286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2367 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_2367  nuclease SbcCD, D subunit  100 
 
 		 408 aa  815    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0953909  normal  0.605774 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1304  nuclease SbcCD, D subunit  59.49 
 
 		 418 aa  452  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.611964  normal  0.601138 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2193  nuclease SbcCD, D subunit  58.72 
 
 		 417 aa  454  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0979065  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3452  nuclease SbcCD, D subunit  50.98 
 
 		 414 aa  415  9.999999999999999e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.527539  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3309  nuclease subunit SbcD  38.74 
 
 		 412 aa  291  1e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0660  nuclease SbcCD, D subunit  38.35 
 
 		 428 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.783127 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3331  exonuclease SbcD  38.59 
 
 		 412 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.102024 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0714  nuclease SbcCD, D subunit  39.31 
 
 		 415 aa  279  7e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0788  nuclease SbcCD, D subunit  37.84 
 
 		 415 aa  276  6e-73  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_694  DNA repair exonuclease  36.7 
 
 		 415 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1475  nuclease SbcCD, D subunit  39.12 
 
 		 442 aa  273  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0190739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2903  nuclease SbcCD, D subunit  36.92 
 
 		 427 aa  271  2e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0109667 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2129  nuclease SbcCD, D subunit  35.37 
 
 		 428 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.64706 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2085  nuclease SbcCD, D subunit  34.88 
 
 		 428 aa  259  9e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0273  nuclease SbcCD, D subunit  40.6 
 
 		 412 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1141  nuclease SbcCD, D subunit  35.93 
 
 		 420 aa  196  6e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0824  nuclease SbcCD, D subunit  30.77 
 
 		 395 aa  110  6e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  30.6 
 
 		 379 aa  97.4  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1156  nuclease SbcCD, D subunit  28.28 
 
 		 382 aa  96.3  8e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1299  nuclease SbcCD, D subunit  28.28 
 
 		 382 aa  95.1  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.894732  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1090  nuclease SbcCD, D subunit  26.2 
 
 		 380 aa  94  4e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4367  metallophosphoesterase  30.32 
 
 		 428 aa  92.8  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544577  normal  0.383536 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1881  nuclease SbcCD, D subunit  26.8 
 
 		 386 aa  91.7  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.459868 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1914  nuclease SbcCD, D subunit  27.49 
 
 		 390 aa  90.9  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0281047  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3776  nuclease SbcCD, D subunit  29.02 
 
 		 387 aa  90.5  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0285977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4030  nuclease SbcCD, D subunit  26.73 
 
 		 387 aa  88.6  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.755126 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1252  DNA repair protein RAD32-like  28.34 
 
 		 425 aa  87.4  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00368978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0434  exonuclease subunit SbcD  28.18 
 
 		 400 aa  86.3  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.60373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0452  exonuclease subunit SbcD  28.18 
 
 		 400 aa  85.9  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0439  exonuclease subunit SbcD  27.84 
 
 		 400 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.196846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0433  exonuclease subunit SbcD  27.84 
 
 		 400 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0493  metallophosphoesterase  23.68 
 
 		 382 aa  84.7  0.000000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0494  exonuclease subunit SbcD  27.84 
 
 		 400 aa  84.3  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.413766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3542  exonuclease subunit SbcD  29.97 
 
 		 404 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.113465 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2506  exonuclease subunit SbcD  27.66 
 
 		 423 aa  84  0.000000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.947885  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2385  nuclease SbcCD, D subunit  27.11 
 
 		 388 aa  83.6  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000242417  hitchhiker  0.000411821 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1244  metallophosphoesterase  22.16 
 
 		 380 aa  83.2  0.000000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0425  exonuclease subunit SbcD  29.18 
 
 		 400 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0866  exonuclease subunit SbcD  26.16 
 
 		 401 aa  82.8  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0618709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2891  metallophosphoesterase  30.31 
 
 		 448 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2167  nuclease SbcCD subunit D  29.14 
 
 		 366 aa  82  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00346  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  29.18 
 
 		 400 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3211  nuclease SbcCD, D subunit  29.18 
 
 		 400 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.13705  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3235  exonuclease subunit SbcD  29.18 
 
 		 400 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.294623  hitchhiker  0.00000199407 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2302  metallophosphoesterase  27.18 
 
 		 421 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00350  hypothetical protein  29.18 
 
 		 400 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0473  exonuclease subunit SbcD  29.18 
 
 		 400 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.332797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0427  exonuclease subunit SbcD  29.18 
 
 		 400 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.429993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2312  metallophosphoesterase  31.63 
 
 		 513 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0466  exonuclease subunit SbcD  29.18 
 
 		 400 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.890943  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0317  exonuclease subunit SbcD  28.83 
 
 		 400 aa  81.3  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.639541  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0895  exonuclease subunit SbcD  31.27 
 
 		 425 aa  80.9  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2574  exodeoxyribonuclease I subunit D  29.54 
 
 		 390 aa  81.3  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5895  nuclease SbcCD, D subunit  25.52 
 
 		 408 aa  80.1  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000840952  normal  0.0299962 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1653  metallophosphoesterase  28.66 
 
 		 270 aa  80.1  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.337571  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1371  exodeoxyribonuclease I subunit D  25.85 
 
 		 416 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2916  nuclease SbcCD, D subunit  27.34 
 
 		 410 aa  79  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1921  metallophosphoesterase  26.86 
 
 		 421 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.666866 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3493  metallophosphoesterase  29.94 
 
 		 410 aa  78.2  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2356  exonuclease subunit SbcD  27.24 
 
 		 425 aa  78.6  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1302  exonuclease subunit SbcD  25.26 
 
 		 408 aa  78.6  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1920  exonuclease subunit SbcD  30.69 
 
 		 414 aa  77.8  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2306  nuclease SbcCD, D subunit  28.32 
 
 		 392 aa  77.4  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794517 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2457  nuclease SbcCD, D subunit  25.36 
 
 		 380 aa  77  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.529794  unclonable  0.00000337627 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2844  exonuclease SbcD, putative  29.68 
 
 		 399 aa  77  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2452  exonuclease subunit SbcD  26.67 
 
 		 442 aa  77  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2450  exodeoxyribonuclease I subunit D  29.79 
 
 		 400 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.982137  unclonable  0.000000000023362 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2849  exonuclease subunit SbcD  26.23 
 
 		 506 aa  76.3  0.0000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.482559  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1223  metallophosphoesterase  25.87 
 
 		 376 aa  76.3  0.0000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483275 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3107  nuclease SbcCD, D subunit  28.11 
 
 		 410 aa  76.3  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2520  exodeoxyribonuclease I subunit D  28.52 
 
 		 400 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0230667  unclonable  0.0000259601 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1007  exonuclease subunit SbcD  27.21 
 
 		 412 aa  75.1  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0348  nuclease SbcCD, D subunit  28.98 
 
 		 415 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1260  metallophosphoesterase  27.87 
 
 		 436 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00868935  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11540  exonuclease subunit SbcD  27.44 
 
 		 406 aa  75.5  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341615  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1483  metallophosphoesterase  26.57 
 
 		 375 aa  75.1  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0393867  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000032  exonuclease SbcD  26.91 
 
 		 377 aa  75.5  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.526134  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2145  nuclease SbcCD, D subunit  31.29 
 
 		 386 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0525294  normal  0.028692 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0304  nuclease SbcCD, D subunit  28.98 
 
 		 415 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.919689  normal  0.177579 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6452  nuclease SbcCD, D subunit  28.28 
 
 		 375 aa  74.3  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.230494  normal  0.0467767 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0380  nuclease SbcCD, D subunit  28.98 
 
 		 415 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.061787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1226  exodeoxyribonuclease I subunit D  27.44 
 
 		 418 aa  74.7  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0802336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05653  hypothetical protein  26.45 
 
 		 379 aa  74.7  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04020  Exodeoxyribonuclease I subunit D  26.86 
 
 		 435 aa  73.9  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0356343  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3138  exonuclease subunit SbcD  26.46 
 
 		 414 aa  73.6  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3288  exonuclease subunit SbcD  26.46 
 
 		 414 aa  73.6  0.000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.111868 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2612  exodeoxyribonuclease I subunit D  29.79 
 
 		 400 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.84718  decreased coverage  0.00000000344007 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3277  exonuclease subunit SbcD  26.46 
 
 		 414 aa  73.6  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.763472  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1575  metallophosphoesterase  28.32 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1093  putative exonuclease  26.3 
 
 		 434 aa  73.6  0.000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.144475  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1050  DNA repair exonuclease family protein  24.38 
 
 		 413 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.782479  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2636  exonuclease subunit SbcD  30.11 
 
 		 406 aa  73.2  0.000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0201368  normal  0.0691306 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0925  metallophosphoesterase  22.67 
 
 		 413 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1531  nuclease SbcCD, D subunit  27.03 
 
 		 381 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0738681  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0983  nuclease SbcCD subunit D  26.67 
 
 		 387 aa  72.8  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0794  metallophosphoesterase  22.09 
 
 		 413 aa  72  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0628  nuclease SbcCD, D subunit  27.08 
 
 		 385 aa  72  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.013566  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1676  nuclease SbcCD, D subunit  27.57 
 
 		 381 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106727  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4251  DNA repair exonuclease family protein  24.65 
 
 		 413 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236755 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0940  metallophosphoesterase  25.7 
 
 		 380 aa  72  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.282172  normal  0.704888 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>