More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_5156 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_5156  small GTP-binding protein  100 
 
 
566 aa  1136    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.61556 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3291  small GTP-binding protein domain-containing protein  65.82 
 
 
492 aa  628  1e-178  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1080  small GTP-binding protein  64.92 
 
 
484 aa  620  1e-176  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0499  small GTP-binding protein  65.38 
 
 
475 aa  601  1e-170  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362987  normal  0.723657 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1436  small GTP-binding protein  65.31 
 
 
479 aa  587  1e-166  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.741449  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1407  small GTP-binding protein  65.1 
 
 
479 aa  584  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5212  small GTP-binding protein  64.3 
 
 
489 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000545834 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0107  small GTP-binding protein domain-containing protein  51.94 
 
 
472 aa  459  9.999999999999999e-129  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.130324  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1616  small GTP-binding protein  41.96 
 
 
453 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206677 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3709  small GTP-binding protein  41.92 
 
 
462 aa  314  2.9999999999999996e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4509  small GTP-binding protein domain-containing protein  43.4 
 
 
457 aa  303  4.0000000000000003e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2342  small GTP-binding protein  38.69 
 
 
448 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2393  small GTP-binding protein  38.69 
 
 
448 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3839  small GTP-binding protein  37.58 
 
 
481 aa  283  8.000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.674432 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0764  GTP-binding protein HSR1-related  32.58 
 
 
469 aa  223  8e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.796008  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0497  GTPase  36.71 
 
 
420 aa  195  2e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0975  small GTP-binding protein domain-containing protein  29.88 
 
 
440 aa  191  4e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18431  GTPase SAR1 and related small G proteins  30.12 
 
 
440 aa  189  1e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.491382 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15631  GTPase SAR1 and related small G protein  30.98 
 
 
440 aa  178  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2178  small GTP-binding protein domain-containing protein  34.46 
 
 
431 aa  167  4e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.995116  normal  0.41065 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04921  GTPase SAR1  35.07 
 
 
441 aa  167  5e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1709  small GTP-binding protein domain-containing protein  30.3 
 
 
513 aa  160  5e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000711006  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1322  small GTP-binding protein  30.9 
 
 
531 aa  154  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1351  small GTP-binding protein  30.69 
 
 
531 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000851094 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16231  GTPase SAR1 and related small G proteins  28.79 
 
 
413 aa  152  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.283634  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4459  small GTP-binding protein  29.87 
 
 
520 aa  150  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.859915  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16461  GTPase SAR1  27.72 
 
 
413 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1537  small GTP-binding protein domain-containing protein  27.08 
 
 
413 aa  147  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.273802  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16341  GTPase SAR1 and related small G protein  26.36 
 
 
413 aa  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4593  small GTP-binding protein  29.82 
 
 
506 aa  142  1.9999999999999998e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.771946  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1326  small GTP-binding protein  27.56 
 
 
529 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1544  small GTP-binding protein domain-containing protein  29.43 
 
 
517 aa  134  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07771  GTPase SAR1 and related small G proteins  30.42 
 
 
517 aa  132  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.1398  normal  0.0362439 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0145  small GTP-binding protein domain-containing protein  30.25 
 
 
517 aa  130  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1904  GTP-binding protein, HSR1-related  30.08 
 
 
545 aa  124  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30473  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16501  GTPase SAR1 and related small G proteins  27.85 
 
 
532 aa  121  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.569133 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10221  GTPase SAR1 and related small G protein  26.28 
 
 
516 aa  120  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.524471  normal  0.183753 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1210  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.57 
 
 
529 aa  119  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1260  hypothetical protein  25.89 
 
 
529 aa  115  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09991  GTPase SAR1 and related small G proteins  26.87 
 
 
496 aa  114  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09451  GTPase SAR1  25.51 
 
 
499 aa  101  4e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09441  GTPase SAR1 and related small G protein  26.09 
 
 
499 aa  99.8  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0884  small GTP-binding protein domain-containing protein  24.83 
 
 
499 aa  97.4  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.102699  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4193  hypothetical protein  27.1 
 
 
471 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.296514 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0732  hypothetical protein  24.72 
 
 
481 aa  79.3  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00108673  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0765  hypothetical protein  29.17 
 
 
472 aa  78.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2529  hypothetical protein  29.39 
 
 
475 aa  68.6  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  31.78 
 
 
548 aa  66.2  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3402  putative GTPase  33.33 
 
 
294 aa  64.3  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4797  putative GTPase  33.33 
 
 
294 aa  64.3  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.276697 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3202  putative GTPase  35.43 
 
 
294 aa  63.9  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  30 
 
 
302 aa  63.9  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3579  hypothetical protein  28.7 
 
 
463 aa  63.9  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2152  small GTP-binding protein  34 
 
 
409 aa  63.5  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  31.71 
 
 
583 aa  63.5  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4685  putative GTPase  33.33 
 
 
294 aa  62.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2527  hypothetical protein  28.57 
 
 
463 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1243  small GTP-binding protein  29.75 
 
 
425 aa  60.8  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1620  GTP-binding protein EngA  33.11 
 
 
436 aa  60.8  0.00000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3840  hypothetical protein  25.4 
 
 
492 aa  60.8  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.83902  normal  0.693476 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  25.89 
 
 
605 aa  60.5  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16490  iron-only hydrogenase maturation protein HydF  30.66 
 
 
416 aa  59.7  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.520712  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3103  small GTP-binding protein  30.5 
 
 
396 aa  60.1  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1862  small GTP-binding protein  31.11 
 
 
398 aa  59.7  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.803475  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0165  small GTP-binding protein  30.67 
 
 
427 aa  59.3  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl014  tRNA modification GTPase TrmE  31.18 
 
 
452 aa  59.3  0.0000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1205  GTP-binding protein Era  27.93 
 
 
297 aa  59.3  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.282602 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  27.42 
 
 
632 aa  59.3  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0359  GTP-binding protein EngA  32.43 
 
 
436 aa  58.5  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1629  GTPases  32.35 
 
 
416 aa  58.2  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000232915  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0463  bifunctional cytidylate kinase/GTP-binding protein  35.92 
 
 
709 aa  58.2  0.0000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.816012  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  32.43 
 
 
587 aa  57.8  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0146  small GTP-binding protein  35.51 
 
 
398 aa  57.8  0.0000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0325934  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2137  tRNA modification GTPase TrmE  32.24 
 
 
461 aa  57.4  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.075642 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2457  GTP-binding protein Era  36.43 
 
 
306 aa  57  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0683  small GTP-binding protein  28.48 
 
 
408 aa  57  0.0000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00203334  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13281  GTP-binding protein Era-like protein  29.5 
 
 
314 aa  56.6  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.593826 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0208  GTP-binding protein Era  30.86 
 
 
297 aa  56.2  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  31.41 
 
 
546 aa  56.6  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  30.19 
 
 
589 aa  56.2  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1422  ribosome-associated GTPase EngA  27.54 
 
 
484 aa  56.2  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4121  GTP-binding protein Era  32.39 
 
 
305 aa  55.1  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.383616  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4517  GTP-binding protein Era  30.14 
 
 
337 aa  55.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0548  tRNA modification GTPase TrmE  29.8 
 
 
442 aa  55.5  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3787  GTP-binding protein Era  33.57 
 
 
468 aa  54.7  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.0434052 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3235  GTP-binding protein Era  30.07 
 
 
489 aa  54.7  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00276402  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1159  GTP-binding protein EngA  29.41 
 
 
436 aa  54.7  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.427593  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  26.92 
 
 
301 aa  54.7  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1494  small GTP-binding protein  33.1 
 
 
412 aa  54.7  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3926  GTP-binding protein  31.85 
 
 
394 aa  53.9  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0475  small GTP-binding protein  30.6 
 
 
404 aa  53.9  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  28.21 
 
 
298 aa  53.9  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0160  GTP-binding protein Era  30.19 
 
 
311 aa  53.9  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.709103  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0490  small GTP-binding protein  30.6 
 
 
404 aa  53.9  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0536  GTP-binding protein EngA  27.84 
 
 
461 aa  53.9  0.000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  26.45 
 
 
301 aa  53.9  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  26.45 
 
 
301 aa  53.5  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  26.45 
 
 
301 aa  53.9  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  26.45 
 
 
301 aa  53.9  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  26.45 
 
 
301 aa  53.9  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>