More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0405 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1376  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.22 
 
 
934 aa  802    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.915749 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2995  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.78 
 
 
939 aa  807    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4738  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  55.87 
 
 
936 aa  1033    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1418  FAD linked oxidase domain-containing protein  53.09 
 
 
943 aa  1031    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1725  FAD linked oxidase domain protein  48.88 
 
 
937 aa  855    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.250362  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4737  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  55.83 
 
 
936 aa  1034    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0148478 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2725  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  54.84 
 
 
941 aa  1039    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.191321 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4686  oxidoreductase, FAD-binding/iron-sulfur cluster-binding protein  53.57 
 
 
944 aa  1014    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1521  iron-sulfur cluster-binding protein  45.01 
 
 
914 aa  809    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0072  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  59.26 
 
 
959 aa  1143    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0694  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  56.04 
 
 
936 aa  1036    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000209119 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0908  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.46 
 
 
942 aa  801    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000203424 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3008  FAD linked oxidase domain protein  43.32 
 
 
934 aa  802    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000527922 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1763  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding:FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  52.87 
 
 
923 aa  949    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.575647  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4837  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.46 
 
 
973 aa  723    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.286258  hitchhiker  0.00000327471 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0749  FAD linked oxidase-like  55.84 
 
 
940 aa  1038    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2256  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  54.8 
 
 
937 aa  1025    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000277534  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2196  FAD linked oxidase domain protein  53.72 
 
 
942 aa  1011    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13795  predicted protein  44.26 
 
 
983 aa  843    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0857019  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3604  oxidoreductase  54.45 
 
 
943 aa  1034    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00314932  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3136  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.37 
 
 
934 aa  816    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.502756 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1410  4Fe-4S ferredoxin  55.65 
 
 
960 aa  973    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.787039  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3228  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  49.11 
 
 
978 aa  965    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.130904  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3343  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.34 
 
 
934 aa  793    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.641395 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2973  FAD linked oxidase-like  53.23 
 
 
955 aa  934    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.771032  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0460  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.67 
 
 
992 aa  719    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.394566 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4603  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  55.83 
 
 
936 aa  1033    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52713  normal  0.0292343 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2440  iron-sulfur cluster-binding protein  44.93 
 
 
935 aa  806    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3171  FAD linked oxidase domain protein  54.07 
 
 
961 aa  932    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1546  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  49.74 
 
 
938 aa  945    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.825134  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0405  FAD linked oxidase-like protein  100 
 
 
961 aa  1956    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0118244  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1353  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.43 
 
 
934 aa  804    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2723  FAD linked oxidase-like  45.57 
 
 
955 aa  815    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1271  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.79 
 
 
934 aa  817    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0752852  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3063  FAD linked oxidase domain protein  54.18 
 
 
967 aa  952    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2281  FAD linked oxidase-like  48.94 
 
 
949 aa  887    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0406  FAD linked oxidase-like  50.32 
 
 
951 aa  903    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.955894  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1439  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.57 
 
 
967 aa  939    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.96855  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2735  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.37 
 
 
934 aa  811    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2808  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.37 
 
 
934 aa  811    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0253  oxidoreductase/iron-sulfur cluster-binding protein  54.3 
 
 
959 aa  1015    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2794  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.6 
 
 
934 aa  812    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1339  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.43 
 
 
934 aa  804    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5492  oxidoreductase FAD-binding region  56.14 
 
 
941 aa  1025    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.203928  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63100  putative ferredoxin  56.14 
 
 
938 aa  1018    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.153244  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4141  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.13 
 
 
941 aa  644    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43110  Fe-S/FAD domain protein  56.59 
 
 
938 aa  1017    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326877  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2905  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.27 
 
 
934 aa  807    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.520733  normal  0.168522 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1756  oxidoreductase, FAD-binding, iron-sulfur cluster-binding  36 
 
 
923 aa  630  1e-179  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2007  FAD linked oxidase-like  40.57 
 
 
955 aa  625  1e-178  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2934  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40 
 
 
966 aa  623  1e-177  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0048436  hitchhiker  0.00113857 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3728  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.58 
 
 
966 aa  624  1e-177  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0224472  normal  0.621627 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1936  oxidoreductase, FAD-binding, iron-sulfur cluster-binding  35.61 
 
 
923 aa  623  1e-177  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4610  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.68 
 
 
928 aa  606  9.999999999999999e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.119537 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0184  FAD linked oxidase domain protein  39 
 
 
967 aa  590  1e-167  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3429  oxidoreductase  25.55 
 
 
975 aa  216  1.9999999999999998e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4174  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.56 
 
 
1000 aa  214  3.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.57181  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2130  FAD linked oxidase domain protein  26.52 
 
 
973 aa  211  6e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5063  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.22 
 
 
1009 aa  201  3.9999999999999996e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424632  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1787  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.75 
 
 
948 aa  201  5e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4692  FAD linked oxidase domain protein  27.31 
 
 
996 aa  200  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0507445  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3077  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.62 
 
 
991 aa  197  6e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4725  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.6 
 
 
976 aa  197  8.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.881602  hitchhiker  0.000909988 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2117  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.82 
 
 
973 aa  196  2e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.715118  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11033  FAD linked oxidase-like protein  24.77 
 
 
967 aa  194  5e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3016  FAD linked oxidase domain protein  27.17 
 
 
1010 aa  192  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.17034  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3155  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.04 
 
 
983 aa  191  5e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32250  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  26.55 
 
 
974 aa  191  5e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6956  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.91 
 
 
1007 aa  190  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4859  FAD linked oxidase domain protein  26.56 
 
 
1043 aa  189  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0821468  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0289  FAD linked oxidase domain protein  25.85 
 
 
976 aa  189  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5632  D-lactate dehydrogenase  26.69 
 
 
1007 aa  187  9e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4811  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.58 
 
 
971 aa  186  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0464  hypothetical protein  24.41 
 
 
984 aa  185  3e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1181  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.37 
 
 
1037 aa  185  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.998854 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2940  FAD linked oxidase domain protein  26.31 
 
 
1055 aa  184  5.0000000000000004e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0457  FAD linked oxidase domain protein  26.45 
 
 
1014 aa  184  9.000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.873167  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1983  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.69 
 
 
1031 aa  184  9.000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0728  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.62 
 
 
995 aa  183  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2417  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.2 
 
 
977 aa  183  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1470  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.52 
 
 
997 aa  182  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.271002  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3858  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.59 
 
 
978 aa  182  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.738511  hitchhiker  0.000383652 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  26.94 
 
 
989 aa  181  4.999999999999999e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0626  hypothetical protein  26.59 
 
 
930 aa  181  8e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2375  FAD linked oxidase-like protein  26.5 
 
 
952 aa  180  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4256  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.6 
 
 
1005 aa  180  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1074  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.42 
 
 
1022 aa  179  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.899734  decreased coverage  0.000498092 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0601  FAD linked oxidase domain protein  27.3 
 
 
997 aa  179  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431766  normal  0.0923771 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0509  FAD linked oxidase domain protein  25.03 
 
 
1024 aa  179  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2125  FAD linked oxidase domain protein  26.29 
 
 
1015 aa  179  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0957  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.73 
 
 
950 aa  178  4e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4803  FAD linked oxidase domain protein  25.32 
 
 
976 aa  178  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4442  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding:FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  25.48 
 
 
966 aa  177  7e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2547  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.11 
 
 
1023 aa  177  8e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.846231  normal  0.179542 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2896  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.51 
 
 
1035 aa  176  9.999999999999999e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.228282  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1924  FAD linked oxidase-like  27.91 
 
 
967 aa  177  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3025  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.05 
 
 
1038 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.473379 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0210  FAD linked oxidase domain protein  25.05 
 
 
1032 aa  174  9e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.23019 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3764  FAD linked oxidase domain protein  26.7 
 
 
1070 aa  173  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0200676  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0843  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.45 
 
 
1011 aa  172  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.505983 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>