More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5492 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5492  peptide chain release factor 2  100 
 
 		 362 aa  749    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0496262 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0282  hypothetical protein  55.62 
 
 		 357 aa  416  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.394775 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1899  peptide chain release factor 2  54.8 
 
 		 367 aa  407  1.0000000000000001e-112  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0199155  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3994  peptide chain release factor 2  56.74 
 
 		 357 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0498322  normal  0.718153 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5751  hypothetical protein  54.21 
 
 		 358 aa  394  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1048  hypothetical protein  55.14 
 
 		 332 aa  386  1e-106  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09203  putative peptide chain release factor  58.63 
 
 		 316 aa  384  1e-105  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.165955  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2832  peptide chain release factor 2  53.22 
 
 		 358 aa  384  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.909356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1305  LigA  51.93 
 
 		 371 aa  375  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2031  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 363 aa  342  4e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0138456  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  48.28 
 
 		 372 aa  342  5.999999999999999e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0238  peptide chain release factor 2  49.86 
 
 		 363 aa  342  7e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000385966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2784  peptide chain release factor 2  49.57 
 
 		 363 aa  339  5e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.785261  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2538  peptide chain release factor 2  48.97 
 
 		 363 aa  338  7e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0209  peptide chain release factor 2  48.99 
 
 		 381 aa  336  3.9999999999999995e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  47.04 
 
 		 367 aa  331  1e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  46.18 
 
 		 364 aa  331  1e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5555  hypothetical protein  47.18 
 
 		 378 aa  330  3e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.12714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  51.39 
 
 		 326 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  45.63 
 
 		 371 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  47.87 
 
 		 332 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1057  peptide chain release factor 2  46.78 
 
 		 365 aa  320  3e-86  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  46.48 
 
 		 366 aa  318  9e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  45.59 
 
 		 373 aa  318  9e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1102  peptide chain release factor 2  48.2 
 
 		 337 aa  318  1e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.437069  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  46.61 
 
 		 367 aa  317  2e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  47.21 
 
 		 383 aa  316  4e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2340  peptide chain release factor 2  45.82 
 
 		 343 aa  316  5e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538916  normal  0.0748941 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  48.8 
 
 		 364 aa  315  7e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2038  peptide chain release factor 2  46.15 
 
 		 361 aa  315  8e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.763789  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0796  peptide chain release factor 2  45.87 
 
 		 354 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.570581  normal  0.0161038 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2844  peptide chain release factor 2  48.91 
 
 		 325 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1786  peptide chain release factor 2  49.03 
 
 		 317 aa  312  4.999999999999999e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000314162  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  44.48 
 
 		 366 aa  312  5.999999999999999e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  44.35 
 
 		 380 aa  311  9e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1869  hypothetical protein  45.28 
 
 		 371 aa  311  1e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638967 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0921  peptide chain release factor 2  46.06 
 
 		 349 aa  310  2e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.181333  normal  0.893084 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  44.6 
 
 		 372 aa  310  2e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  44.35 
 
 		 380 aa  310  2e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2553  peptide chain release factor 2  57.72 
 
 		 254 aa  311  2e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.333677  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  43.94 
 
 		 362 aa  310  2e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_509  peptide chain release factor 2  44.02 
 
 		 357 aa  309  4e-83  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231762  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0544  peptide chain release factor 2  46.3 
 
 		 356 aa  309  5e-83  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00703964  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  43.79 
 
 		 380 aa  308  8e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  44.07 
 
 		 380 aa  308  9e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  43.66 
 
 		 364 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  45.38 
 
 		 369 aa  308  1.0000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  43.73 
 
 		 362 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1002  peptide chain release factor 2  47.71 
 
 		 340 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000036065  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  44.87 
 
 		 357 aa  304  1.0000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  43.82 
 
 		 372 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  47.34 
 
 		 330 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  44.32 
 
 		 379 aa  305  1.0000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0421  peptide chain release factor 2  43.34 
 
 		 371 aa  303  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0023  peptide chain release factor 2  48.86 
 
 		 312 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000581574  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  44.08 
 
 		 368 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0245  peptide chain release factor 2  45.71 
 
 		 329 aa  303  2.0000000000000002e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  44.83 
 
 		 375 aa  303  2.0000000000000002e-81  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3725  peptide chain release factor 2  46.73 
 
 		 327 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1449  peptide chain release factor 2  44.22 
 
 		 359 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.768033 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5037  peptide chain release factor 2  46.42 
 
 		 326 aa  302  5.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4867  peptide chain release factor 2  46.42 
 
 		 326 aa  302  6.000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4882  peptide chain release factor 2  46.42 
 
 		 326 aa  302  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0328  peptide chain release factor 2  47.15 
 
 		 362 aa  302  6.000000000000001e-81  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0486  peptide chain release factor 2  44.19 
 
 		 349 aa  301  1e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.289866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0912  peptide chain release factor 2  46.71 
 
 		 375 aa  300  2e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.779276  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1471  peptide chain release factor 2  44.31 
 
 		 349 aa  300  2e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4980  peptide chain release factor 2  46.42 
 
 		 326 aa  300  2e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16430  peptide chain release factor 2  47.87 
 
 		 331 aa  300  2e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000953459  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  44.09 
 
 		 366 aa  300  2e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05470  peptide chain release factor 2  42.73 
 
 		 364 aa  300  2e-80  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0778  peptide chain release factor 2  47.5 
 
 		 331 aa  300  2e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  45.57 
 
 		 367 aa  299  4e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0421  hypothetical protein  45.07 
 
 		 365 aa  299  6e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  45.26 
 
 		 367 aa  298  7e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1686  peptide chain release factor 2  51.18 
 
 		 323 aa  298  9e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  46.73 
 
 		 330 aa  297  2e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2570  peptide chain release factor 2  43.6 
 
 		 417 aa  296  3e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0324776  normal  0.0245297 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1963  peptide chain release factor 2  43.94 
 
 		 367 aa  296  4e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  41.85 
 
 		 377 aa  296  5e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  41.35 
 
 		 367 aa  295  8e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0724  peptide chain release factor 2  47.81 
 
 		 312 aa  295  8e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0895  hypothetical protein  44.66 
 
 		 367 aa  294  1e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0852209 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0960  hypothetical protein  44.38 
 
 		 367 aa  294  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0655613 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0184  peptide chain release factor 2  42.86 
 
 		 372 aa  294  2e-78  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1248  peptide chain release factor 2  40.28 
 
 		 367 aa  293  3e-78  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.631536  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0054  peptide chain release factor 2  43.82 
 
 		 371 aa  293  3e-78  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  45.09 
 
 		 369 aa  293  4e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2274  peptide chain release factor 2  47.44 
 
 		 310 aa  293  5e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0838  peptide chain release factor 2  46.88 
 
 		 325 aa  292  5e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0982  hypothetical protein  45.1 
 
 		 364 aa  291  9e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1884  peptide chain release factor 2  42.23 
 
 		 459 aa  291  1e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344526  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1549  peptide chain release factor 2  46.37 
 
 		 369 aa  291  1e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2773  peptide chain release factor 2  43.15 
 
 		 355 aa  291  1e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1461  peptide chain release factor 2  43.91 
 
 		 364 aa  291  1e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2380  peptide chain release factor 2  56.97 
 
 		 249 aa  290  2e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1330  protein chain release factor B  44.51 
 
 		 332 aa  290  2e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000274876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4596  peptide chain release factor 2  42.86 
 
 		 372 aa  291  2e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1030  peptide chain release factor 2 protein  50.91 
 
 		 300 aa  290  3e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.235991  normal  0.771675 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1815  peptide chain release factor 2  43.06 
 
 		 402 aa  290  3e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0233065 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>