262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3267 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_3267  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 207 aa  425  1e-118  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1206  MarR family transcriptional regulator  59.9 
 
 		 206 aa  237  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1762  transcriptional regulator, MarR family  38.95 
 
 		 196 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2862  transcriptional regulator, MarR family  36.46 
 
 		 208 aa  109  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2109  MarR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 145 aa  107  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4421  transcriptional regulator, MarR family  35.87 
 
 		 197 aa  89.4  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.636596  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3929  transcriptional regulator, MarR family  30.11 
 
 		 212 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000837661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0003  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0838682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5106  transcriptional regulator, MarR family  27.5 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248862  normal  0.417373 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0070  MarR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0658  MarR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 191 aa  70.9  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3063  MarR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.565179  normal  0.590776 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2985  MarR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0529502  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0088  MarR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.519459 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0070  MarR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0210  MarR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 224 aa  68.2  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.133838 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3251  MarR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.281041 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0213  MarR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 270 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3344  MarR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 270 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0069  MarR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.373152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0061  MarR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4084  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.574763  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4012  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.911422  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0565  MarR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1858  MarR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.642234  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2918  MarR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2977  MarR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3392  MarR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1624  MarR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1648  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 		 177 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0613  transcriptional regulator of MarR family protein  34.56 
 
 		 142 aa  57.4  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.137964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4139  MarR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  31.11 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2690  MarR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0504  transcriptional regulator, TrmB  32.47 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.21026 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 164 aa  54.3  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4212  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 191 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0228  MarR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 192 aa  52.8  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.209959 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 172 aa  52  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0550  MarR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 167 aa  50.8  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 176 aa  50.8  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  34.17 
 
 		 153 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7500  hypothetical protein  30.94 
 
 		 190 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 181 aa  50.4  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 165 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1943  transcriptional regulator, MarR family protein  33.33 
 
 		 161 aa  50.4  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0012648  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 165 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 148 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1245  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 158 aa  50.4  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  31.11 
 
 		 171 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7490  hypothetical protein  30.94 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0307768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  35.77 
 
 		 172 aa  50.1  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1318  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 158 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1354  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 158 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  30.77 
 
 		 174 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 158 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52070  transcriptional regulator  27.96 
 
 		 186 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0119857 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3032  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 		 158 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0797104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1328  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 158 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 166 aa  49.3  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 165 aa  49.3  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4564  Transcriptional regulators-like protein  31.78 
 
 		 261 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  0.0271107 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 162 aa  48.9  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4152  transcriptional regulator, MarR family  36.45 
 
 		 135 aa  48.9  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 200 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1004  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 		 157 aa  48.9  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.324282  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 161 aa  48.5  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 219 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3042  MarR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 174 aa  48.5  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125227  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0846  regulatory protein, MarR  34.07 
 
 		 185 aa  48.5  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1037  transcriptional regulator, MarR family  38.78 
 
 		 174 aa  48.1  0.00008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 141 aa  48.1  0.00008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  26.97 
 
 		 166 aa  48.1  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 162 aa  48.5  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 162 aa  48.5  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4170  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 147 aa  48.1  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01882  hypothetical protein  30.3 
 
 		 158 aa  48.1  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 148 aa  47.8  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  28.29 
 
 		 168 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  32.93 
 
 		 148 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003137  transcriptional regulator MarR family  28.97 
 
 		 167 aa  48.1  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0057882  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 163 aa  47.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1577  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 170 aa  47.8  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0137513 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 162 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 162 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  32.87 
 
 		 147 aa  47.4  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 162 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  32.93 
 
 		 148 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2077  transcriptional regulator of MarR family protein  32.38 
 
 		 161 aa  47.8  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.323621  normal  0.679444 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 148 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 148 aa  47  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 148 aa  47  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  32.93 
 
 		 148 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 148 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0718  regulatory protein, MarR  34.69 
 
 		 160 aa  47.4  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000013596  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0954  transcriptional regulator  26.67 
 
 		 150 aa  47  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0108393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 148 aa  47.4  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1921  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6482  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 172 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618469  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0803  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 177 aa  47.4  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>