974 aa  191  7e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0601  FAD linked oxidase domain protein  29.42 
 
 		 997 aa  190  1e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431766  normal  0.0923771 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0210  FAD linked oxidase domain protein  26.05 
 
 		 1032 aa  188  4e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.23019 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2375  FAD linked oxidase-like protein  27.43 
 
 		 952 aa  188  5e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3764  FAD linked oxidase domain protein  27.61 
 
 		 1070 aa  187  8e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0200676  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2125  FAD linked oxidase domain protein  25.77 
 
 		 1015 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2417  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.78 
 
 		 977 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5063  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.33 
 
 		 1009 aa  186  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1983  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.91 
 
 		 1031 aa  186  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2940  FAD linked oxidase domain protein  27.98 
 
 		 1055 aa  186  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4130  FAD linked oxidase domain protein  26.99 
 
 		 975 aa  186  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419398  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3429  oxidoreductase  24.53 
 
 		 975 aa  184  5.0000000000000004e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1400  FAD linked oxidase domain protein  27.93 
 
 		 1023 aa  183  1e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1787  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.23 
 
 		 948 aa  182  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0843  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.06 
 
 		 1011 aa  181  4.999999999999999e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.505983 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.01 
 
 		 999 aa  180  9e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3485  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.06 
 
 		 983 aa  179  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4725  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.5 
 
 		 976 aa  179  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.881602  hitchhiker  0.000909988 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2011  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.21 
 
 		 947 aa  178  4e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00715823  decreased coverage  0.00037047 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>