More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0897 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0897  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 545 aa  1087    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1572  MscS Mechanosensitive ion channel  59.44 
 
 		 548 aa  625  1e-178  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00917582 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2344  MscS Mechanosensitive ion channel  29.12 
 
 		 570 aa  206  7e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.809256 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2961  MscS Mechanosensitive ion channel  28.75 
 
 		 593 aa  206  9e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.80043  hitchhiker  0.0000000094968 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3258  MscS mechanosensitive ion channel  27.76 
 
 		 600 aa  194  4e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0680122  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1723  mechanosensitive ion channel family protein  28.18 
 
 		 545 aa  188  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.242798  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3676  MscS Mechanosensitive ion channel  27.39 
 
 		 524 aa  184  3e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3838  MscS Mechanosensitive ion channel  26.95 
 
 		 563 aa  183  7e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4074  MscS mechanosensitive ion channel  26.75 
 
 		 572 aa  179  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0997  MscS Mechanosensitive ion channel  29.29 
 
 		 579 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00010123  normal  0.396482 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3888  MscS Mechanosensitive ion channel  26.06 
 
 		 563 aa  177  6e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.203429 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0742  MscS Mechanosensitive ion channel  29.46 
 
 		 563 aa  173  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0771  MscS Mechanosensitive ion channel  29.26 
 
 		 563 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.034825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0508  MscS Mechanosensitive ion channel  27.2 
 
 		 566 aa  170  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1474  MscS Mechanosensitive ion channel  27.76 
 
 		 559 aa  169  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.793179  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1169  MscS Mechanosensitive ion channel  25.87 
 
 		 556 aa  168  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1278  small-conductance mechanosensitive channel-like  31.58 
 
 		 520 aa  157  4e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2427  MscS mechanosensitive ion channel  26.33 
 
 		 550 aa  157  6e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2865  MscS Mechanosensitive ion channel  25.79 
 
 		 545 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3231  MscS Mechanosensitive ion channel  25.59 
 
 		 545 aa  153  7e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.371413 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1050  MscS mechanosensitive ion channel  31.1 
 
 		 481 aa  150  5e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0806  MscS mechanosensitive ion channel  26.2 
 
 		 549 aa  145  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4449  MscS Mechanosensitive ion channel  27.2 
 
 		 546 aa  141  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4585  MscS mechanosensitive ion channel  25.8 
 
 		 571 aa  135  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.711383 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3049  MscS mechanosensitive ion channel  24.21 
 
 		 542 aa  103  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.369639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3012  MscS mechanosensitive ion channel  27.65 
 
 		 545 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4631  MscS mechanosensitive ion channel  22.74 
 
 		 581 aa  101  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2741  MscS mechanosensitive ion channel  27.65 
 
 		 545 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1646  MscS mechanosensitive ion channel  22.52 
 
 		 557 aa  97.8  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0364  MscS Mechanosensitive ion channel  24.6 
 
 		 538 aa  96.7  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000549474  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6131  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  29.66 
 
 		 489 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2387  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  30.34 
 
 		 490 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2895  helix-turn-helix, AraC type  25.52 
 
 		 264 aa  68.6  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0170548 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1546  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  25.15 
 
 		 479 aa  68.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  27.53 
 
 		 362 aa  67.8  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2295  mechanosensitive ion channel family protein  27.57 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1460  MscS mechanosensitive ion channel  29.52 
 
 		 493 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6368  MscS mechanosensitive ion channel  29.52 
 
 		 493 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7035  MscS mechanosensitive ion channel  29.52 
 
 		 493 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.666416  normal  0.218312 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  27.02 
 
 		 362 aa  64.3  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1770  MscS mechanosensitive ion channel  32.26 
 
 		 406 aa  63.5  0.000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2521  MscS mechanosensitive ion channel  21.94 
 
 		 230 aa  62.4  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.871653  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2715  small-conductance mechanosensitive channel  25.38 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2469  putative transport protein  23.6 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1062  MscS Mechanosensitive ion channel  25.58 
 
 		 310 aa  59.7  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0569  MscS Mechanosensitive ion channel  28.49 
 
 		 280 aa  58.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.912877  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5470  MscS mechanosensitive ion channel  31.61 
 
 		 835 aa  58.2  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0108  MscS mechanosensitive ion channel  29.68 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1689  MscS mechanosensitive ion channel  28.03 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2065  MscS mechanosensitive ion channel  29.7 
 
 		 359 aa  57.8  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  26 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1250  MscS mechanosensitive ion channel  30 
 
 		 361 aa  57.4  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000414305  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2105  MscS Mechanosensitive ion channel  24.14 
 
 		 414 aa  57  0.0000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0600957  normal  0.059013 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  26.11 
 
 		 364 aa  57  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1320  MscS Mechanosensitive ion channel  25.37 
 
 		 300 aa  56.2  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.23225 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1569  MscS mechanosensitive ion channel  27.45 
 
 		 342 aa  56.2  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.50156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2000  MscS Mechanosensitive ion channel  24.88 
 
 		 302 aa  56.6  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.03582 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3304  mechanosensitive channel MscS  24.62 
 
 		 286 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1146  MscS mechanosensitive ion channel  29.32 
 
 		 366 aa  56.2  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.779955  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3409  mechanosensitive channel MscS  24.1 
 
 		 286 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.427229  normal  0.109816 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3229  mechanosensitive channel MscS  24.1 
 
 		 286 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  25.93 
 
 		 299 aa  55.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3240  mechanosensitive channel MscS  24.1 
 
 		 286 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3307  mechanosensitive channel MscS  24.1 
 
 		 286 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3656  MscS mechanosensitive ion channel  29.21 
 
 		 856 aa  55.5  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.570339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3071  hypothetical protein  31.29 
 
 		 366 aa  55.1  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.962312  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2696  MscS Mechanosensitive ion channel  22.31 
 
 		 369 aa  55.1  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415509  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4139  MscS Mechanosensitive ion channel  26.33 
 
 		 815 aa  55.1  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  23.35 
 
 		 270 aa  55.1  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0435  MscS mechanosensitive ion channel  26.25 
 
 		 288 aa  55.5  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1417  MscS Mechanosensitive ion channel  22.38 
 
 		 304 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1074  MscS mechanosensitive ion channel  28.67 
 
 		 360 aa  54.7  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.287098  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0552  MscS Mechanosensitive ion channel  24.11 
 
 		 296 aa  54.3  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3699  MscS Mechanosensitive ion channel  23 
 
 		 283 aa  54.3  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0258  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  26.99 
 
 		 492 aa  54.3  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.986681 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3482  MscS mechanosensitive ion channel  29.94 
 
 		 813 aa  54.3  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144458  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  25.11 
 
 		 291 aa  53.9  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5117  potassium efflux protein KefA  29.55 
 
 		 1102 aa  53.9  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4382  MscS mechanosensitive ion channel  24.29 
 
 		 262 aa  53.9  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.496887  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0359  MscS mechanosensitive ion channel  27.56 
 
 		 360 aa  53.9  0.000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.821631  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0547  MscS mechanosensitive ion channel  27.71 
 
 		 305 aa  53.9  0.000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.881892  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66400  potassium efflux protein KefA  22.99 
 
 		 1118 aa  53.9  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  25.86 
 
 		 636 aa  53.5  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3333  MscS mechanosensitive ion channel  26.35 
 
 		 275 aa  53.5  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0556  MscS Mechanosensitive ion channel  23 
 
 		 293 aa  53.5  0.000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0769  MscS Mechanosensitive ion channel  24.04 
 
 		 286 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02718  hypothetical protein  24.04 
 
 		 286 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1552  MscS mechanosensitive ion channel  27.56 
 
 		 359 aa  53.5  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.101944 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  25.86 
 
 		 636 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3349  mechanosensitive channel MscS  24.04 
 
 		 286 aa  53.1  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0971  MscS mechanosensitive ion channel  29.11 
 
 		 272 aa  53.5  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0975842 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2402  hypothetical protein  26.32 
 
 		 279 aa  52.8  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.267781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3082  mechanosensitive channel MscS  24.04 
 
 		 286 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2771  MscS Mechanosensitive ion channel  21.33 
 
 		 296 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0399  potassium efflux protein KefA  29.55 
 
 		 1102 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0786  mechanosensitive channel MscS  24.04 
 
 		 286 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0786  MscS Mechanosensitive ion channel  32.21 
 
 		 840 aa  53.1  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3251  mechanosensitive channel MscS  24.04 
 
 		 286 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0857  MscS mechanosensitive ion channel  32.21 
 
 		 840 aa  53.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4221  mechanosensitive channel MscS  24.04 
 
 		 286 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>