More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3821 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3821  band 7 protein  100 
 
 		 301 aa  610  9.999999999999999e-175  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.153561  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0666  HflC protein  45.1 
 
 		 289 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0703  HflC protein  35.9 
 
 		 281 aa  195  6e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0998  HflC protein  36.82 
 
 		 283 aa  188  1e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1108  HflC protein  36.82 
 
 		 283 aa  188  1e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0629  HflC protein  36.64 
 
 		 283 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2675  HflC protein  32.86 
 
 		 284 aa  170  2e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0148023 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0487  HflC protein  33.84 
 
 		 283 aa  170  3e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.426626 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2947  HflC protein  33.09 
 
 		 282 aa  170  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1574  HflC protein  34.93 
 
 		 300 aa  169  5e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000132487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2280  HflC protein  31.88 
 
 		 283 aa  168  9e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1320  HflC protein  33.57 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.422043  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3202  HflC protein  33.22 
 
 		 298 aa  165  9e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11004  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4004  HflC protein  31.32 
 
 		 308 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3351  HflC protein  31.8 
 
 		 311 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.713706  normal  0.149829 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2039  HflC protein  31.1 
 
 		 318 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.826229 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3261  HflC protein  30.18 
 
 		 300 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.103141  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6096  protease activity modulator HflK  32.45 
 
 		 311 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4528  HflC protein  31.6 
 
 		 325 aa  157  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.788095 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0900  HflC protein  27.86 
 
 		 289 aa  156  4e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.219855  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0002  HflC protein  33.07 
 
 		 281 aa  155  6e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1088  HflC protein  31.23 
 
 		 328 aa  155  8e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3537  HflC protein  32.28 
 
 		 292 aa  155  9e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000127879  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1663  HflC protein  30.14 
 
 		 300 aa  155  9e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.107349 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2459  HflC protein  28.83 
 
 		 290 aa  153  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118766 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2977  hypothetical protein  30.34 
 
 		 295 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2657  HflC protein  30.38 
 
 		 316 aa  152  8e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.267381 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3308  HflC protein  31.87 
 
 		 292 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00652  Membrane protease, stomatin/prohibitin family protein  30.66 
 
 		 293 aa  151  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2884  HflC protein  30.38 
 
 		 313 aa  151  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2727  HflC protein  30.53 
 
 		 299 aa  150  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772067  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2348  hypothetical protein  30.11 
 
 		 298 aa  150  3e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0800  HflC protein  31.69 
 
 		 292 aa  150  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00875081  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2263  HflC protein  31.82 
 
 		 310 aa  149  6e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00649366  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3382  HflC protein  30.88 
 
 		 293 aa  149  7e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0867  HflC protein  30.8 
 
 		 282 aa  149  8e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00264104  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2779  HflC protein  30.03 
 
 		 320 aa  149  8e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0702  HflC protein  31.82 
 
 		 310 aa  148  9e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.999552  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4167  HflC protein  31.36 
 
 		 292 aa  148  9e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000744211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3235  HflC protein  28.82 
 
 		 288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000478035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0600  HflC protein  30.03 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00172359  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1091  HflC protein  31.18 
 
 		 284 aa  147  3e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3981  HflC protein  29.93 
 
 		 294 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.515796  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0601  HflC protein  30.03 
 
 		 297 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974479  hitchhiker  0.00702769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3429  HflC protein  30.03 
 
 		 297 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00841397  normal  0.0439963 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1955  HflC protein  30.88 
 
 		 294 aa  145  9e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.905613  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02635  HflC protein  30.96 
 
 		 282 aa  144  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3172  HflC protein  30.99 
 
 		 300 aa  144  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1280  HflC protein  29.37 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.393692  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3764  HflC protein  30.69 
 
 		 297 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000648597  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0561  HflC protein  30.69 
 
 		 297 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000351984  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3890  HflC protein  30.69 
 
 		 297 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000138111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3707  HflC protein  30.69 
 
 		 297 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572982  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0606  hflC protein  29.59 
 
 		 297 aa  143  4e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3650  FtsH protease regulator HflC  27.52 
 
 		 334 aa  142  6e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0696  FtsH protease regulator HflC  27.52 
 
 		 334 aa  142  6e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3795  FtsH protease regulator HflC  27.52 
 
 		 334 aa  142  6e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0663  HflC protein  25.7 
 
 		 302 aa  142  9e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0721748  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2735  protein hflC  30.18 
 
 		 297 aa  141  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0491808  normal  0.0307139 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0576  HflC protein  29.54 
 
 		 298 aa  141  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  hitchhiker  0.000000000249888 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1721  HflC protein  30.04 
 
 		 287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1786  integral membrane proteinase  30.04 
 
 		 287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1941  HflC protein  27.6 
 
 		 294 aa  140  3e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3022  hflC protein  30.77 
 
 		 308 aa  140  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000029647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0844  hypothetical protein  29.17 
 
 		 290 aa  139  7.999999999999999e-32  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3277  HflC protein  30.38 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000125944  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2202  hypothetical protein  29.27 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0569  HflC protein  29.17 
 
 		 292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000254764  normal  0.126336 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3015  HflC protein  30.07 
 
 		 287 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.698845  normal  0.140863 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0264  HflC protein  31.16 
 
 		 282 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2629  HflC protein  30.14 
 
 		 293 aa  135  8e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000539146 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0328  HflC protein  28.41 
 
 		 295 aa  135  9e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.791365  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3718  FtsH protease regulator HflC  27.33 
 
 		 331 aa  133  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0820553  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0605  HflC protein  28.62 
 
 		 312 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0249897 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3916  FtsH protease regulator HflC  27.19 
 
 		 331 aa  133  5e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32908  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2766  HflC protein  28.72 
 
 		 291 aa  132  5e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.147962  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1586  HflC protein  29.07 
 
 		 294 aa  133  5e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.258127  unclonable  0.000000224598 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2010  HflC protein  30.58 
 
 		 293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0721507  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0434  FtsH protease regulator HflC  27.58 
 
 		 335 aa  130  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.476328  unclonable  0.0000000374568 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2587  HflC-like protein  29.26 
 
 		 304 aa  130  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0635076  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1051  hflC protein  27.93 
 
 		 289 aa  130  3e-29  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0832  hflC protein  31.02 
 
 		 290 aa  129  5.0000000000000004e-29  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.379816  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1562  HflC protein  31.07 
 
 		 290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000166482 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2023  HflC protein  28.67 
 
 		 292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.634094  normal  0.555139 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1887  hflC protein  31.07 
 
 		 290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0578137  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3671  HflC protein  30.23 
 
 		 369 aa  127  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.150506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3523  HflC protein  26.38 
 
 		 313 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0538  FtsH protease regulator HflC  27.16 
 
 		 331 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.255691  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0488  HflC protein  25.94 
 
 		 295 aa  126  4.0000000000000003e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0604  hypothetical protein  28.72 
 
 		 293 aa  125  7e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.256149 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0444  HflC protein  28.83 
 
 		 292 aa  125  7e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.653206  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0356  HflC protein  27.27 
 
 		 340 aa  125  9e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.534146  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2000  HflC protein  27.27 
 
 		 340 aa  125  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.491743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2860  HflC protein  25.63 
 
 		 295 aa  125  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1731  HflC protein  26.39 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000316611 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0165  HflC protein  30.47 
 
 		 286 aa  122  6e-27  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00225021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4417  FtsH protease regulator HflC  26.32 
 
 		 334 aa  122  7e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5691  FtsH protease regulator HflC  26.32 
 
 		 334 aa  122  7e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.187921  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04004  hypothetical protein  26.32 
 
 		 334 aa  122  7e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.054912  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4733  FtsH protease regulator HflC  26.32 
 
 		 334 aa  122  7e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>