250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3176 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  62.45 
 
 		 486 aa  644    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0200  zeta-carotene desaturase  77.66 
 
 		 479 aa  806    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  64.92 
 
 		 478 aa  657    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0335  carotene 7,8-desaturase  66.25 
 
 		 488 aa  663    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  66.67 
 
 		 488 aa  667    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1512  zeta-carotene desaturase  75.37 
 
 		 481 aa  742    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.311968  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4788  carotene 7,8-desaturase  76.41 
 
 		 479 aa  781    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3954  zeta-carotene desaturase  76.41 
 
 		 483 aa  791    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.596487 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2686  carotene 7,8-desaturase  78.74 
 
 		 490 aa  801    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3430  carotene 7,8-desaturase  78.74 
 
 		 490 aa  801    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0679  carotene 7,8-desaturase  78.91 
 
 		 489 aa  802    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3176  carotene 7,8-desaturase  100 
 
 		 482 aa  1000    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  62.45 
 
 		 486 aa  647    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26211  zeta-carotene desaturase  66.18 
 
 		 490 aa  640    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01321  zeta-carotene desaturase  58.95 
 
 		 484 aa  602  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01331  zeta-carotene desaturase  59.37 
 
 		 484 aa  603  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0118  zeta-carotene desaturase  58.95 
 
 		 499 aa  599  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01291  zeta-carotene desaturase  58.53 
 
 		 484 aa  600  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53974  zeta-carotene desaturase  56.81 
 
 		 591 aa  565  1e-160  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.246168  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0916  Carotene 7,8-desaturase  35.07 
 
 		 453 aa  292  9e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0830  zeta-carotene desaturase  34.11 
 
 		 453 aa  291  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.762196  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1415  carotene 7,8-desaturase  34.57 
 
 		 453 aa  290  3e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1590  zeta-carotene desaturase  33.68 
 
 		 455 aa  290  4e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1524  Carotene 7,8-desaturase  34.58 
 
 		 453 aa  287  2.9999999999999996e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615844  normal  0.187981 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1769  Carotene 7,8-desaturase  33.75 
 
 		 453 aa  286  7e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0949  Carotene 7,8-desaturase  33.95 
 
 		 453 aa  283  5.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3041  Carotene 7,8-desaturase  34.32 
 
 		 463 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000261003 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  34.09 
 
 		 471 aa  260  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  34.23 
 
 		 475 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  34.97 
 
 		 479 aa  258  1e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0308  phytoene desaturase  34.09 
 
 		 475 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01611  phytoene desaturase  33.12 
 
 		 466 aa  257  4e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01631  phytoene desaturase  32.92 
 
 		 466 aa  255  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26651  phytoene desaturase  34.44 
 
 		 472 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  32.66 
 
 		 474 aa  253  4.0000000000000004e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01721  phytoene desaturase  32.43 
 
 		 473 aa  252  8.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.69255  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0146  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  32.5 
 
 		 465 aa  252  9.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01591  phytoene desaturase  33.06 
 
 		 472 aa  249  6e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2395  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  34.37 
 
 		 472 aa  247  3e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4188  phytoene desaturase  34.3 
 
 		 477 aa  247  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.422832  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  33.67 
 
 		 599 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  31.74 
 
 		 589 aa  244  3e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  32.51 
 
 		 479 aa  242  1e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4011  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  32.78 
 
 		 459 aa  239  9e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02161  phytoene desaturase  32.22 
 
 		 462 aa  239  9e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0298  carotene 7,8-desaturase  33.26 
 
 		 472 aa  238  1e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1510  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  32.02 
 
 		 464 aa  238  2e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  32.2 
 
 		 461 aa  232  1e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  31.53 
 
 		 624 aa  230  4e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0884  Carotene 7,8-desaturase  32 
 
 		 460 aa  229  9e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000776733  normal  0.0521549 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1283  carotene 7,8-desaturase  31.03 
 
 		 462 aa  222  1.9999999999999999e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.859886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1181  Carotene 7,8-desaturase  31.36 
 
 		 459 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000113252  normal  0.0145788 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1176  Carotene 7,8-desaturase  31.75 
 
 		 462 aa  217  4e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.180076  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1173  zeta-carotene desaturase  30.56 
 
 		 461 aa  215  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000320899  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0877  Carotene 7,8-desaturase  29.57 
 
 		 460 aa  206  9e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0378337  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  30.69 
 
 		 552 aa  204  3e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4135  carotene 7,8-desaturase  26.88 
 
 		 451 aa  146  9e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4330  amine oxidase  25.36 
 
 		 500 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0368  amine oxidase  24.27 
 
 		 503 aa  125  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1747  carotene 7,8-desaturase  26.43 
 
 		 481 aa  123  6e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.969616 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23100  squalene-associated FAD-dependent desaturase  25.8 
 
 		 439 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.620646  normal  0.191871 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3736  amine oxidase  26.03 
 
 		 520 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4193  squalene-associated FAD-dependent desaturase  27.23 
 
 		 447 aa  115  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1523  amine oxidase  24 
 
 		 438 aa  106  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.834861  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2707  amine oxidase  26.18 
 
 		 410 aa  99  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0288942  hitchhiker  0.00000819833 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4945  amine oxidase  24.07 
 
 		 452 aa  93.6  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5326  amine oxidase  24.07 
 
 		 452 aa  93.6  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5033  amine oxidase  24.07 
 
 		 452 aa  93.6  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3204  squalene-associated FAD-dependent desaturase  24.69 
 
 		 477 aa  88.6  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.55236  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5715  amine oxidase  24.4 
 
 		 562 aa  89  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0865614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0821  amine oxidase  25.91 
 
 		 569 aa  85.5  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.147648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15806  pds-like3, phytoene desaturase-like protein  24.49 
 
 		 506 aa  84.7  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.488175  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0307  amine oxidase  23.41 
 
 		 448 aa  84.3  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2162  amine oxidase  24.2 
 
 		 811 aa  83.2  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.352891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5459  amine oxidase  22.35 
 
 		 506 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.723961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5080  amine oxidase  22.35 
 
 		 506 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.984429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5168  amine oxidase  22.35 
 
 		 506 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1695  amine oxidase  24.57 
 
 		 486 aa  77  0.0000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.916682  hitchhiker  0.0000276291 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  28.41 
 
 		 647 aa  73.6  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  28.41 
 
 		 647 aa  73.6  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5425  squalene-associated FAD-dependent desaturase  23.97 
 
 		 433 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2440  squalene-associated FAD-dependent desaturase  21.21 
 
 		 447 aa  73.2  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1875  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.3 
 
 		 639 aa  72  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0135993 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  27.78 
 
 		 647 aa  72  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  27.31 
 
 		 645 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1513  squalene-associated FAD-dependent desaturase  23.46 
 
 		 444 aa  67.4  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.156187  hitchhiker  0.00817062 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4516  amine oxidase  22.27 
 
 		 432 aa  67.8  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3962  Polyprenyl synthetase  24.86 
 
 		 989 aa  67  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.190104  normal  0.617204 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0117  amine oxidase  24.05 
 
 		 410 aa  66.2  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26460  hypothetical protein  23.76 
 
 		 482 aa  66.6  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.214193  normal  0.663003 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5205  amine oxidase  26.31 
 
 		 565 aa  64.7  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1844  amine oxidase  22.98 
 
 		 511 aa  64.3  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0764  twin-arginine translocation pathway signal  22.2 
 
 		 594 aa  63.9  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0778  amine oxidase  22.2 
 
 		 594 aa  63.9  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1698  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.27 
 
 		 640 aa  63.9  0.000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0758  amine oxidase  22.01 
 
 		 594 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.744737 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1747  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.31 
 
 		 642 aa  62  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4947  amine oxidase  24.73 
 
 		 551 aa  62  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00497379  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6348  squalene-associated FAD-dependent desaturase  24.17 
 
 		 424 aa  60.8  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0839028  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0241  amine oxidase  44.93 
 
 		 508 aa  60.5  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.363504 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>