More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0394 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0394  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 250 aa  491  9.999999999999999e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.143272  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 229 aa  110  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1538  transcriptional regulator, GntR family  33.65 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0494418 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 262 aa  98.2  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 262 aa  98.2  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 238 aa  97.8  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1174  GntR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 241 aa  97.8  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 223 aa  96.7  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 253 aa  96.7  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  32.97 
 
 		 223 aa  95.5  8e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 225 aa  95.1  9e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  30.92 
 
 		 226 aa  95.1  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  33.96 
 
 		 258 aa  94.4  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 255 aa  94  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 255 aa  94.4  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 255 aa  94.4  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0150  transcriptional regulator, GntR family  34 
 
 		 209 aa  94  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.80263  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 255 aa  94.4  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2101  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 222 aa  93.2  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.98754 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1517  transcriptional regulator, GntR family  34.47 
 
 		 225 aa  92  7e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.156852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 255 aa  91.7  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3236  GntR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 250 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.686096  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3649  GntR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 250 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.078478  normal  0.168934 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2259  GntR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 250 aa  89  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  35.03 
 
 		 225 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 230 aa  88.2  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1979  transcriptional regulator, GntR family  28.17 
 
 		 220 aa  87.4  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.053401  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 254 aa  87  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2081  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 250 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2405  transcriptional regulator GntR  34.62 
 
 		 250 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.146644  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 242 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0430  transcriptional regulator, GntR family  31.28 
 
 		 235 aa  86.3  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0615592  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0417  GntR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 254 aa  86.3  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2372  transcriptional regulator, GntR family  30.37 
 
 		 225 aa  85.9  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000612735  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3443  GntR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 266 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2671  transcriptional regulator, GntR family  34.07 
 
 		 250 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0107111  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 290 aa  85.9  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1568  transcriptional regulator, GntR family  33.02 
 
 		 219 aa  85.5  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  28.95 
 
 		 228 aa  85.5  8e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 229 aa  85.5  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1252  transcriptional regulator, GntR family  34.09 
 
 		 232 aa  85.1  8e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.148319  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3139  GntR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 284 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00307264  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0584  transcriptional regulator, GntR family  35.2 
 
 		 231 aa  85.1  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.525368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4650  regulatory protein GntR HTH  35.59 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 256 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0043  transcriptional regulator, GntR family  33.68 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0169991 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5113  transcriptional regulator, GntR family  35.03 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  0.823532 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4175  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  34.74 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1713  transcriptional regulator, GntR family  32.87 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8046  transcriptional regulator, GntR family  31.63 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529008  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 233 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 249 aa  83.2  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2254  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 254 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.576687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  29.85 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  30.99 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  28.38 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3219  GntR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 257 aa  82  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0764465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  34.5 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5651  transcriptional regulator, GntR family  31.31 
 
 		 219 aa  82  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0870438  normal  0.299655 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3350  transcriptional regulator, GntR family  29.02 
 
 		 234 aa  81.3  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.398966  normal  0.021988 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1711  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 226 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.968918  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 219 aa  81.6  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44780  putative transcriptional regulator  32.31 
 
 		 259 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.13802  normal  0.152718 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5228  transcriptional regulator, GntR family  30.73 
 
 		 262 aa  81.6  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 267 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  29.61 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2293  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235113  hitchhiker  0.00231289 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1190  transcriptional regulator, GntR family  30.81 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.814536  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0293  GntR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 230 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.972725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1510  GntR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 232 aa  80.1  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4456  GntR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1614  transcriptional regulator, GntR family  30.91 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  32.8 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3711  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  32.8 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3813  putative transcriptional regulator  31.79 
 
 		 259 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.12567  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5075  transcriptional regulator, GntR family  35.98 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.686169  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0551  transcriptional regulator, GntR family  28.29 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3123  transcriptional regulator, GntR family  32.49 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 234 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  31.34 
 
 		 227 aa  79  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 232 aa  79  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1505  transcriptional regulator, GntR family  31.61 
 
 		 243 aa  79  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.160619  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 233 aa  78.2  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1569  GntR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 230 aa  78.2  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0715  regulatory protein GntR, HTH  30.61 
 
 		 234 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  30.26 
 
 		 238 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0568  GntR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 396 aa  78.2  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  30.26 
 
 		 240 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 229 aa  78.2  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 239 aa  77.4  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  30.14 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5213  GntR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 221 aa  77.8  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380021  normal  0.310032 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1342  GntR domain protein  31.73 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00721185  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>