More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0301 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0301  beta-lactamase  100 
 
 
351 aa  706    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3117  beta-lactamase  49.4 
 
 
361 aa  306  5.0000000000000004e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.577011  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2362  beta-lactamase  50.9 
 
 
357 aa  301  8.000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  37.17 
 
 
574 aa  202  5e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  37.35 
 
 
966 aa  195  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1870  beta-lactamase  36.67 
 
 
390 aa  191  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  35.26 
 
 
793 aa  188  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  37.65 
 
 
428 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  37.65 
 
 
452 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2255  beta-lactamase  35.56 
 
 
379 aa  177  2e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.234898  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1790  beta-lactamase  35.35 
 
 
483 aa  176  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0797219 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  38.23 
 
 
582 aa  176  4e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0270  beta-lactamase  39.2 
 
 
717 aa  176  5e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0477  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  33.43 
 
 
385 aa  175  9.999999999999999e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.765713  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2426  beta-lactamase  36.2 
 
 
459 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00208801  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  36.65 
 
 
566 aa  169  9e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1740  beta-lactamase  34.74 
 
 
379 aa  167  2e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0714  beta-lactamase  36 
 
 
392 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1797  beta-lactamase  34.41 
 
 
391 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0148599  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0660  beta-lactamase  32.13 
 
 
395 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.775643  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1366  beta-lactamase  33.84 
 
 
591 aa  162  6e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.416084  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4206  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31 
 
 
1018 aa  162  7e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1697  beta-lactamase  33.73 
 
 
381 aa  161  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570462  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1874  beta-lactamase  32.04 
 
 
379 aa  159  5e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999528 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2113  beta-lactamase  30.64 
 
 
597 aa  158  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.226997 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2487  beta-lactamase  33.33 
 
 
408 aa  154  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4515  beta-lactamase  37.77 
 
 
369 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.942067 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2047  hypothetical protein  34.65 
 
 
395 aa  151  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0829987  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0495  beta-lactamase  32.99 
 
 
471 aa  152  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5693  beta-lactamase  37.04 
 
 
415 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21234  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1529  beta-lactamase  36.34 
 
 
381 aa  150  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.303701  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5392  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.56 
 
 
953 aa  150  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11048  putative hydrolase/beta lactamase fusion protein  26.98 
 
 
971 aa  149  7e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2687  beta-lactamase  36.34 
 
 
381 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000287138 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0954  Beta-lactamase  34.56 
 
 
416 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1715  beta-lactamase  30.33 
 
 
528 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102688  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1761  beta-lactamase  30.33 
 
 
528 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.775747  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4406  hypothetical protein  35.35 
 
 
796 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.343081  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4539  hypothetical protein  35.35 
 
 
796 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00469106 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2604  beta-lactamase  36.53 
 
 
354 aa  144  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.928872  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2616  beta-lactamase  34.66 
 
 
366 aa  144  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.763267 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0479  beta-lactamase  31.48 
 
 
603 aa  143  4e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000533746  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  34.74 
 
 
784 aa  142  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1664  beta-lactamase  35.73 
 
 
348 aa  142  8e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.15284 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0439  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  31.53 
 
 
381 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.737656  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4196  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.9 
 
 
1002 aa  141  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.690171 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5895  beta-lactamase  30.95 
 
 
496 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5870  hypothetical protein  35.94 
 
 
785 aa  139  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0383  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  35.9 
 
 
337 aa  137  3.0000000000000003e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1692  beta-lactamase  30.21 
 
 
531 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499627  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  36.04 
 
 
790 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0839  beta-lactamase  29 
 
 
1012 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2708  beta-lactamase  28.96 
 
 
992 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6218  hypothetical protein  35.62 
 
 
792 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2585  hypothetical protein  30.08 
 
 
433 aa  132  9e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3660  hypothetical protein  29.82 
 
 
434 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2566  hypothetical protein  29.55 
 
 
434 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4160  hypothetical protein  31.2 
 
 
818 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000766166  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2716  hypothetical protein  29.55 
 
 
434 aa  129  8.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1249  hypothetical protein  29.29 
 
 
434 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.303061 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1231  beta-lactamase  29.02 
 
 
434 aa  126  6e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4819  glycoside hydrolase family 3 protein  28.85 
 
 
997 aa  125  8.000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0444  beta-lactamase  29.87 
 
 
339 aa  124  2e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  26.01 
 
 
990 aa  122  8e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1201  beta-lactamase  27.16 
 
 
665 aa  122  9.999999999999999e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1251  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  28.71 
 
 
377 aa  122  9.999999999999999e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000000135632  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1543  beta-lactamase  25.47 
 
 
651 aa  120  3e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1483  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.8 
 
 
976 aa  119  7.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.430226  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3257  beta-lactamase  31.09 
 
 
430 aa  118  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2361  beta-lactamase  31.01 
 
 
401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597204  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2408  beta-lactamase  31.01 
 
 
401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.234051  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1238  beta-lactamase  28.25 
 
 
361 aa  117  3e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2402  beta-lactamase  31.01 
 
 
401 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2622  hypothetical protein  27.87 
 
 
432 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0591  beta-lactamase  33.04 
 
 
360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000780172  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0439  beta-lactamase  33.07 
 
 
397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0784108 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2711  hypothetical protein  28.16 
 
 
432 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.27035  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2671  hypothetical protein  27.87 
 
 
432 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2844  hypothetical protein  27.87 
 
 
432 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4807  beta-lactamase  26.17 
 
 
434 aa  113  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2737  hypothetical protein  27.3 
 
 
432 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0547  beta-lactamase  29.58 
 
 
375 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.727644  normal  0.917223 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1850  Beta-lactamase class C or other penicillin binding protein  26.51 
 
 
338 aa  110  3e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000532294  hitchhiker  0.000116253 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2095  hypothetical protein  26.45 
 
 
484 aa  107  3e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.187143  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0471  beta-lactamase  26.65 
 
 
336 aa  106  5e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1439  hypothetical protein  25.13 
 
 
1007 aa  106  7e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00938781 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4601  beta-lactamase  32.67 
 
 
427 aa  106  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.850083  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2506  beta-lactamase  34.64 
 
 
344 aa  105  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0011  glycosy hydrolase family protein  33.51 
 
 
1003 aa  105  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.417282 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3459  beta-lactamase  29.55 
 
 
394 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0213623 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  27.91 
 
 
447 aa  103  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3749  beta-lactamase  29.05 
 
 
401 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0280744 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  29.57 
 
 
595 aa  102  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2194  beta-lactamase  30.42 
 
 
334 aa  102  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.724545  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4038  beta-lactamase  34.12 
 
 
374 aa  101  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2658  beta-lactamase  29.33 
 
 
401 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2189  beta-lactamase  29.86 
 
 
402 aa  99  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11398  hypothetical protein  28.37 
 
 
401 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  30.91 
 
 
461 aa  98.2  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1130  beta-lactamase  30.18 
 
 
355 aa  97.4  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>