162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2822 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2822  phage shock protein C, PspC  100 
 
 
97 aa  189  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  52.94 
 
 
92 aa  80.9  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0912  phage shock protein C, PspC  55.13 
 
 
85 aa  78.2  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3205  phage shock protein C, PspC  41.94 
 
 
96 aa  78.2  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.236376 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1926  phage shock protein C, PspC  50 
 
 
174 aa  77.8  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000470088  unclonable  0.00000000972351 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3932  phage shock protein C, PspC  40.86 
 
 
96 aa  77.4  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.923929  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0522  phage shock protein C, PspC  50.72 
 
 
164 aa  72  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.854498  normal  0.422706 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0579  hypothetical protein  50 
 
 
240 aa  71.6  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.702691  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3130  phage shock protein C, PspC  48.75 
 
 
177 aa  71.6  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2935  phage shock protein C, PspC  46.48 
 
 
71 aa  68.6  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000394883  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  41.46 
 
 
95 aa  68.2  0.00000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2350  phage shock protein C, PspC  58.18 
 
 
194 aa  67.4  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1275  phage shock protein C, PspC  46.67 
 
 
169 aa  67.4  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0715782  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  40.74 
 
 
82 aa  67  0.00000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4670  phage shock protein C, PspC  36.17 
 
 
143 aa  66.2  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4996  phage shock protein C, PspC  42.11 
 
 
98 aa  66.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2455  phage shock protein C, PspC  58 
 
 
81 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.129612  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01250  putative stress-responsive transcriptional regulator  39.58 
 
 
256 aa  64.7  0.0000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2413  phage shock protein C, PspC  47.69 
 
 
67 aa  63.2  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.249375  normal  0.561911 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3366  phage shock protein C  46.38 
 
 
127 aa  62.4  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4820  phage shock protein C, PspC  50 
 
 
66 aa  62  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4222  phage shock protein C, PspC  45.9 
 
 
103 aa  62  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155341  normal  0.0141639 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4462  phage shock protein C, PspC  42.86 
 
 
86 aa  62  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1660  phage shock protein C, PspC  50 
 
 
127 aa  61.6  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3608  PspC domain-containing protein  47.76 
 
 
419 aa  60.5  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2855  putative stress-responsive transcriptional regulator  37.88 
 
 
86 aa  59.3  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5232  putative signal transduction histidine kinase  45.9 
 
 
400 aa  58.9  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0452492  hitchhiker  0.00276259 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2047  putative stress-responsive transcriptional regulator  43.55 
 
 
87 aa  58.9  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2555  phage shock protein C, PspC  49.18 
 
 
67 aa  58.9  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  46.97 
 
 
394 aa  58.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1227  hypothetical protein  47.62 
 
 
555 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.010904 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0450  phage shock protein C, PspC  41.27 
 
 
84 aa  57.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1594  phage shock protein C, PspC  46.43 
 
 
127 aa  57.8  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9060  Putative stress-responsive transcriptional regulator protein-like protein  44.83 
 
 
178 aa  57.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1110  phage shock protein C, PspC  50 
 
 
190 aa  57.8  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000317198  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4864  phage shock protein C, PspC  50.85 
 
 
184 aa  57.8  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0646459  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1024  phage shock protein C, PspC  45.45 
 
 
233 aa  57  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1339  phage shock protein C, PspC  42.62 
 
 
62 aa  57  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304001  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0132  phage shock protein C, PspC  49.18 
 
 
82 aa  56.6  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0723813  normal  0.142504 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1648  phage shock protein C, PspC  44.23 
 
 
416 aa  56.6  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.530019  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4438  putative signal transduction histidine kinase  48.28 
 
 
394 aa  56.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0248  phage shock protein C, PspC  43.66 
 
 
346 aa  55.8  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17350  signal transduction histidine kinase  40.74 
 
 
419 aa  55.5  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6527  phage shock protein C, PspC  47.27 
 
 
417 aa  55.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.627165  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04810  signal transduction histidine kinase  44.62 
 
 
481 aa  55.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4439  phage shock protein C, PspC  48.53 
 
 
306 aa  55.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124889  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  44.83 
 
 
847 aa  55.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04800  putative stress-responsive transcriptional regulator  32.97 
 
 
418 aa  55.1  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.975328  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2312  phage shock protein C, PspC  41.38 
 
 
76 aa  55.1  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0621  phage shock protein C, PspC  44.64 
 
 
86 aa  54.7  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1297  phage shock protein C, PspC  44.64 
 
 
86 aa  54.7  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.184221  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2157  phage shock protein C, PspC  43.1 
 
 
138 aa  54.7  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0475  stress-responsive transcriptional regulator  37.29 
 
 
61 aa  54.3  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2843  phage shock protein C, PspC  41.18 
 
 
68 aa  53.9  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000296758  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1775  putative stress-responsive transcriptional regulator, PspC  39.34 
 
 
70 aa  53.1  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.218822  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2420  phage shock protein C, PspC  40 
 
 
65 aa  52.8  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3236  PspC domain protein  44.83 
 
 
129 aa  53.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3000  phage shock protein C, PspC  40.32 
 
 
547 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0072  phage shock protein C, PspC  43.33 
 
 
161 aa  53.1  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0202  phage shock protein C, PspC  47.92 
 
 
86 aa  53.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.183382  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2712  phage shock protein C, PspC  42.31 
 
 
512 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0047  phage shock protein C, PspC  45.76 
 
 
59 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0367  phage shock protein C  44.07 
 
 
70 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0196  phage shock protein C, PspC  43.06 
 
 
578 aa  52.4  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.695474  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3401  phage shock protein C, PspC  44.07 
 
 
62 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0719508  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5231  phage shock protein C, PspC  34.85 
 
 
474 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118703  hitchhiker  0.0028531 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1233  phage shock protein C, PspC  26.04 
 
 
152 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.233266  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0280  hypothetical protein  45.9 
 
 
491 aa  51.6  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274206  normal  0.0175316 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0849  phage shock protein C, PspC  51.11 
 
 
147 aa  51.2  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4612  hypothetical protein  37.29 
 
 
61 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0623  hypothetical protein  37.29 
 
 
61 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.592118  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1319  phage shock protein C, PspC  29.35 
 
 
165 aa  51.2  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4630  hypothetical protein  36.67 
 
 
61 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4632  hypothetical protein  36.67 
 
 
61 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3459  PspC domain protein  36.51 
 
 
244 aa  50.8  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0585  phage shock protein C, PspC  42.19 
 
 
77 aa  50.4  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00837163  hitchhiker  0.00408687 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3719  phage shock protein C, PspC  43.64 
 
 
110 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.0072784  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3661  phage shock protein C, PspC  43.64 
 
 
110 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3802  phage shock protein C, PspC  43.64 
 
 
110 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3826  PspC domain-containing protein  32.93 
 
 
445 aa  50.4  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4399  hypothetical protein  37.29 
 
 
61 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4239  stress-responsive transcriptional regulator PspC  37.29 
 
 
61 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4251  stress-responsive transcriptional regulator  37.29 
 
 
61 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4739  hypothetical protein  37.29 
 
 
61 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1634  phage shock protein C, PspC  36.59 
 
 
83 aa  49.7  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000119138  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3035  phage shock protein C, PspC  44.83 
 
 
497 aa  49.7  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177773  hitchhiker  0.0028338 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0952  phage shock protein C, PspC  43.1 
 
 
170 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441408  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5725  putative signal transduction histidine kinase  40 
 
 
398 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4332  phage shock protein C, PspC  36.67 
 
 
61 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1253  phage shock protein C, PspC  46.67 
 
 
464 aa  49.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.21534  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2032  phage shock protein C, PspC  43.33 
 
 
61 aa  49.7  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  0.0853583 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0542  phage shock protein C, PspC  43.33 
 
 
124 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1000  phage shock protein C, PspC  33.87 
 
 
64 aa  50.1  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.290499 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4616  hypothetical protein  37.29 
 
 
61 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1735  PspC domain protein  40 
 
 
445 aa  48.9  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3318  phage shock protein C, PspC  39.34 
 
 
64 aa  48.9  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3790  phage shock protein C, PspC  41.27 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.454801 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4216  phage shock protein C, PspC  34.25 
 
 
511 aa  49.3  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.041872  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1770  putative stress-responsive transcriptional regulator  42.11 
 
 
427 aa  49.3  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3231  phage shock protein C, PspC  38.98 
 
 
68 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0365793  hitchhiker  0.00000725831 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>