112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2071 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2071  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  100 
 
 		 508 aa  1016    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.19773  normal  0.734788 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1731  response regulator receiver protein  37.32 
 
 		 424 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000047972 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1404  response regulator receiver protein  42.37 
 
 		 426 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1444  response regulator receiver protein  41.64 
 
 		 424 aa  237  4e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1289  hypothetical protein  41.14 
 
 		 412 aa  236  8e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1943  putative fimbriae assembly protein  41.14 
 
 		 412 aa  236  8e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00885774  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1777  hypothetical protein  41.14 
 
 		 412 aa  236  8e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.28097  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1790  hypothetical protein  41.14 
 
 		 412 aa  236  8e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.655567  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1047  hypothetical protein  41.14 
 
 		 412 aa  236  8e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.401729  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0118  hypothetical protein  41.14 
 
 		 405 aa  236  9e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.253404  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1769  hypothetical protein  41.14 
 
 		 405 aa  236  9e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.694321  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2541  hypothetical protein  41.03 
 
 		 412 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.585656  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1042  response regulator receiver protein  41.12 
 
 		 412 aa  226  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.497148  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1522  response regulator receiver protein  41.12 
 
 		 412 aa  226  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361355  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1498  response regulator receiver protein  41.12 
 
 		 412 aa  226  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259405  hitchhiker  0.00000329057 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4662  response regulator receiver domain-containing protein  40.88 
 
 		 412 aa  224  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0132095  hitchhiker  0.00330156 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4446  response regulator receiver protein  36.46 
 
 		 427 aa  222  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1654  putative pilus assembly protein, CpaE-like protein  38.07 
 
 		 413 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.735693 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2797  putative pilus assembly protein, CpaE-like  38.92 
 
 		 413 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.895149  normal  0.384116 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1086  pilus assembly protein  35.1 
 
 		 439 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.807258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3655  pilus assembly protein  35.39 
 
 		 412 aa  212  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5410  pilus assembly protein  37.37 
 
 		 423 aa  206  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.215437  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4359  pilus assembly protein  34.81 
 
 		 447 aa  206  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4249  putative pilus assembly protein  34.81 
 
 		 447 aa  206  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.359357 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2322  response regulator receiver domain protein (CheY-like)  36.49 
 
 		 403 aa  169  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.283577 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1641  pilus assembly protein CpaE  28.07 
 
 		 418 aa  117  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00628351  normal  0.327088 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2325  response regulator receiver domain protein (CheY-like)  26.65 
 
 		 409 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.571647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2703  pilus assembly protein CpaE, putative  26.65 
 
 		 409 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.711069  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0847  hypothetical protein  28.57 
 
 		 396 aa  113  9e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2161  pilus assembly protein CpaE  27.03 
 
 		 406 aa  107  6e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal  0.0348695 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55900  hypothetical protein  28.61 
 
 		 394 aa  106  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4870  hypothetical protein  28.61 
 
 		 394 aa  103  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4392  pilus assembly protein CpaE  26.57 
 
 		 396 aa  100  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4852  hypothetical protein  26.65 
 
 		 396 aa  97.4  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0647  pilus assembly protein CpaE  27.9 
 
 		 396 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1726  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  23.24 
 
 		 414 aa  84.3  0.000000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0071  response regulator receiver protein  28.21 
 
 		 397 aa  79.3  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623542 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1751  Flp pilus assembly ATPase CpaE  18.85 
 
 		 392 aa  77.4  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2701  response regulator receiver protein  21.18 
 
 		 373 aa  77  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3008  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  24.85 
 
 		 389 aa  73.9  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1497  response regulator receiver protein  23.95 
 
 		 389 aa  73.6  0.000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  21.82 
 
 		 387 aa  73.2  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4154  response regulator receiver protein  23.6 
 
 		 419 aa  73.2  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.268722 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2826  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  27.53 
 
 		 377 aa  69.7  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4443  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.07 
 
 		 391 aa  69.7  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0191569 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4620  response regulator receiver protein  22.29 
 
 		 416 aa  68.6  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.405994  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1527  response regulator receiver protein  22.94 
 
 		 383 aa  67  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3513  response regulator receiver protein  29.67 
 
 		 387 aa  66.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.168461 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2410  response regulator receiver protein  25.61 
 
 		 414 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0793  response regulator receiver  23.19 
 
 		 406 aa  65.5  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4398  response regulator receiver protein  24.41 
 
 		 380 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1056  response regulator receiver protein  21.25 
 
 		 373 aa  65.1  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3205  response regulator receiver protein  22.77 
 
 		 373 aa  63.9  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111806 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0796  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  22 
 
 		 381 aa  63.9  0.000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.757443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2914  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  28.07 
 
 		 377 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1110  response regulator receiver protein  23.42 
 
 		 404 aa  62.4  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.129352  normal  0.0915857 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2638  putative flp pilus assembly protein CpaE  22.47 
 
 		 401 aa  61.2  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  20.56 
 
 		 392 aa  61.2  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0798  response regulator receiver domain-containing protein  22.37 
 
 		 391 aa  60.8  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314887  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0975  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.57 
 
 		 423 aa  60.5  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0679592  normal  0.79779 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0656  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  20.8 
 
 		 381 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.165722 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2705  putative pilus assembly protein CpaE  27.92 
 
 		 414 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.383675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2739  response regulator receiver protein  23.62 
 
 		 481 aa  59.7  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1834  response regulator receiver protein  21.8 
 
 		 376 aa  59.3  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  20.56 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2362  response regulator receiver domain-containing protein  22.62 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382482  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0422  response regulator receiver protein  22.32 
 
 		 444 aa  57.4  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.183813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2367  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  24.51 
 
 		 418 aa  57  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.129539  normal  0.0992977 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1683  response regulator receiver protein  23.32 
 
 		 430 aa  57  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002648  type II/IV secretion system ATPase TadZ/CpaE associated with Flp pilus assembly  21.73 
 
 		 402 aa  57  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2482  putative pilus assembly protein CpaE  27.5 
 
 		 414 aa  57  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.952309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0589  response regulator receiver protein  21.55 
 
 		 402 aa  56.6  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32054  normal  0.148759 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  21.97 
 
 		 397 aa  55.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3353  response regulator receiver protein  22.6 
 
 		 419 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3209  response regulator receiver protein  22.73 
 
 		 416 aa  54.3  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.5486  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1162  response regulator receiver protein  20.99 
 
 		 389 aa  53.9  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0803  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  19.38 
 
 		 381 aa  54.3  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2272  putative septum site-determining protein  22.06 
 
 		 537 aa  53.9  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7033  putative pilus assembly protein cpaE  22.25 
 
 		 422 aa  53.9  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.186488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2355  response regulator receiver domain-containing protein  18.06 
 
 		 412 aa  53.1  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1782  pilus assembly protein cpaE  21.83 
 
 		 425 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  0.120682 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3967  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  25.6 
 
 		 382 aa  53.5  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467038 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2018  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  20.12 
 
 		 408 aa  53.1  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.724066  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  19.82 
 
 		 390 aa  53.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2829  response regulator receiver protein  22.59 
 
 		 414 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.906535  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5685  putative pilus assembly protein cpaE  25.08 
 
 		 422 aa  52.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.744074  normal  0.310447 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1020  response regulator receiver protein  20.12 
 
 		 420 aa  52.8  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2932  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  21.53 
 
 		 398 aa  52  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2382  response regulator receiver protein  22.7 
 
 		 414 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47935  normal  0.228311 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0303  chromosome partitioning ATPase  23.05 
 
 		 423 aa  50.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1315  flp pilus assembly protein, ATPase  24.81 
 
 		 402 aa  50.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1273  response regulator receiver protein  20.59 
 
 		 430 aa  50.8  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  20.96 
 
 		 412 aa  50.1  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0389  pilus assembly protein CpaE  23.03 
 
 		 422 aa  48.9  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2924  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  22.09 
 
 		 399 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2965  response regulator  24.65 
 
 		 402 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.206584  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2569  response regulator receiver protein  24.2 
 
 		 524 aa  48.9  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.220458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3090  response regulator  24.59 
 
 		 402 aa  48.5  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3522  putative pilus assembly protein cpaE  22.46 
 
 		 425 aa  48.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1853  AAA ATPase  23.02 
 
 		 397 aa  47.4  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0455079  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>