12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0316 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0316  hypothetical protein  100 
 
 		 439 aa  854    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8646  NHL repeat containing protein  32.06 
 
 		 658 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5167  hypothetical protein  37.77 
 
 		 708 aa  113  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665206  hitchhiker  0.000692759 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0841  NHL repeat containing protein  26.97 
 
 		 621 aa  102  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.81979 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0903  NHL repeat-containing protein  31.87 
 
 		 664 aa  67.4  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.772896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1496  NHL repeat-containing protein  31.79 
 
 		 673 aa  61.2  0.00000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21261  NHL repeat-containing protein  24.09 
 
 		 570 aa  61.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.404692 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2572  hypothetical protein  23.93 
 
 		 1608 aa  45.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  27.5 
 
 		 439 aa  45.8  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  31.43 
 
 		 668 aa  44.3  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  36.92 
 
 		 391 aa  43.1  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  30.08 
 
 		 307 aa  43.1  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>