More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1546 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE0312  methyl-accepting chemotaxis protein  59.33 
 
 		 662 aa  725    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1915  methyl-accepting chemotaxis protein  55.11 
 
 		 653 aa  691    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.633585  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0383  MCP-domain signal transduction protein  60.74 
 
 		 656 aa  705    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.168196  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0141  MCP-domain signal transduction protein  68.6 
 
 		 658 aa  856    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0289  methyl-accepting chemotaxis protein  58.63 
 
 		 665 aa  738    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1547  MCP-domain signal transduction protein  58.58 
 
 		 657 aa  682    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1331  MCP-domain signal transduction protein  61.02 
 
 		 678 aa  691    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1720  methyl-accepting chemotaxis protein  59.39 
 
 		 664 aa  745    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1546  MCP-domain signal transduction protein  100 
 
 		 660 aa  1335    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0314  methyl-accepting chemotaxis protein  48.01 
 
 		 659 aa  557  1e-157  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0180  methyl-accepting chemotaxis protein  48.15 
 
 		 659 aa  556  1e-157  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1735  methyl-accepting chemotaxis protein  49.93 
 
 		 651 aa  552  1e-156  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0140  methyl-accepting chemotaxis protein  55.58 
 
 		 540 aa  536  1e-151  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1698  methyl-accepting chemotaxis protein  40.92 
 
 		 653 aa  491  1e-137  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.130314  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0190  methyl-accepting chemotaxis protein  43.2 
 
 		 657 aa  461  9.999999999999999e-129  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.145639  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1305  methyl-accepting chemotaxis protein  41.93 
 
 		 652 aa  457  1e-127  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.049405  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1679  methyl-accepting chemotaxis protein  54.96 
 
 		 700 aa  452  1e-125  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1498  methyl-accepting chemotaxis protein  54.74 
 
 		 700 aa  452  1e-125  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.756421  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1307  methyl-accepting chemotaxis protein  43.24 
 
 		 596 aa  451  1e-125  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000917497  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1858  methyl-accepting chemotaxis protein  54 
 
 		 700 aa  448  1.0000000000000001e-124  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1041  methyl-accepting chemotaxis protein  49.35 
 
 		 731 aa  447  1.0000000000000001e-124  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.32701  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0869  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  38.77 
 
 		 649 aa  428  1e-118  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0395  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase (UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanine synthetase)  35.8 
 
 		 663 aa  402  9.999999999999999e-111  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0397  methyl-accepting chemotaxis protein  35.72 
 
 		 655 aa  381  1e-104  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1409  methyl-accepting chemotaxis protein  35.72 
 
 		 655 aa  381  1e-104  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1499  MCP-domain signal transduction protein  44.84 
 
 		 694 aa  371  1e-101  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1645  methyl-accepting chemotaxis protein  55.78 
 
 		 545 aa  359  9e-98  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0567442  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0185  methyl-accepting chemotaxis protein  55.78 
 
 		 544 aa  358  1.9999999999999998e-97  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000579859  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1549  methyl-accepting chemotaxis protein  77.12 
 
 		 236 aa  357  5e-97  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00107467  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1856  acyl-CoA hydrolase  34.38 
 
 		 654 aa  355  1e-96  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2196  methyl-accepting chemotaxis protein  36.77 
 
 		 604 aa  345  1e-93  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1957  methyl-accepting chemotaxis protein  35.67 
 
 		 654 aa  311  2.9999999999999997e-83  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1471  DNA processing chain A  49.57 
 
 		 651 aa  307  3e-82  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1394  putative 6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase (ptps; ptp synthase)  45.43 
 
 		 656 aa  301  2e-80  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0269  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.26 
 
 		 663 aa  240  5e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0375988  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1227  methyl-accepting chemotaxis protein  42.57 
 
 		 553 aa  231  4e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1930  chemotaxis sensory transducer  29.54 
 
 		 625 aa  190  5.999999999999999e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0173  methyl-accepting chemotaxis protein  25.28 
 
 		 639 aa  172  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0819  chemotaxis sensory transducer  28.92 
 
 		 627 aa  171  5e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.113637  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1931  chemotaxis sensory transducer  27.77 
 
 		 621 aa  170  8e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.75 
 
 		 698 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000832175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3449  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.38 
 
 		 632 aa  150  6e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0988  methyl-accepting chemotaxis protein  25.96 
 
 		 695 aa  145  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4874  chemotactic transducer PctC  25.93 
 
 		 632 aa  144  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.153332  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55960  chemotactic transducer PctC  25.76 
 
 		 632 aa  144  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.289325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.92 
 
 		 636 aa  144  6e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00353653  normal  0.775857 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4876  chemotactic transducer PctA  25.08 
 
 		 629 aa  144  7e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.647167  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.53 
 
 		 631 aa  141  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06314  histidine kinase  26.41 
 
 		 623 aa  141  3.9999999999999997e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.12 
 
 		 627 aa  140  7e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0789614  normal  0.507372 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3477  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  22.52 
 
 		 606 aa  140  7.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56000  chemotactic transducer PctA  25.04 
 
 		 629 aa  140  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0512673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4113  methyl-accepting chemotaxis protein  27.79 
 
 		 778 aa  140  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.433818  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3309  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.41 
 
 		 625 aa  139  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4877  chemotactic transducer PctB  25.46 
 
 		 629 aa  139  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164155  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.82 
 
 		 647 aa  139  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0365  accessory colonization factor AcfB  28.04 
 
 		 626 aa  137  5e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4029  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.36 
 
 		 630 aa  137  6.0000000000000005e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0793  methyl-accepting chemotaxis protein  28.98 
 
 		 740 aa  137  6.0000000000000005e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001423  methyl-accepting chemotaxis protein  26.66 
 
 		 623 aa  137  7.000000000000001e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.896179  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0799  methyl-accepting chemotaxis protein  25.98 
 
 		 624 aa  136  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3501  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.83 
 
 		 600 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.112529 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00119  methyl-accepting chemotaxis protein  26.97 
 
 		 626 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1205  chemotaxis sensory transducer  24.23 
 
 		 713 aa  136  1.9999999999999998e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22560  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.94 
 
 		 659 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3176  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.47 
 
 		 600 aa  134  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0503971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0943  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  28.67 
 
 		 793 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.27721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.89 
 
 		 695 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.541026 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.5 
 
 		 372 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.409493  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3030  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.28 
 
 		 832 aa  132  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00284544  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  23.2 
 
 		 658 aa  131  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1201  methyl-accepting chemotaxis protein  24.22 
 
 		 728 aa  131  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2364  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.18 
 
 		 622 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.493821  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0582  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.13 
 
 		 610 aa  130  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4431  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  25.8 
 
 		 629 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0564  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.78 
 
 		 660 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0020921  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0550  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.78 
 
 		 660 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000171017  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2544  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.49 
 
 		 633 aa  128  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00517521  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1273  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.04 
 
 		 609 aa  128  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.258977  normal  0.0501221 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1247  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.57 
 
 		 609 aa  128  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2528  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.86 
 
 		 665 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2141  chemotaxis sensory transducer  48.3 
 
 		 708 aa  127  5e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2121  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.54 
 
 		 622 aa  126  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4783  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.28 
 
 		 730 aa  126  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2967  methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  26.22 
 
 		 695 aa  125  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000011738  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1159  methyl-accepting chemotaxis protein  28.15 
 
 		 671 aa  125  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.573311  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0377  Nitrate and nitrite sensing domain protein  45.51 
 
 		 661 aa  125  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000413313  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1726  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.68 
 
 		 702 aa  125  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.333472  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0918  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  23.34 
 
 		 657 aa  125  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1200  methyl-accepting chemotaxis protein  24.14 
 
 		 728 aa  125  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5166  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.23 
 
 		 669 aa  125  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3105  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.34 
 
 		 767 aa  124  7e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1204  MCP-domain signal transduction protein  47.53 
 
 		 431 aa  123  9.999999999999999e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.302368  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0209  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.76 
 
 		 658 aa  123  9.999999999999999e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.603066  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.19 
 
 		 660 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1073  chemotaxis sensory transducer  46.45 
 
 		 633 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00919731  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0523  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  24.18 
 
 		 608 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0613  methyl-accepting chemotaxis protein  26.56 
 
 		 660 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  23.75 
 
 		 785 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1826  chemotaxis sensory transducer  46.21 
 
 		 650 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>