More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1360 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1360  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
429 aa  868    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00110028  hitchhiker  0.000665614 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.44 
 
 
989 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.44 
 
 
989 aa  212  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3008  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.93 
 
 
953 aa  208  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0439  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40 
 
 
455 aa  196  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.444664 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0428  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.62 
 
 
455 aa  195  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2117  putative PAS/PAC sensor protein  38.49 
 
 
257 aa  188  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1725  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 
499 aa  181  2.9999999999999997e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3178  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.28 
 
 
426 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3003  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.8 
 
 
498 aa  177  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0985  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35 
 
 
704 aa  170  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000494124  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0883  response regulator receiver  37.74 
 
 
273 aa  168  1e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3510  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.51 
 
 
521 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.269968 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3669  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.81 
 
 
432 aa  159  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4326  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.22 
 
 
571 aa  159  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0434  putative PAS/PAC sensor protein  37.36 
 
 
458 aa  157  3e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1460  putative PAS/PAC sensor protein  34.95 
 
 
474 aa  156  7e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0048  putative PAS/PAC sensor protein  37.9 
 
 
255 aa  154  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1730  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.21 
 
 
591 aa  150  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.319599  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2645  putative PAS/PAC sensor protein  33.1 
 
 
336 aa  150  5e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1808  putative PAS/PAC sensor protein  44.19 
 
 
603 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.268482 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0895  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  43.02 
 
 
701 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1912  response regulator receiver protein  35.08 
 
 
263 aa  147  4.0000000000000006e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.181503  normal  0.732361 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0573  response regulator receiver protein  34.78 
 
 
261 aa  147  5e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.666159  normal  0.332219 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1311  putative PAS/PAC sensor protein  34.48 
 
 
340 aa  145  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.187179 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1358  putative PAS/PAC sensor protein  34.14 
 
 
404 aa  143  6e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.873442  normal  0.0258422 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3002  putative PAS/PAC sensor protein  35.85 
 
 
469 aa  143  7e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.345319  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1807  putative PAS/PAC sensor protein  35.62 
 
 
258 aa  141  3e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.254511 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1497  putative PAS/PAC sensor protein  38.42 
 
 
380 aa  139  7e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.506851  normal  0.137069 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.34 
 
 
701 aa  139  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.711392  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2637  putative PAS/PAC sensor protein  38.1 
 
 
461 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4564  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  50.78 
 
 
376 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.531352 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3039  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.51 
 
 
355 aa  133  5e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.610599  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0455  response regulator receiver domain-containing protein  37.14 
 
 
238 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.21261 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2686  putative PAS/PAC sensor protein  32 
 
 
337 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2407  response regulator receiver protein  50.83 
 
 
182 aa  130  3e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1242  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.85 
 
 
472 aa  130  6e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41521  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1114  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  47.06 
 
 
373 aa  129  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1813  response regulator receiver protein  42.66 
 
 
316 aa  126  7e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.445517  normal  0.445863 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2709  two component signal transduction response regulator  40.34 
 
 
429 aa  126  8.000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1724  response regulator receiver domain-containing protein  45.53 
 
 
352 aa  126  9e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1773  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  44.78 
 
 
386 aa  125  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3511  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.77 
 
 
384 aa  125  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.253652 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1557  response regulator receiver  46.4 
 
 
131 aa  124  4e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000412225  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0066  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  49.59 
 
 
377 aa  122  9e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.359193  normal  0.0132857 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2677  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  50.39 
 
 
636 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.068934 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  46.62 
 
 
359 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2337  signal transduction histidine kinase  47.46 
 
 
352 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4302  signal transduction histidine kinase  50.85 
 
 
343 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.219335  normal  0.321802 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0841  response regulator receiver  46.72 
 
 
135 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2285  response regulator receiver  42.52 
 
 
130 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000158247  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2639  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.26 
 
 
817 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3448  putative transcriptional regulator  44.17 
 
 
143 aa  114  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.132297  normal  0.0606491 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0118  putative PAS/PAC sensor protein  34.48 
 
 
265 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2510  transcriptional regulator  41.48 
 
 
157 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000843612  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1528  response regulator receiver protein  42.28 
 
 
450 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00374994  normal  0.77554 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2282  histidine kinase  46.27 
 
 
667 aa  110  5e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0834  response regulator receiver  43.22 
 
 
134 aa  107  3e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000017528  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1007  putative GAF sensor protein  41.43 
 
 
311 aa  105  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.164021  normal  0.860345 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3671  Sigma 54 interacting domain protein  42.19 
 
 
657 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1488  response regulator receiver protein  36.36 
 
 
450 aa  105  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.379239 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3896  two component transcriptional regulator, LytTR family  38.79 
 
 
245 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01100  sensory box/GGDEF family protein  32.96 
 
 
798 aa  100  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1380  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.82 
 
 
715 aa  99.8  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.923401  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1350  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.82 
 
 
715 aa  99.8  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1631  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.33 
 
 
561 aa  99.4  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.608678  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2336  response regulator receiver protein  40.5 
 
 
355 aa  99  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.404573  normal  0.642469 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2933  response regulator receiver and ANTAR domain protein  43.8 
 
 
194 aa  99  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0803562  normal  0.225953 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08681  transcriptional regulator  34.62 
 
 
240 aa  99  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.803849  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4853  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.6 
 
 
457 aa  97.8  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.231814  hitchhiker  0.00735887 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2294  response regulator receiver  44.44 
 
 
134 aa  95.5  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.371138  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05930  DNA-binding response regulator, LuxR family protein  40.16 
 
 
207 aa  95.5  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0900  response regulator receiver protein  40.35 
 
 
126 aa  95.9  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000110071 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1517  response regulator receiver protein  43.75 
 
 
127 aa  95.1  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.394491  normal  0.160821 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0115  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.72 
 
 
481 aa  94.7  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0268  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  35.46 
 
 
651 aa  94.7  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.62 
 
 
1559 aa  94.4  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4328  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 
612 aa  94.4  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1200  response regulator receiver domain-containing protein  43.86 
 
 
248 aa  94  5e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0783054  normal  0.0763711 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6068  response regulator receiver protein  39.83 
 
 
248 aa  92  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.42 
 
 
508 aa  91.7  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3548  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.53 
 
 
1007 aa  91.3  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.508984  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1648  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.51 
 
 
1176 aa  90.9  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.883005  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2052  putative PAS/PAC sensor protein  24.56 
 
 
414 aa  90.5  5e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.948346  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1348  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.13 
 
 
461 aa  90.1  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0616  two component transcriptional regulator  30.08 
 
 
249 aa  89.7  9e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2212  response regulator receiver protein  35.96 
 
 
122 aa  87.8  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.092497  normal  0.290386 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  28.95 
 
 
1427 aa  87  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3017  putative PAS/PAC sensor protein  36.77 
 
 
583 aa  86.7  8e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2085  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.65 
 
 
457 aa  86.3  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4327  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  35.14 
 
 
875 aa  85.1  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.184763 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0328  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.04 
 
 
951 aa  85.5  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.68 
 
 
1287 aa  85.5  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.62 
 
 
1426 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1374  putative PAS/PAC sensor protein  32.74 
 
 
408 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.71 
 
 
1415 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0634  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.97 
 
 
1000 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.932649  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3118  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  40.83 
 
 
196 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4307  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  34.51 
 
 
635 aa  84.7  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.056389 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2361  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.23 
 
 
196 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>