216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1800 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 652 aa  1341    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  42.49 
 
 		 484 aa  285  2.0000000000000002e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0523  Chitinase  38.08 
 
 		 372 aa  264  3e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  35.97 
 
 		 674 aa  248  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  36.04 
 
 		 674 aa  248  4e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0373  glycoside hydrolase family protein  35.4 
 
 		 674 aa  247  4.9999999999999997e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  35.89 
 
 		 674 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  35.82 
 
 		 674 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  35.82 
 
 		 674 aa  244  3e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  35.68 
 
 		 674 aa  244  5e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  35.68 
 
 		 674 aa  244  5e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  35.68 
 
 		 674 aa  244  5e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  35.68 
 
 		 674 aa  244  5e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  35.4 
 
 		 674 aa  242  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2750  chitinase  37.75 
 
 		 521 aa  238  3e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  35.81 
 
 		 703 aa  220  5e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2175  Chitinase  32.91 
 
 		 639 aa  213  1e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0360  glycoside hydrolase family 18  32.95 
 
 		 652 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1550  glycoside hydrolase family 18  33.87 
 
 		 482 aa  196  9e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0322184  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3442  glycosyl hydrolase family chitinase  31.85 
 
 		 414 aa  196  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal  0.103323 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3870  glycosyl hydrolase family chitinase  31.15 
 
 		 1271 aa  190  5.999999999999999e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.762403  normal  0.150806 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  31.19 
 
 		 1578 aa  187  5e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  26.29 
 
 		 868 aa  184  6e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1799  glycoside hydrolase family protein  59.54 
 
 		 551 aa  183  7e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000760023  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  32 
 
 		 868 aa  182  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1460  glycosyl hydrolase family chitinase  34.77 
 
 		 763 aa  182  1e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.860815 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  31.19 
 
 		 867 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  30.95 
 
 		 868 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  30.95 
 
 		 868 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  31.12 
 
 		 869 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  30.71 
 
 		 868 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  28.76 
 
 		 1146 aa  175  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6135  glycoside hydrolase family 18  31.43 
 
 		 455 aa  174  5.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0191903 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1860  glycoside hydrolase family 18  26.29 
 
 		 1127 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686097  hitchhiker  0.0000000988456 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6134  glycoside hydrolase family 18  32.29 
 
 		 675 aa  171  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040621 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  26.29 
 
 		 1127 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2484  glycoside hydrolase family protein  26.04 
 
 		 1127 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2604  glycoside hydrolase family protein  26.24 
 
 		 1127 aa  171  4e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488265  hitchhiker  0.00483231 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  30.48 
 
 		 863 aa  170  6e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0638  chitodextrinase  30.12 
 
 		 1051 aa  171  6e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2719  glycoside hydrolase family protein  27.36 
 
 		 1129 aa  170  8e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716218  hitchhiker  0.00441293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6397  Chitinase  30.31 
 
 		 430 aa  170  9e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  26.04 
 
 		 868 aa  169  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2284  Chitinase  30.7 
 
 		 425 aa  168  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0361  glycoside hydrolase family 18  30 
 
 		 559 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  27.41 
 
 		 855 aa  166  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1345  glycoside hydrolase family 18  35.55 
 
 		 377 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3591  chitinase  32.81 
 
 		 401 aa  164  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21404 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  28.27 
 
 		 1053 aa  164  5.0000000000000005e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3086  glycoside hydrolase family 18  33.64 
 
 		 388 aa  162  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.800221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6846  Chitinase  28.9 
 
 		 855 aa  161  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.403057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2494  glycoside hydrolase family protein  29.98 
 
 		 904 aa  160  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  25.84 
 
 		 848 aa  160  5e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000210  chitodextrinase precursor  27.86 
 
 		 1054 aa  160  6e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0800752  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7134  Chitinase-like protein  32.33 
 
 		 662 aa  160  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1472  Chitinase  31.34 
 
 		 540 aa  160  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  25.62 
 
 		 848 aa  156  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13161  hypothetical protein  28.48 
 
 		 1080 aa  155  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.421524 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  25.99 
 
 		 972 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4306  Chitinase  27.88 
 
 		 772 aa  154  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.594159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8171  endo-chitinase, putative, chi18D  32.35 
 
 		 532 aa  153  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  31 
 
 		 792 aa  152  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0603  glycoside hydrolase family protein  30.39 
 
 		 472 aa  152  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.238448  normal  0.0453952 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2862  family 18 glycoside hydrolase  32.43 
 
 		 542 aa  151  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.857011  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04871  ChitinasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q92222]  31.16 
 
 		 398 aa  150  5e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.207138 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3559  chitinase  26.35 
 
 		 997 aa  150  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00432534  normal  0.147083 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0137  chitinase  28.54 
 
 		 563 aa  150  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06254  chitinase  27.73 
 
 		 431 aa  147  5e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3356  Chitinase  30.77 
 
 		 373 aa  145  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  0.141475 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0580  glycosyl hydrolase family chitinase  29.88 
 
 		 400 aa  144  4e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2809  glycoside hydrolase family 18  29.09 
 
 		 396 aa  142  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2572  glycoside hydrolase family protein  29.1 
 
 		 355 aa  141  3.9999999999999997e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0142654  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2923  glycoside hydrolase family 18  25.97 
 
 		 634 aa  139  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00791055  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01720  cytoplasm protein, putative  29 
 
 		 505 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.256066  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  28.77 
 
 		 854 aa  138  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6206  glycoside hydrolase family 18  31.28 
 
 		 536 aa  138  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  30.05 
 
 		 651 aa  136  9.999999999999999e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3485  chitinase  30.83 
 
 		 539 aa  136  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686156  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  27.93 
 
 		 762 aa  135  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1049  hypothetical protein  45.2 
 
 		 599 aa  132  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.17037  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3196  glycosyl hydrolase family chitinase  28.4 
 
 		 861 aa  130  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0825971  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05077  conserved hypothetical protein  26.65 
 
 		 1782 aa  130  9.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.724169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2268  Chitinase  29.28 
 
 		 382 aa  130  9.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.149886 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0868  glycosyl hydrolase family chitinase  29.11 
 
 		 451 aa  130  9.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0592  putative chitinase  29.36 
 
 		 760 aa  129  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1053  hypothetical protein  45.24 
 
 		 514 aa  127  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05454  class V chitinase ChiB1 (AFU_orthologue; AFUA_8G01410)  29.55 
 
 		 463 aa  127  7e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000620499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3476  chitinase  26.25 
 
 		 499 aa  127  7e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  29.63 
 
 		 1362 aa  126  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3258  glycoside hydrolase family protein  30.77 
 
 		 540 aa  125  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260959  normal  0.616625 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3148  glycoside hydrolase family 18  32.65 
 
 		 563 aa  125  3e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00268374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4757  glycoside hydrolase family protein  30.07 
 
 		 364 aa  125  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.385862  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1468  hypothetical protein  42.86 
 
 		 793 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3523  glycoside hydrolase family protein  27.21 
 
 		 375 aa  116  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.416811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0218  glycoside hydrolase family 18  26.11 
 
 		 586 aa  115  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09390  Chitinase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HFQ9]  26.3 
 
 		 1132 aa  115  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.099502 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2725  glycoside hydrolase family protein  34.01 
 
 		 426 aa  114  8.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00363291  hitchhiker  0.00148247 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0021  exochitinase  27.65 
 
 		 699 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.822563  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0020  exochitinase  27.65 
 
 		 699 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.410319 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0020  exochitinase  27.51 
 
 		 699 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.857408  normal  0.13273 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>