190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1805 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1805  aldose 1-epimerase  100 
 
 
385 aa  777    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.122387 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1153  Aldose 1-epimerase  45.92 
 
 
402 aa  340  2e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5369  aldose 1-epimerase  47.18 
 
 
387 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6480  aldose 1-epimerase  45.99 
 
 
390 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0142424  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1457  aldose 1-epimerase  46.37 
 
 
387 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.808924  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6371  aldose 1-epimerase  46.37 
 
 
387 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5727  aldose 1-epimerase  46.26 
 
 
390 aa  325  7e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306981  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  44.62 
 
 
383 aa  324  2e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  43.57 
 
 
397 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3731  aldose 1-epimerase  42.59 
 
 
382 aa  318  1e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.90424 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7038  aldose 1-epimerase  45.6 
 
 
387 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.754242  normal  0.230743 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  47.98 
 
 
346 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1039  Aldose 1-epimerase  47.55 
 
 
357 aa  312  4.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2311  aldose 1-epimerase  47.23 
 
 
355 aa  311  1e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0621  Aldose 1-epimerase  47.83 
 
 
388 aa  310  2.9999999999999997e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.295352  normal  0.0428145 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2873  aldose 1-epimerase  47.4 
 
 
346 aa  309  4e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2636  aldose 1-epimerase  41.1 
 
 
382 aa  305  6e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151396  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2369  aldose 1-epimerase  41.62 
 
 
382 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0104312  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2993  Aldose 1-epimerase  47.41 
 
 
346 aa  300  2e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  46.22 
 
 
414 aa  299  6e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  42.9 
 
 
387 aa  298  1e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1386  aldose 1-epimerase  43.42 
 
 
384 aa  298  1e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  43.47 
 
 
387 aa  295  7e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4114  aldose 1-epimerase  46.53 
 
 
346 aa  293  4e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3008  Aldose 1-epimerase  43.35 
 
 
434 aa  292  6e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3618  aldose 1-epimerase  41.38 
 
 
384 aa  291  1e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  41.11 
 
 
397 aa  289  5.0000000000000004e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0321  aldose 1-epimerase  39.89 
 
 
375 aa  289  7e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.520613 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  41.01 
 
 
392 aa  288  1e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3154  aldose 1-epimerase  44.97 
 
 
350 aa  286  5e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  42.58 
 
 
356 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  42.58 
 
 
356 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  40.74 
 
 
347 aa  281  1e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  40.32 
 
 
380 aa  276  5e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3011  Aldose 1-epimerase  41.83 
 
 
400 aa  275  1.0000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415447  hitchhiker  0.00870507 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  46.04 
 
 
317 aa  274  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1033  aldose 1-epimerase  46.74 
 
 
341 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  38.23 
 
 
356 aa  273  4.0000000000000004e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1611  aldose 1-epimerase  40.64 
 
 
438 aa  272  8.000000000000001e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0628258  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0489  Aldose 1-epimerase  39.66 
 
 
393 aa  272  8.000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1632  aldose 1-epimerase  40.74 
 
 
355 aa  271  2e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1187  aldose 1-epimerase  39.19 
 
 
354 aa  267  2.9999999999999995e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4369  Aldose 1-epimerase  41.37 
 
 
372 aa  266  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449933  normal  0.0127022 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3640  Aldose 1-epimerase  41.38 
 
 
356 aa  261  2e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0788  aldose 1-epimerase  39.89 
 
 
357 aa  259  6e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000118587  normal  0.618331 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2798  aldose 1-epimerase  42.81 
 
 
321 aa  259  8e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  40.68 
 
 
355 aa  258  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2727  Aldose 1-epimerase  39.06 
 
 
390 aa  257  2e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  41.43 
 
 
361 aa  256  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0282  Aldose 1-epimerase  45.11 
 
 
357 aa  257  3e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22783  normal  0.0158756 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3076  aldose 1-epimerase  40.23 
 
 
362 aa  252  8.000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.313504 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1431  Aldose 1-epimerase  36.1 
 
 
354 aa  249  5e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1147  aldose 1-epimerase  41.55 
 
 
368 aa  249  8e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.934595  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2682  aldose 1-epimerase  38.62 
 
 
406 aa  248  1e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1758  aldose 1-epimerase  39.38 
 
 
372 aa  247  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00365517  normal  0.11441 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2713  Aldose 1-epimerase  38.87 
 
 
348 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0738  aldose 1-epimerase  37.36 
 
 
359 aa  229  4e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.547855 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2026  aldose 1-epimerase  34.21 
 
 
392 aa  229  5e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.564676  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2135  galactose mutarotase  38.53 
 
 
359 aa  225  8e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2723  Aldose 1-epimerase  37.94 
 
 
350 aa  225  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0556  aldose 1-epimerase  33.62 
 
 
353 aa  223  4e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000526339  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0819  aldose 1-epimerase  36.49 
 
 
351 aa  220  3e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3534  aldose 1-epimerase  36.19 
 
 
360 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  38.98 
 
 
362 aa  213  7e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  38.98 
 
 
362 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  38.98 
 
 
362 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  35.62 
 
 
360 aa  209  5e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  35.62 
 
 
360 aa  209  5e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  38.9 
 
 
362 aa  209  5e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  37.11 
 
 
376 aa  209  7e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  38.33 
 
 
362 aa  209  8e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02261  aldose 1-epimerase  35.06 
 
 
346 aa  207  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1247  aldose 1-epimerase  35.09 
 
 
346 aa  206  7e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.942743  normal  0.442353 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03326  aldose 1-epimerase  35.59 
 
 
352 aa  205  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2886  galactose mutarotase  35.99 
 
 
346 aa  204  3e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1344  aldose 1-epimerase  32.24 
 
 
343 aa  204  3e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0779  aldose 1-epimerase  35.99 
 
 
346 aa  204  3e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.184805  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0783  aldose 1-epimerase  35.99 
 
 
346 aa  204  3e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.328342  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2906  aldose 1-epimerase  35.99 
 
 
346 aa  204  3e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.336239 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0677  aldose 1-epimerase  35.99 
 
 
346 aa  204  3e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.569185  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0810  aldose 1-epimerase  35.99 
 
 
346 aa  204  3e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  36.26 
 
 
362 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0859  aldose 1-epimerase  35.69 
 
 
346 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0241581  normal  0.840205 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2212  aldose 1-epimerase  33.43 
 
 
347 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.939522  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0868  aldose 1-epimerase  35.4 
 
 
346 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.558575  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0837  aldose 1-epimerase  35.4 
 
 
346 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0923  aldose 1-epimerase  35.4 
 
 
346 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.285804 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00230  aldose 1-epimerase  33.83 
 
 
340 aa  200  3e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0809  aldose 1-epimerase  35.4 
 
 
346 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3100  aldose 1-epimerase  36.89 
 
 
377 aa  199  6e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2018  galactose mutarotase  33.53 
 
 
357 aa  199  6e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.237722  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0900  aldose 1-epimerase  35.1 
 
 
346 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3070  aldose 1-epimerase  33.72 
 
 
348 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2344  aldose 1-epimerase  35.92 
 
 
363 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.145267 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002663  aldose 1-epimerase  36.66 
 
 
354 aa  196  7e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1290  galactose mutarotase  33.14 
 
 
347 aa  194  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.994264  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1196  aldose 1-epimerase  34.97 
 
 
350 aa  194  3e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1357  aldose 1-epimerase  32.57 
 
 
351 aa  193  5e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1115  aldose 1-epimerase  30.45 
 
 
351 aa  192  6e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1264  aldose 1-epimerase  33.43 
 
 
348 aa  192  7e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>