More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_2393 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1616  small GTP-binding protein  70.8 
 
 
453 aa  665    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206677 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2393  small GTP-binding protein  100 
 
 
448 aa  906    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2342  small GTP-binding protein  99.78 
 
 
448 aa  904    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4509  small GTP-binding protein domain-containing protein  63.12 
 
 
457 aa  535  1e-151  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3709  small GTP-binding protein  59.28 
 
 
462 aa  525  1e-148  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3839  small GTP-binding protein  53.59 
 
 
481 aa  447  1.0000000000000001e-124  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.674432 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0764  GTP-binding protein HSR1-related  46.19 
 
 
469 aa  330  3e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.796008  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1080  small GTP-binding protein  39.77 
 
 
484 aa  319  6e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3291  small GTP-binding protein domain-containing protein  39.68 
 
 
492 aa  313  5.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1436  small GTP-binding protein  38.6 
 
 
479 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.741449  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5212  small GTP-binding protein  37.94 
 
 
489 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000545834 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1407  small GTP-binding protein  38.6 
 
 
479 aa  310  4e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0107  small GTP-binding protein domain-containing protein  40.98 
 
 
472 aa  306  6e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.130324  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5156  small GTP-binding protein  38.69 
 
 
566 aa  302  7.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.61556 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0499  small GTP-binding protein  37.73 
 
 
475 aa  301  1e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362987  normal  0.723657 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2178  small GTP-binding protein domain-containing protein  39.32 
 
 
431 aa  177  4e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.995116  normal  0.41065 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0497  GTPase  38.69 
 
 
420 aa  169  9e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15631  GTPase SAR1 and related small G protein  35.42 
 
 
440 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04921  GTPase SAR1  38.98 
 
 
441 aa  157  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0975  small GTP-binding protein domain-containing protein  32.48 
 
 
440 aa  152  8.999999999999999e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1322  small GTP-binding protein  28.95 
 
 
531 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18431  GTPase SAR1 and related small G proteins  31.83 
 
 
440 aa  147  3e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.491382 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1351  small GTP-binding protein  28.71 
 
 
531 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000851094 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1326  small GTP-binding protein  29.48 
 
 
529 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1709  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.75 
 
 
513 aa  135  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000711006  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1544  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.19 
 
 
517 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10221  GTPase SAR1 and related small G protein  27.82 
 
 
516 aa  132  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.524471  normal  0.183753 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4593  small GTP-binding protein  28.29 
 
 
506 aa  130  6e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.771946  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1210  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.61 
 
 
529 aa  128  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16501  GTPase SAR1 and related small G proteins  25.79 
 
 
532 aa  128  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.569133 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4459  small GTP-binding protein  27.83 
 
 
520 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.859915  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16341  GTPase SAR1 and related small G protein  25.62 
 
 
413 aa  124  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0145  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.21 
 
 
517 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16461  GTPase SAR1  27.13 
 
 
413 aa  122  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1537  small GTP-binding protein domain-containing protein  26.53 
 
 
413 aa  121  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.273802  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07771  GTPase SAR1 and related small G proteins  28.21 
 
 
517 aa  121  3e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.1398  normal  0.0362439 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1260  hypothetical protein  26.6 
 
 
529 aa  120  6e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16231  GTPase SAR1 and related small G proteins  27.72 
 
 
413 aa  119  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.283634  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1904  GTP-binding protein, HSR1-related  25.53 
 
 
545 aa  115  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30473  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0765  hypothetical protein  26.58 
 
 
472 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09451  GTPase SAR1  26.27 
 
 
499 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09991  GTPase SAR1 and related small G proteins  26.46 
 
 
496 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0732  hypothetical protein  27.95 
 
 
481 aa  100  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00108673  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3840  hypothetical protein  29.32 
 
 
492 aa  100  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.83902  normal  0.693476 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4193  hypothetical protein  24.74 
 
 
471 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.296514 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09441  GTPase SAR1 and related small G protein  26.47 
 
 
499 aa  94  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0884  small GTP-binding protein domain-containing protein  26.27 
 
 
499 aa  92.8  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.102699  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3579  hypothetical protein  26.55 
 
 
463 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2529  hypothetical protein  25.65 
 
 
475 aa  81.3  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2527  hypothetical protein  26.55 
 
 
463 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0165  small GTP-binding protein  36.43 
 
 
427 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2152  small GTP-binding protein  35.43 
 
 
409 aa  63.2  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16490  iron-only hydrogenase maturation protein HydF  34.4 
 
 
416 aa  62.8  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.520712  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0183  small GTP-binding protein  39.84 
 
 
408 aa  62.8  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0683  small GTP-binding protein  34.75 
 
 
408 aa  62.8  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00203334  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  29.04 
 
 
548 aa  61.6  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1243  small GTP-binding protein  36.51 
 
 
425 aa  61.6  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0106  GTP-binding protein  33.57 
 
 
440 aa  61.2  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  33.81 
 
 
585 aa  60.5  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0103  GTP-binding protein  32.86 
 
 
440 aa  60.5  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000228129  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0475  small GTP-binding protein  27.17 
 
 
404 aa  60.5  0.00000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0490  small GTP-binding protein  27.17 
 
 
404 aa  60.5  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3103  small GTP-binding protein  31.25 
 
 
396 aa  59.7  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0042  small GTP-binding protein  33.33 
 
 
400 aa  58.9  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1277  small GTP-binding protein domain-containing protein  36.29 
 
 
405 aa  57.8  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.038791  hitchhiker  0.00000385407 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0146  small GTP-binding protein  36.15 
 
 
398 aa  57.4  0.0000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0325934  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2181  GTP-binding protein Era  30.32 
 
 
451 aa  56.6  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1862  small GTP-binding protein  34.75 
 
 
398 aa  56.6  0.0000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.803475  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19310  small GTP-binding protein  34.15 
 
 
411 aa  55.8  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00194835  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1570  GTP-binding protein Era  27.76 
 
 
314 aa  56.2  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.221135  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0033  translation initiation factor IF-2  31.21 
 
 
1045 aa  55.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.286863 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3816  translation initiation factor IF-2  30.83 
 
 
856 aa  55.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134229  normal  0.0174936 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4618  translation initiation factor IF-2  30.6 
 
 
975 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  30.32 
 
 
632 aa  55.8  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  30 
 
 
298 aa  55.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  28.57 
 
 
324 aa  55.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10530  small GTP-binding protein  32.26 
 
 
438 aa  55.8  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1361  small GTP-binding protein  30 
 
 
396 aa  54.7  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.311924  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1291  GTP-binding protein Era  30.43 
 
 
449 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.537318 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2611  translation initiation factor IF-2  30.6 
 
 
981 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.709252  normal  0.107051 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  27.36 
 
 
303 aa  55.1  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0359  GTP-binding protein EngA  30.29 
 
 
436 aa  54.7  0.000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13281  GTP-binding protein Era-like protein  28.91 
 
 
314 aa  54.7  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.593826 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2081  small GTP-binding protein  32.52 
 
 
416 aa  54.3  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000627073  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  23.43 
 
 
589 aa  54.3  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0318  small GTP-binding protein domain-containing protein  36.29 
 
 
402 aa  53.9  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  28.91 
 
 
302 aa  53.5  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4517  GTP-binding protein Era  33.09 
 
 
337 aa  53.5  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0374  GTP-binding protein EngA  36.07 
 
 
473 aa  53.5  0.000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1239  GTP-binding protein Era  28.66 
 
 
300 aa  53.5  0.000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.680465  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2357  translation initiation factor IF-2  28.92 
 
 
1101 aa  53.5  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2697  translation initiation factor IF-2  30.08 
 
 
989 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.769823 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4121  GTP-binding protein Era  33.08 
 
 
305 aa  52.8  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.383616  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1630  small GTP-binding protein  34.69 
 
 
440 aa  52.8  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.52918  hitchhiker  0.00197431 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2923  translation initiation factor IF-2  30.08 
 
 
989 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.707465  normal  0.0820286 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1629  GTPases  27.3 
 
 
416 aa  52.8  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000232915  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  28.22 
 
 
949 aa  53.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0024  translation initiation factor IF-2  30.6 
 
 
871 aa  52.4  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0480379 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1327  translation initiation factor IF-2  28.96 
 
 
995 aa  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0335521 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0600  translation initiation factor IF-2  30.6 
 
 
886 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153879  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>