166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6192 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_6192  Mammalian cell entry related domain protein  100 
 
 
332 aa  657    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.387563 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1867  Mammalian cell entry related domain protein  37.97 
 
 
316 aa  222  6e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.449047  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11078  hypothetical protein  35.82 
 
 
316 aa  196  4.0000000000000005e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4584  hypothetical protein  34.65 
 
 
321 aa  170  4e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4901  Mammalian cell entry related domain protein  31.44 
 
 
328 aa  166  6.9999999999999995e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.374077  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2113  Mammalian cell entry related domain protein  34.64 
 
 
316 aa  163  4.0000000000000004e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.202192  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3636  Mammalian cell entry related domain protein  31.82 
 
 
321 aa  162  7e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.676726 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0751  ABC transporter permease  31.17 
 
 
308 aa  142  5e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221313  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1049  hypothetical protein  29.11 
 
 
292 aa  120  3.9999999999999996e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00460957 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0638  hypothetical protein  26.9 
 
 
306 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.498696 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2344  Mammalian cell entry related domain protein  25.47 
 
 
314 aa  96.7  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1873  Mammalian cell entry related domain protein  28.34 
 
 
293 aa  91.7  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.010294 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1696  Mammalian cell entry related domain protein  29.02 
 
 
293 aa  85.5  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3705  hypothetical protein  26.45 
 
 
349 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0678  Mammalian cell entry related domain protein  24.52 
 
 
529 aa  77  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.828772 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1899  virulence factor Mce family protein  26.62 
 
 
349 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2254  Mammalian cell entry related domain protein  26.01 
 
 
292 aa  71.2  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.371924  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3316  Mammalian cell entry related domain protein  31.46 
 
 
266 aa  71.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.635964  hitchhiker  0.0000217652 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0795  Mammalian cell entry related domain protein  24.53 
 
 
328 aa  70.5  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0440  VpsC protein  27.6 
 
 
292 aa  70.1  0.00000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1272  virulence factor MCE-like protein-related protein  26.3 
 
 
347 aa  69.7  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.821992  hitchhiker  0.0000000117847 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4517  hypothetical protein  24.58 
 
 
359 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0329  hypothetical protein  23.15 
 
 
430 aa  67.4  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.967579  normal  0.70235 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1508  Mammalian cell entry related domain protein  23.26 
 
 
356 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.577537 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0838  virulence factor Mce family protein  23.26 
 
 
523 aa  64.7  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0478  VpsC protein  25.7 
 
 
292 aa  63.5  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.238955  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5281  Mammalian cell entry related domain protein  24.93 
 
 
340 aa  62.8  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.192594 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0926  mce-related protein  25.07 
 
 
360 aa  62  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0661  hypothetical protein  27.33 
 
 
292 aa  62  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2733  Mammalian cell entry related domain protein  22.7 
 
 
356 aa  61.6  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1810  Mammalian cell entry related domain protein  25.91 
 
 
341 aa  60.5  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2066  Mammalian cell entry related domain protein  22.49 
 
 
388 aa  60.1  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1739  Mammalian cell entry related domain protein  28.16 
 
 
292 aa  59.7  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2299  putative ABC transport system substrate-binding protein  36.36 
 
 
148 aa  59.3  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0104875  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0119  virulence factor MCE-like protein  24.22 
 
 
343 aa  59.3  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.410781  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0128  virulence factor Mce family protein  24.22 
 
 
343 aa  59.3  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.284372  normal  0.252656 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0109  virulence factor Mce family protein  24.22 
 
 
343 aa  59.3  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.971857  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2541  virulence factor MCE-like protein-related protein  24.17 
 
 
360 aa  58.9  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143277  hitchhiker  0.00000000000784881 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0315  signal peptide protein  24.7 
 
 
330 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1888  Mammalian cell entry related domain protein  21.53 
 
 
529 aa  58.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4164  virulence factor Mce family protein  25.19 
 
 
386 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0393  Mammalian cell entry related domain protein  24.15 
 
 
515 aa  56.2  0.0000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0070  hypothetical protein  23.73 
 
 
313 aa  55.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3214  hypothetical protein  23.29 
 
 
360 aa  55.8  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1243  hypothetical protein  23.22 
 
 
360 aa  55.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0039  hypothetical protein  22.36 
 
 
312 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292682  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4397  virulence factor Mce family protein  26.62 
 
 
430 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2514  hypothetical protein  25 
 
 
302 aa  54.7  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0373094  hitchhiker  0.00640469 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0099  hypothetical protein  23.3 
 
 
313 aa  53.9  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447004  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0795  hypothetical protein  31.3 
 
 
168 aa  54.3  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0952502  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2244  virulence factor Mce family protein  24.63 
 
 
356 aa  53.9  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0188  Mammalian cell entry related domain protein  24.42 
 
 
337 aa  53.5  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.107684  normal  0.968767 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0334  hypothetical protein  33.05 
 
 
187 aa  53.5  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0577  hypothetical protein  23.05 
 
 
308 aa  53.5  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.749568  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09320  virulence factor Mce family protein  25.91 
 
 
359 aa  53.5  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.906316 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0343  hypothetical protein  33.05 
 
 
187 aa  53.1  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.908048  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0626  ABC transporter permease  23.05 
 
 
308 aa  53.1  0.000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.112844  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2724  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.67 
 
 
184 aa  52.8  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3702  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.67 
 
 
188 aa  52.8  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3514  ABC transporter, inner membrane subunit  32.2 
 
 
184 aa  52.8  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.531635  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2691  hypothetical protein  32.2 
 
 
189 aa  52.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0995365  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0416  hypothetical protein  32.2 
 
 
189 aa  52.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249405  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3230  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.67 
 
 
186 aa  52.8  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.42671  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1779  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.67 
 
 
186 aa  52.8  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3675  mce family protein  36.67 
 
 
189 aa  52.8  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.090883  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3733  mce family protein  36.67 
 
 
186 aa  52.8  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2774  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.67 
 
 
186 aa  52.8  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0395  hypothetical protein  32.2 
 
 
187 aa  52.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.147868  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0140  hypothetical protein  22.19 
 
 
312 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.682464 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10171  MCE-family protein mce1B  25.1 
 
 
346 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3002  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.67 
 
 
176 aa  52.4  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.784047  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2438  hypothetical protein  32.2 
 
 
151 aa  51.6  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.284994  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3257  hypothetical protein  31.91 
 
 
179 aa  51.2  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5199  virulence factor Mce family protein  27.27 
 
 
453 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.214398  normal  0.135987 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2102  virulence factor Mce family protein  22.68 
 
 
343 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0525635  normal  0.778813 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1171  hypothetical protein  33.61 
 
 
168 aa  50.8  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2221  hypothetical protein  33.87 
 
 
153 aa  50.8  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.693824  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0560  hypothetical protein  28.79 
 
 
148 aa  50.8  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000625618  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0707  Mammalian cell entry related domain protein  22.93 
 
 
362 aa  50.8  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.886561  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10601  MCE-family protein mce2B  25.57 
 
 
275 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0319  hypothetical protein  32.73 
 
 
187 aa  51.2  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0287402  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1954  hypothetical protein  22.73 
 
 
360 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104433  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2399  hypothetical protein  29.32 
 
 
156 aa  50.4  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3392  hypothetical protein  30.85 
 
 
160 aa  50.4  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12001  MCE family lipoprotein LprM  25.75 
 
 
377 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000209342  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0177  Mammalian cell entry related domain protein  24.65 
 
 
322 aa  50.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0890  Mammalian cell entry related domain protein  29.32 
 
 
156 aa  50.4  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4614  virulence factor MCE-like protein  26.54 
 
 
453 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4702  virulence factor Mce family protein  26.54 
 
 
453 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0158  hypothetical protein  23.81 
 
 
312 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0239  hypothetical protein  27.4 
 
 
164 aa  50.1  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.852395 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1526  virulence factor MCE-like protein  23.29 
 
 
438 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1549  virulence factor Mce family protein  23.29 
 
 
438 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.427862  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1156  Mammalian cell entry related domain protein  31.01 
 
 
163 aa  49.7  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.482142  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0495  Mammalian cell entry related domain protein  34.55 
 
 
360 aa  49.7  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4997  virulence factor Mce family protein  26.54 
 
 
463 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.430498 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12870  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, substrate binding protein  34.78 
 
 
156 aa  49.3  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3023  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents periplasmic component-like protein  24.56 
 
 
338 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0981  hypothetical protein  30.25 
 
 
158 aa  49.3  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0097  Mammalian cell entry related domain protein  31.96 
 
 
160 aa  48.5  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000148019  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>