72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0841 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0841  NHL repeat containing protein  100 
 
 
621 aa  1204    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.81979 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8646  NHL repeat containing protein  39.51 
 
 
658 aa  340  4e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0903  NHL repeat-containing protein  26.64 
 
 
664 aa  182  1e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.772896  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1496  NHL repeat-containing protein  27.05 
 
 
673 aa  179  1e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21261  NHL repeat-containing protein  25.34 
 
 
570 aa  151  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.404692 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5167  hypothetical protein  29.32 
 
 
708 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665206  hitchhiker  0.000692759 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0316  hypothetical protein  28.14 
 
 
439 aa  99  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  30.51 
 
 
664 aa  73.9  0.000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  27.44 
 
 
307 aa  68.6  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1165  NHL repeat containing protein  29.95 
 
 
950 aa  65.5  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0259008 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  27.73 
 
 
709 aa  63.5  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  27.11 
 
 
831 aa  63.5  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  29.41 
 
 
579 aa  62.4  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  26.33 
 
 
668 aa  62  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  28.27 
 
 
387 aa  61.6  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  26.99 
 
 
930 aa  61.6  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  28.16 
 
 
786 aa  61.2  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.98 
 
 
343 aa  60.8  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  27.27 
 
 
627 aa  60.5  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  26.11 
 
 
346 aa  59.3  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  26.25 
 
 
963 aa  57  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  27.5 
 
 
930 aa  56.6  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.14 
 
 
1292 aa  56.6  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  26.51 
 
 
491 aa  57  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2572  hypothetical protein  25 
 
 
1608 aa  55.5  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  33.33 
 
 
522 aa  55.1  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1858  serine/threonine-protein kinase  29.61 
 
 
274 aa  53.5  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0646  gluconolactonase  23.71 
 
 
280 aa  53.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.13949 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  25 
 
 
439 aa  53.1  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1652  copper resistance D domain-containing protein  23.35 
 
 
927 aa  53.5  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2758  NHL repeat-containing protein  24.4 
 
 
396 aa  52.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  28.65 
 
 
1146 aa  52  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0908  gluconolactonase  26.82 
 
 
342 aa  52.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.17943 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  26.37 
 
 
392 aa  52.4  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  27.14 
 
 
347 aa  52.4  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2495  hypothetical protein  27.56 
 
 
460 aa  51.6  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  24.01 
 
 
676 aa  51.6  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1097  Kelch repeat-containing protein  25 
 
 
1557 aa  51.2  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612946  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2914  NHL repeat-containing protein  25.63 
 
 
315 aa  50.8  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3843  NHL repeat containing protein  24.04 
 
 
1046 aa  50.8  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0246016 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.46 
 
 
1949 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  24.61 
 
 
1051 aa  50.4  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  26.56 
 
 
1750 aa  50.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.25 
 
 
693 aa  49.7  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1611  Fibronectin type III domain protein  29.32 
 
 
805 aa  48.9  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.000457229  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10998  PE-PGRS family protein  30.11 
 
 
457 aa  47.8  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104383  normal  0.995085 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0617  NHL repeat-containing protein  25.13 
 
 
361 aa  47.4  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1014  NHL repeat containing protein  29.55 
 
 
444 aa  47.4  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00195026  normal  0.319723 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  26.4 
 
 
1163 aa  47.4  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3465  copper amine oxidase domain protein  29.21 
 
 
447 aa  47  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  25 
 
 
1026 aa  46.6  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2303  gluconolactonase  25.12 
 
 
345 aa  47  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000255623 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3112  NHL repeat containing protein  24.26 
 
 
436 aa  47  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  29.76 
 
 
355 aa  46.6  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3880  hypothetical protein  30.91 
 
 
320 aa  45.1  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133982  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0842  YD repeat-containing protein  25.43 
 
 
2831 aa  45.4  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  25.73 
 
 
363 aa  45.4  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3939  NHL repeat-containing protein  34.78 
 
 
454 aa  45.4  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0801194 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  24.84 
 
 
343 aa  45.4  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  22.94 
 
 
752 aa  45.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  21.43 
 
 
1030 aa  44.7  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0248  putative hydrolase transmembrane protein  26.42 
 
 
335 aa  44.7  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  27.68 
 
 
322 aa  44.3  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2329  NHL repeat containing protein  22.3 
 
 
404 aa  44.7  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0716797  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  21.35 
 
 
1351 aa  44.3  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13557  hypothetical protein  29.61 
 
 
343 aa  44.3  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000762607 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10996  PE-PGRS family protein  30.23 
 
 
313 aa  44.3  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.7191000000000003e-35  normal  0.547752 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  22.61 
 
 
353 aa  43.9  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  28.78 
 
 
390 aa  43.9  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0923  NHL repeat-containing protein  28.22 
 
 
379 aa  43.9  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1192  NHL repeat containing protein  30.83 
 
 
405 aa  43.5  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  25.64 
 
 
418 aa  43.9  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>