286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1746 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1746  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  100 
 
 
190 aa  385  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0688  condensin subunit ScpB  57.14 
 
 
198 aa  223  1e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2059  segregation and condensation protein B  47.49 
 
 
195 aa  165  4e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.830333  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1773  segregation and condensation protein B  46.93 
 
 
195 aa  164  8e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2583  segregation and condensation protein B  44.31 
 
 
189 aa  163  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000922249  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1567  putative transcriptional regulator  46.63 
 
 
168 aa  151  5e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0426273  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.21 
 
 
192 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.76 
 
 
196 aa  142  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  41.21 
 
 
183 aa  142  4e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2296  segregation and condensation protein B  39.56 
 
 
192 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  43.83 
 
 
282 aa  139  3e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2232  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  43.48 
 
 
196 aa  138  6e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0160182  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1831  hypothetical protein  40.88 
 
 
195 aa  136  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1417  putative transcriptional regulator  42.69 
 
 
171 aa  135  4e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1135  putative transcriptional regulator  42.77 
 
 
181 aa  134  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1328  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.65 
 
 
269 aa  134  7.000000000000001e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.287533 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  35.94 
 
 
195 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4188  segregation and condensation protein B  41.62 
 
 
190 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0691194  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4166  segregation and condensation protein B  42.2 
 
 
190 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.178731  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0794  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40 
 
 
179 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4124  segregation and condensation protein B  41.62 
 
 
190 aa  131  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3967  segregation and condensation protein B  41.62 
 
 
190 aa  131  5e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3798  segregation and condensation protein B  41.62 
 
 
190 aa  131  5e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4077  segregation and condensation protein B  41.62 
 
 
190 aa  131  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000355758 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4276  segregation and condensation protein B  41.62 
 
 
190 aa  131  5e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0392  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.57 
 
 
273 aa  131  6e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1072  segregation and condensation protein B  41.62 
 
 
190 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3813  segregation and condensation protein B  41.62 
 
 
190 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1735  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.13 
 
 
187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  39.24 
 
 
243 aa  130  1.0000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0887  transcriptional regulator  40.48 
 
 
199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000169803 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0874  transcriptional regulator, putative  39.38 
 
 
171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000406554  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2756  segregation and condensation protein B  38.73 
 
 
190 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  38.65 
 
 
195 aa  128  4.0000000000000003e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3848  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.49 
 
 
189 aa  128  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000524559  decreased coverage  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1690  putative transcriptional regulator  39.25 
 
 
206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06810  segregation and condensation protein B  35.98 
 
 
284 aa  122  3e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3886  segregation and condensation protein B  40.8 
 
 
190 aa  122  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1958  condensin subunit ScpB  39.13 
 
 
195 aa  121  7e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0110905  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1024  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  36.84 
 
 
176 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2248  putative transcriptional regulator  38.2 
 
 
189 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540611  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0822  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  34.97 
 
 
193 aa  117  9e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1297  condensin subunit ScpB  38.82 
 
 
199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.784926  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0722  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  35.98 
 
 
225 aa  116  1.9999999999999998e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00466687  normal  0.0828355 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07180  putative transcriptional regulator  35.96 
 
 
179 aa  115  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000744296  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3787  segregation and condensation protein B  38.12 
 
 
274 aa  115  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.452854  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  33.16 
 
 
299 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1300  hypothetical protein  40.12 
 
 
200 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0541  putative transcriptional regulator  35.5 
 
 
224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  37.04 
 
 
387 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1594  segregation and condensation protein B  41.4 
 
 
194 aa  112  3e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1492  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  33.95 
 
 
252 aa  112  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54804  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  36.42 
 
 
372 aa  111  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0142  condensin subunit ScpB  38.27 
 
 
237 aa  110  8.000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1005  condensin subunit ScpB  37.36 
 
 
196 aa  111  8.000000000000001e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  36.42 
 
 
387 aa  110  9e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  37.04 
 
 
352 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  32.78 
 
 
222 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0954  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 
185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0440  segregation and condensation protein B  36.72 
 
 
206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000447089  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0493  condensin subunit ScpB  38.12 
 
 
202 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  36.53 
 
 
201 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4453  segregation and condensation protein B  40.27 
 
 
187 aa  108  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0472424  hitchhiker  0.0000000971246 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1689  putative transcriptional regulator  35.5 
 
 
213 aa  108  5e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1161  putative transcriptional regulator  37.42 
 
 
221 aa  108  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3862  condensin subunit ScpB  39.39 
 
 
353 aa  108  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.857603  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1998  segregation and condensation protein B  33.89 
 
 
221 aa  107  7.000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  34.09 
 
 
197 aa  107  8.000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1721  condensin subunit ScpB  35.68 
 
 
352 aa  107  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.862733  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf011  segregation and condensation protein B  37.11 
 
 
206 aa  107  1e-22  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0308  segregation and condensation protein B  37.13 
 
 
193 aa  107  1e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1582  segregation and condensation protein B  37.8 
 
 
180 aa  106  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0756  condensin subunit ScpB  35.23 
 
 
201 aa  106  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000117141  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4629  putative transcriptional regulator  37.91 
 
 
184 aa  106  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00667306  hitchhiker  0.00065048 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpB  34.25 
 
 
206 aa  106  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1551  putative transcriptional regulator  37.8 
 
 
180 aa  106  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1237  condensin subunit ScpB  32.07 
 
 
205 aa  106  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.818774 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5426  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  34.59 
 
 
193 aa  105  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3496  putative transcriptional regulator  32.39 
 
 
243 aa  105  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.147487  normal  0.212482 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.41 
 
 
534 aa  105  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2190  segregation and condensation protein B  35.62 
 
 
212 aa  104  8e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15200  condensin subunit ScpB  35.67 
 
 
253 aa  104  8e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0138487  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1415  putative transcriptional regulator  33.14 
 
 
255 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.694698  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3746  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  34.15 
 
 
237 aa  103  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491484  decreased coverage  0.00429579 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2012  segregation and condensation protein B  32.78 
 
 
236 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0659243  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0722  condensin subunit ScpB  34.44 
 
 
194 aa  103  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4003  segregation and condensation protein B  33.33 
 
 
256 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.577747  decreased coverage  0.000000530322 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0239  putative transcriptional regulator  36.31 
 
 
238 aa  102  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.475258  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3021  segregation and condensation protein B  37.88 
 
 
318 aa  102  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.506353  normal  0.90269 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0582  putative transcriptional regulator  36.26 
 
 
210 aa  103  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.571381  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3786  segregation and condensation protein B  33.14 
 
 
259 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000435187 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1733  segregation and condensation protein B  35.67 
 
 
360 aa  102  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1759  segregation and condensation protein B  34.5 
 
 
349 aa  102  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.450892  normal  0.0114777 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1595  hypothetical protein  34.81 
 
 
193 aa  102  4e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0850  condensin subunit ScpB  32.93 
 
 
287 aa  102  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0321676  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1918  segregation and condensation protein B  31.64 
 
 
191 aa  102  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001088 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1467  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.61 
 
 
165 aa  102  4e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3014  hypothetical protein  34.88 
 
 
198 aa  102  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1927  segregation and condensation protein B  31.64 
 
 
282 aa  101  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121193  normal  0.224163 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1397  segregation and condensation protein B  33.75 
 
 
188 aa  102  5e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.186018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>