97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2967 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2967  major facilitator transporter  100 
 
 		 392 aa  790    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2115  major facilitator transporter  63.38 
 
 		 386 aa  501  1e-141  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0419  major facilitator transporter  59.9 
 
 		 394 aa  468  9.999999999999999e-131  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.664236  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05760  fucose permease  56.61 
 
 		 414 aa  456  1e-127  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0598938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0439  major facilitator transporter  59.64 
 
 		 394 aa  455  1e-127  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.116076  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1115  major facilitator superfamily MFS_1  54.95 
 
 		 393 aa  440  9.999999999999999e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.948444  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0299  fucose permease  54.43 
 
 		 408 aa  426  1e-118  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.482849  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0694  transporter, major facilitator family protein  55.27 
 
 		 393 aa  413  1e-114  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1662  major facilitator superfamily MFS_1  51.89 
 
 		 388 aa  403  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0309  major facilitator superfamily MFS_1  52.94 
 
 		 394 aa  395  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  0.0116051 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1174  major facilitator transporter  48.95 
 
 		 389 aa  359  5e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0776  major facilitator transporter  51.79 
 
 		 326 aa  306  5.0000000000000004e-82  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1304  major facilitator transporter  38.8 
 
 		 390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1480  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 395 aa  203  4e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1068  major facilitator transporter  30.68 
 
 		 395 aa  195  1e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.355091 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13440  major facilitator superfamily MFS_1  32.55 
 
 		 425 aa  193  3e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1293  major facilitator superfamily MFS_1  30.56 
 
 		 407 aa  159  6e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.180985  normal  0.234354 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1163  hypothetical protein  25.61 
 
 		 391 aa  80.5  0.00000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.38877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3689  major facilitator transporter  24.58 
 
 		 395 aa  73.9  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.890108  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0680  major facilitator superfamily MFS_1  23.67 
 
 		 384 aa  73.2  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.668541  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08768  conserved hypothetical protein  22.69 
 
 		 433 aa  71.6  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0863373  normal  0.186532 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_11209  hypothetical protein  21.07 
 
 		 440 aa  71.2  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.873381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59900  predicted protein  25.65 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.787504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0130  major facilitator transporter  22.63 
 
 		 398 aa  64.7  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.453953  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01310  conserved hypothetical protein  22.46 
 
 		 529 aa  63.9  0.000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58946  predicted protein  24.29 
 
 		 419 aa  62.8  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.314593 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0065  major facilitator family transporter  25.7 
 
 		 388 aa  60.8  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0068  transporter, putative  25.35 
 
 		 391 aa  60.1  0.00000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45095  conserved hypothetical membrane protein  21.13 
 
 		 433 aa  58.9  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.562888 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2920  major facilitator transporter  25.16 
 
 		 382 aa  58.5  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3989  major facilitator transporter  20.78 
 
 		 406 aa  58.2  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137476  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  25.09 
 
 		 384 aa  55.5  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  24.5 
 
 		 387 aa  55.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2374  major facilitator superfamily MFS_1  23.53 
 
 		 401 aa  55.1  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  24.52 
 
 		 392 aa  54.3  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2088  major facilitator superfamily MFS_1  21.69 
 
 		 398 aa  53.9  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4044  L-fucose transporter  22.19 
 
 		 420 aa  53.9  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19000  sugar phosphate permease  23.84 
 
 		 387 aa  53.9  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.874746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7075  major facilitator family transporter  24.58 
 
 		 370 aa  53.1  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.240881  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  22.92 
 
 		 377 aa  53.1  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28819  predicted protein  22.55 
 
 		 505 aa  52.4  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00143526 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30800  fucose permease  23.13 
 
 		 414 aa  52.8  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  23.42 
 
 		 405 aa  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0062  major facilitator transporter  23.17 
 
 		 406 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.7183  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  22.25 
 
 		 378 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0067  major facilitator transporter  23.17 
 
 		 406 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37883  hitchhiker  0.00294151 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  22.16 
 
 		 386 aa  51.6  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0777  major facilitator transporter  45.28 
 
 		 59 aa  51.2  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36380  sugar phosphate permease  22.26 
 
 		 447 aa  50.8  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0066  major facilitator superfamily MFS_1  23.17 
 
 		 406 aa  50.4  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.574631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4287  major facilitator transporter  24.77 
 
 		 406 aa  50.1  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000504378  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0065  major facilitator transporter  27.09 
 
 		 406 aa  50.1  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.596651  decreased coverage  0.0000000729069 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0063  major facilitator transporter  27.09 
 
 		 406 aa  50.1  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0580428  unclonable  0.0000312687 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0067  major facilitator transporter  27.09 
 
 		 406 aa  50.1  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.700351  unclonable  0.0000000000855622 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01506  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G05090)  23.94 
 
 		 417 aa  49.7  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.898615 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2123  major facilitator superfamily MFS_1  20.14 
 
 		 395 aa  48.9  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.226237  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0434  major facilitator transporter  23.24 
 
 		 441 aa  48.1  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1509  major facilitator superfamily MFS_1  23.68 
 
 		 387 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07240  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17270)  24.25 
 
 		 411 aa  48.1  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  23.53 
 
 		 396 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2533  hypothetical protein  23.67 
 
 		 398 aa  48.1  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0651893  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31239  predicted protein  22.36 
 
 		 507 aa  48.1  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.144771  normal  0.813098 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1336  major facilitator transporter  20.69 
 
 		 404 aa  47.4  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3964  transporter, putative  21.25 
 
 		 407 aa  47.4  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000523123  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1512  major facilitator transporter  22.66 
 
 		 385 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6317  major facilitator transporter  22.66 
 
 		 385 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.384124 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  23.81 
 
 		 391 aa  46.6  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1181  transporter, putative  21.79 
 
 		 377 aa  46.6  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.510237  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1762  major facilitator superfamily (MFS)transporter  22.52 
 
 		 401 aa  46.6  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112506  normal  0.0259533 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1567  major facilitator transporter  30.1 
 
 		 392 aa  46.2  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0228  putative transport protein  24.93 
 
 		 378 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.402008  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6975  major facilitator transporter  22.52 
 
 		 385 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1174  major facilitator transporter  21.47 
 
 		 379 aa  45.8  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.394628  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0062  putative transporter  24.93 
 
 		 378 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1070  putative transporter  24.93 
 
 		 378 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.44302  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3265  major facilitator transporter  23.7 
 
 		 384 aa  45.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.025013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1229  putative transporter  24.93 
 
 		 378 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0534  major facilitator transporter  19.12 
 
 		 391 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1647  major facilitator family transporter  24.93 
 
 		 378 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1735  major facilitator superfamily permease  23.57 
 
 		 378 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0357  putative transporter  24.93 
 
 		 378 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39371  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12450  Major Facilitator Superfamily transporter  28.03 
 
 		 428 aa  44.3  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0744182  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1573  major facilitator superfamily MFS_1  28.25 
 
 		 410 aa  44.7  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0872  major facilitator superfamily MFS_1  22.06 
 
 		 405 aa  44.7  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0910499  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  22.91 
 
 		 405 aa  44.3  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0275  major facilitator superfamily MFS_1  24.29 
 
 		 371 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  24.58 
 
 		 402 aa  44.3  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  24.37 
 
 		 390 aa  43.9  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4139  major facilitator transporter  25.17 
 
 		 400 aa  43.9  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.896136  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3589  transporter, putative  25.74 
 
 		 383 aa  43.9  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  24.16 
 
 		 403 aa  43.5  0.006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0200  major facilitator superfamily MFS_1  23.05 
 
 		 415 aa  43.5  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1860  major facilitator superfamily MFS_1  22.67 
 
 		 407 aa  43.5  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.209124 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1189  major facilitator superfamily MFS_1  25.21 
 
 		 400 aa  43.5  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.051319  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0367  putative transporter  30.58 
 
 		 462 aa  43.1  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  21.04 
 
 		 419 aa  42.7  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3632  major facilitator superfamily MFS_1  23.81 
 
 		 433 aa  42.7  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>