More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1549 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE0426  ATPase, AAA family protein  65.1 
 
 		 570 aa  728    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1549  ATPase, AAA family protein  100 
 
 		 570 aa  1137    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.974713  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1579  ATPase, AAA family protein  64.75 
 
 		 570 aa  729    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0401  ATPase, AAA family protein  65.27 
 
 		 570 aa  729    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1774  cysteine synthase A  55.46 
 
 		 580 aa  602  1.0000000000000001e-171  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0393214  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1667  ATPase, AAA family protein  54.47 
 
 		 569 aa  586  1e-166  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0137  AAA ATPase central domain protein  48.95 
 
 		 577 aa  505  9.999999999999999e-143  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1833  AAA ATPase  45.09 
 
 		 578 aa  496  1e-139  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.735306  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1882  ATPase central domain-containing protein  36.04 
 
 		 617 aa  189  9e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3136  AAA ATPase, central region  35.16 
 
 		 478 aa  154  4e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3168  ATPase central domain-containing protein  30.47 
 
 		 434 aa  150  7e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0578626  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0755  AAA ATPase central domain protein  33.21 
 
 		 725 aa  148  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0362  ATPase central domain-containing protein  32.39 
 
 		 448 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1734  AAA ATPase central domain protein  33.07 
 
 		 697 aa  145  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.168086 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2830  ATPase central domain-containing protein  30.07 
 
 		 657 aa  142  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0659  AAA ATPase central domain protein  26.75 
 
 		 442 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0372478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2559  AAA ATPase central domain protein  36 
 
 		 450 aa  139  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1049  elongation factor P  28.17 
 
 		 432 aa  139  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3934  AAA ATPase central domain protein  34.25 
 
 		 450 aa  137  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1952  AAA ATPase central domain protein  28.67 
 
 		 656 aa  136  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.248161 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1651  ATPase central domain-containing protein  29.37 
 
 		 653 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496762 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3602  AAA ATPase, central region  30.12 
 
 		 448 aa  134  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000057004 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1669  AAA ATPase central domain protein  35 
 
 		 450 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1943  AAA ATPase central domain protein  31.3 
 
 		 619 aa  133  6.999999999999999e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00697304  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0972  AAA family ATPase  31.06 
 
 		 743 aa  133  7.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2524  AAA ATPase central domain protein  28.91 
 
 		 656 aa  133  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2996  AAA ATPase, central region  33.18 
 
 		 478 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4356  hypothetical protein  29.88 
 
 		 652 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00948823  normal  0.0832553 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1500  AAA ATPase central domain protein  27.27 
 
 		 639 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4120  AAA ATPase central domain protein  34.63 
 
 		 466 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0052109  hitchhiker  0.000242019 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1819  ATPase central domain-containing protein  31.94 
 
 		 662 aa  132  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.760352  normal  0.277502 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0853  AAA ATPase  31.18 
 
 		 305 aa  130  9.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2455  putative ATPase  32.49 
 
 		 441 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0571186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2933  AAA ATPase central domain protein  28.47 
 
 		 689 aa  127  8.000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4150  AAA ATPase central domain protein  29.45 
 
 		 665 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0859  AAA ATPase  28.99 
 
 		 634 aa  125  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1499  AAA ATPase central domain protein  30.93 
 
 		 744 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5237  AAA ATPase central domain protein  33.92 
 
 		 459 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.368199  hitchhiker  0.00000000902621 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5978  AAA ATPase central domain protein  32.35 
 
 		 1085 aa  118  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3811  ATPase central domain-containing protein  31.4 
 
 		 788 aa  118  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5257  AAA ATPase central domain protein  28.63 
 
 		 749 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1753  ATPase central domain-containing protein  31.82 
 
 		 450 aa  117  5e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.215663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1133  AAA ATPase, central region  34.88 
 
 		 445 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1893  AAA ATPase central domain protein  29.22 
 
 		 698 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00103439  normal  0.0680609 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0938  ATPase central domain-containing protein  29.58 
 
 		 671 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2258  AAA ATPase central domain protein  27.73 
 
 		 680 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226213  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2559  AAA ATPase  29.32 
 
 		 444 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000494228 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0827  AAA ATPase, central region  28.82 
 
 		 697 aa  110  5e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.934037  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1879  AAA ATPase  29.18 
 
 		 787 aa  110  6e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1822  ATPase central domain-containing protein  28.85 
 
 		 622 aa  108  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2009  AAA ATPase central domain protein  31.67 
 
 		 1193 aa  107  8e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5393  AAA ATPase central domain protein  29.66 
 
 		 682 aa  106  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1864  AAA ATPase central domain protein  31.72 
 
 		 678 aa  104  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0869  AAA ATPase family protein  33.2 
 
 		 352 aa  105  3e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000165138  normal  0.784704 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0165  putative ATPase protein  29.46 
 
 		 772 aa  105  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4054  AAA ATPase, central region  30.08 
 
 		 299 aa  102  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0357172 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1020  AAA ATPase central domain protein  28.51 
 
 		 646 aa  102  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0172  ATPase central domain-containing protein  30.99 
 
 		 387 aa  102  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4397  AAA ATPase central domain protein  28.38 
 
 		 687 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3267  ATPase central domain-containing protein  37.67 
 
 		 795 aa  100  7e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115516 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  28.62 
 
 		 391 aa  100  9e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0025  AAA ATPase central domain protein  32.56 
 
 		 443 aa  99.8  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1120  AAA ATPase central domain protein  30.61 
 
 		 711 aa  99  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.986172  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0150  AAA ATPase central domain protein  33.63 
 
 		 775 aa  99.4  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.172395  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1672  ATPase central domain-containing protein  30.59 
 
 		 369 aa  98.2  3e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00463679  normal  0.710335 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0112  ATPase central domain-containing protein  39.44 
 
 		 789 aa  98.6  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.181464 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0166  AAA ATPase, central region  39.29 
 
 		 789 aa  97.1  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11735  predicted protein  32.82 
 
 		 389 aa  97.1  8e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1890  AAA ATPase central domain protein  32.53 
 
 		 367 aa  95.1  3e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.439906  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2583  AAA ATPase central domain protein  33.78 
 
 		 419 aa  95.1  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0486  ATPase central domain-containing protein  36.08 
 
 		 424 aa  94.4  6e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0877  conserved hypothetical protein, putative ATPase, AAA family  33.77 
 
 		 640 aa  94  7e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.144041  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2115  AAA ATPase central domain protein  37.59 
 
 		 773 aa  92.8  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00930684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00294  ATPase, AAA family protein  36.42 
 
 		 676 aa  92.4  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2089  ATPase central domain-containing protein  32.81 
 
 		 428 aa  92  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1791  AAA ATPase central domain protein  36.88 
 
 		 773 aa  92  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3054  ATPase central domain-containing protein  32 
 
 		 725 aa  92.4  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000821112 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.52 
 
 		 739 aa  92.4  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  31.1 
 
 		 713 aa  92  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.72 
 
 		 732 aa  91.7  3e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1034  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.17 
 
 		 510 aa  90.1  9e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3794  AAA ATPase, central region  31.46 
 
 		 369 aa  90.1  9e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.437647  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1088  ATPase central domain-containing protein  28.38 
 
 		 397 aa  89.4  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1961  putative ATPase protein  35.06 
 
 		 771 aa  90.1  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.242778  normal  0.909939 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03550  endopeptidase, putative  28.39 
 
 		 450 aa  89.4  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.502719  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2234  AAA ATPase, central region  33.79 
 
 		 766 aa  89.7  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218503  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0801  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.9 
 
 		 806 aa  89.7  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704818  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07254  Cell division control protein 48 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AWS6]  28.74 
 
 		 814 aa  89  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  29.7 
 
 		 703 aa  89  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.47 
 
 		 742 aa  89  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  31.71 
 
 		 743 aa  89  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1765  ATPase central domain-containing protein  36.69 
 
 		 655 aa  89.4  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.835623  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  30.04 
 
 		 425 aa  89  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0165  AAA ATPase, central region  33.64 
 
 		 672 aa  88.6  3e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.49 
 
 		 719 aa  88.6  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.5 
 
 		 718 aa  88.6  3e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3114  ATPase central domain-containing protein  35.29 
 
 		 698 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.020083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0001  Vesicle-fusing ATPase  30.45 
 
 		 699 aa  87.8  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2106  AAA ATPase  28.69 
 
 		 371 aa  88.2  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2275  AAA ATPase, central region  35.21 
 
 		 771 aa  88.2  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0746104  hitchhiker  0.00641076 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>