151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0958 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0958  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 133 aa  268  1e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2790  transcriptional regulator, XRE family  85.71 
 
 		 133 aa  235  1e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000203467  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  46.15 
 
 		 321 aa  67  0.00000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  46.38 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 231 aa  63.9  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3095  XRE family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2431  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  40.62 
 
 		 301 aa  57.4  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 137 aa  57  0.00000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  37.35 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1254  transcriptional regulator, XRE family  38.27 
 
 		 364 aa  56.2  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2791  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3317  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 281 aa  54.7  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000786405  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 152 aa  53.5  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119777  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0510  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 114 aa  53.5  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000759518  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  26.67 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1249  Cro/CI family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 74 aa  52.4  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 145 aa  52  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2878  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 322 aa  52  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00252317  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1604  DNA-binding protein  38.46 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00115974  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0916  XRE family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 115 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0801  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 111 aa  51.6  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000260527  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3465  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 142 aa  51.6  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0468  transcriptional regulator, XRE family  34.33 
 
 		 82 aa  51.6  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000157698  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1673  ABC transporter related  43.08 
 
 		 293 aa  51.6  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000539653  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0495  XRE family transcriptional regulator  44 
 
 		 100 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400235  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1576  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 75 aa  50.8  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  39.66 
 
 		 459 aa  50.8  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1565  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 75 aa  50.8  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1587  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 75 aa  50.8  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2209  putative DNA-binding protein  37.1 
 
 		 117 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.706329  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  40.98 
 
 		 328 aa  50.8  0.000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2431  transcriptional regulator, XRE family  36 
 
 		 125 aa  50.4  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000620136 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1067  transcriptional regulator, XRE family  32.93 
 
 		 82 aa  50.4  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0145003  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2624  XRE family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00551798  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2433  transcriptional regulator, XRE family  28.33 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000213647 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 		 118 aa  48.9  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2146  transcriptional regulator, XRE family  31.94 
 
 		 206 aa  48.5  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0483341  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1967  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 268 aa  47.8  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000016802  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  38.33 
 
 		 142 aa  47  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2113  transcriptional regulator, putative  33.82 
 
 		 143 aa  46.2  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  40.35 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0281  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0335018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1391  hypothetical protein  41.67 
 
 		 342 aa  46.6  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2111  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 380 aa  46.6  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4720  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 327 aa  46.6  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  30.38 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2814  transcriptional regulator, XRE family  33.8 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  30.38 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  30.26 
 
 		 200 aa  46.2  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  28.57 
 
 		 209 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1223  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30 
 
 		 197 aa  46.2  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.995499 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0513  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.041665  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0697  transcriptional regulator, XRE family  36.23 
 
 		 151 aa  45.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2730  putative DNA-binding protein  32.26 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000010572  hitchhiker  0.0000267972 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3466  transcriptional regulator, XRE family  30.43 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2256  transcriptional regulator, XRE family  30.61 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0234  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 334 aa  44.7  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00407493  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  30 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2429  transcriptional regulator, XRE family  34.85 
 
 		 127 aa  45.1  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159098 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10021  Repressor protein C2  32.39 
 
 		 216 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1882  prophage LambdaSa2, repressor protein, putative  36.76 
 
 		 120 aa  44.3  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.124676  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2391  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 247 aa  44.3  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0099  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  34.92 
 
 		 296 aa  44.3  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0398  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 244 aa  44.3  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0289  P22 repressor protein c2  32.39 
 
 		 216 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 205 aa  44.3  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3833  prophage LambdaBa02, repressor protein  25.23 
 
 		 114 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4130  prophage lambdaba02, repressor protein  25.23 
 
 		 114 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.05101  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1543  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 359 aa  44.3  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0008  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000363546  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6747  XRE family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 115 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19180  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 		 141 aa  43.9  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.433834  normal  0.0717748 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 374 aa  43.9  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  34.43 
 
 		 149 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  32.79 
 
 		 92 aa  43.5  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2015  Cro/CI family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00850971  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  32.79 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  32.79 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2792  XRE family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7699  putative transcriptional regulator  36.07 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.829097  normal  0.153836 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0070  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6153  protein of unknown function DUF955  25.93 
 
 		 359 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0450  transcriptional regulator, XRE family  33.78 
 
 		 268 aa  43.1  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  33.82 
 
 		 200 aa  43.5  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000578065  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  26.6 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  35 
 
 		 262 aa  42.7  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  32.79 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5234  DNA-binding protein  36.84 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302998 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  32.79 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  35 
 
 		 262 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0471  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  26.56 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>